Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G088300.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QA22
Pfam -
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF521
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02610.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G340200 - -
2 Sobic.007G028300 - -
3 Sobic.002G025200 - -
4 Sobic.005G166200 MTN26L5 - MtN26 family protein precursor, expressed -
5 Sobic.009G131032 - -
6 Sobic.002G419550 - -
7 Sobic.006G206600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tyrosine phosphatase, putative, expressed -
8 Sobic.001G201933 - -
9 Sobic.001G397550 - -
10 Sobic.003G271100 expressed protein -
11 Sobic.004G078200 - -
12 Sobic.001G175200 expressed protein -
13 Sobic.001G509901 - -
14 Sobic.006G100150 - -
15 Sobic.001G038050 - -
16 Sobic.004G303900 - -
17 Sobic.001G490350 - -
18 Sobic.004G061100 - -
19 Sobic.006G241500 - -
20 Sobic.004G199100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G088300 Sobic002G088300 Sobic003G340200 Sobic003G340200 Sobic002G088300--Sobic003G340200 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic002G088300--Sobic007G028300 Sobic002G025200 Sobic002G025200 Sobic002G088300--Sobic002G025200 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic002G088300--Sobic005G166200 Sobic009G131032 Sobic009G131032 Sobic002G088300--Sobic009G131032 Sobic002G419550 Sobic002G419550 Sobic002G088300--Sobic002G419550 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic002G088300--Sobic006G206600 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic002G088300--Sobic001G201933 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic002G088300--Sobic001G397550 Sobic003G340200--Sobic002G088300 Sobic003G340200--Sobic002G025200 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic003G340200--Sobic001G509901 Sobic003G340200--Sobic005G166200 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic003G340200--Sobic004G061100 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic003G340200--Sobic001G175200 Sobic005G198150 Sobic005G198150 Sobic003G340200--Sobic005G198150 Sobic010G228800 Sobic010G228800 Sobic003G340200--Sobic010G228800 Sobic003G340200--Sobic002G419550 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic007G028300--Sobic004G078200 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic007G028300--Sobic006G100150 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic007G028300--Sobic004G303900 Sobic007G028300--Sobic001G397550 Sobic007G028300--Sobic006G206600 Sobic007G028300--Sobic002G088300 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic007G028300--Sobic004G224733 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic007G028300--Sobic003G169700 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic007G028300--Sobic006G219400 Sobic002G025200--Sobic002G419550 Sobic001G038050 Sobic001G038050 Sobic002G025200--Sobic001G038050 Sobic002G025200--Sobic005G166200 Sobic002G025200--Sobic002G088300 Sobic002G025200--Sobic003G340200 Sobic002G025200--Sobic001G509901 Sobic002G314100 Sobic002G314100 Sobic002G025200--Sobic002G314100 Sobic004G193100 Sobic004G193100 Sobic002G025200--Sobic004G193100 Sobic002G025200--Sobic004G061100 Sobic005G166200--Sobic001G509901 Sobic005G166200--Sobic002G025200 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic005G166200--Sobic004G199100 Sobic005G166200--Sobic002G088300 Sobic005G166200--Sobic009G131032 Sobic005G166200--Sobic003G340200 Sobic003G143600 Sobic003G143600 Sobic005G166200--Sobic003G143600 Sobic008G123700 Sobic008G123700 Sobic005G166200--Sobic008G123700 Sobic005G166200--Sobic004G061100 Sobic001G490350 Sobic001G490350 Sobic009G131032--Sobic001G490350 Sobic009G131032--Sobic005G166200 Sobic009G131032--Sobic002G088300 Sobic003G271100 Sobic003G271100 Sobic009G131032--Sobic003G271100 Sobic010G203400 Sobic010G203400 Sobic009G131032--Sobic010G203400 Sobic006G025066 Sobic006G025066 Sobic009G131032--Sobic006G025066 Sobic004G252250 Sobic004G252250 Sobic009G131032--Sobic004G252250 Sobic009G131032--Sobic004G199100 Sobic001G505033 Sobic001G505033 Sobic009G131032--Sobic001G505033 Sobic002G419550--Sobic002G025200 Sobic002G419550--Sobic001G038050 Sobic002G419550--Sobic002G088300 Sobic002G419550--Sobic002G314100 Sobic002G419550--Sobic004G193100 Sobic004G073300 Sobic004G073300 Sobic002G419550--Sobic004G073300 Sobic002G419550--Sobic003G340200 Sobic002G419550--Sobic006G206600 Sobic010G091250 Sobic010G091250 Sobic002G419550--Sobic010G091250 Sobic006G206600--Sobic007G028300 Sobic006G206600--Sobic006G100150 Sobic006G206600--Sobic004G078200 Sobic006G206600--Sobic004G303900 Sobic009G218700 Sobic009G218700 Sobic006G206600--Sobic009G218700 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic006G206600--Sobic006G135701 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic006G206600--Sobic001G118050 Sobic006G206600--Sobic002G088300 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic006G206600--Sobic007G113566 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic001G201933--Sobic010G002301 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic001G201933--Sobic003G139600 Sobic002G191900 Sobic002G191900 Sobic001G201933--Sobic002G191900 Sobic001G201933--Sobic007G113566 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic001G201933--Sobic001G465600 Sobic004G162100 Sobic004G162100 Sobic001G201933--Sobic004G162100 Sobic001G201933--Sobic004G078200 Sobic001G201933--Sobic006G219400 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic001G201933--Sobic004G157050 Sobic001G397550--Sobic004G224733 Sobic001G397550--Sobic007G028300 Sobic003G327950 Sobic003G327950 Sobic001G397550--Sobic003G327950 Sobic001G397550--Sobic004G078200 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic001G397550--Sobic004G332200 Sobic001G397550--Sobic004G303900 Sobic001G397550--Sobic006G100150 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic001G397550--Sobic003G163000 Sobic001G397550--Sobic004G199100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.