Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G206600.3,Sobic.006G206600.5,Sobic.006G206600.4,Sobic.006G206600.1
Synonym Sb06g027750
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
tyrosine phosphatase, putative, expressed
UniProt A0A1B6PN25
Pfam PF01981
Panther DB PTHR11717 PTHR11717:SF2
NCBI CDD KOG3305; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0004045; aminoacyl-tRNA hydrolase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G10700 : Peptidyl-tRNA hydrolase II (PTH2) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g51570.1 : tyrosine phosphatase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009901
Brachypodium PNT61799 , KQJ84435
Barley HORVU2Hr1G101070.1 , HORVU0Hr1G005420.2 , HORVU0Hr1G005420.1
Wheat TraesCS2B02G454200 , TraesCS2D02G430900 , TraesCS2A02G432900
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G028300 - -
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18 Sobic.003G139600 expressed protein -
19 Sobic.004G207800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.006G263250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic006G206600--Sobic007G028300 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic006G206600--Sobic006G100150 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic006G206600--Sobic004G078200 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic006G206600--Sobic004G303900 Sobic009G218700 Sobic009G218700 Sobic006G206600--Sobic009G218700 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic006G206600--Sobic006G135701 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic006G206600--Sobic001G118050 Sobic002G088300 Sobic002G088300 Sobic006G206600--Sobic002G088300 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic006G206600--Sobic007G113566 Sobic007G028300--Sobic004G078200 Sobic007G028300--Sobic006G100150 Sobic007G028300--Sobic004G303900 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic007G028300--Sobic001G397550 Sobic007G028300--Sobic006G206600 Sobic007G028300--Sobic002G088300 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic007G028300--Sobic004G224733 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic007G028300--Sobic003G169700 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic007G028300--Sobic006G219400 Sobic006G100150--Sobic004G303900 Sobic006G100150--Sobic004G078200 Sobic006G100150--Sobic007G028300 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic006G100150--Sobic009G260550 Sobic004G252600 Sobic004G252600 Sobic006G100150--Sobic004G252600 Sobic006G100150--Sobic003G169700 Sobic006G100150--Sobic001G118050 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic006G100150--Sobic004G207800 Sobic006G100150--Sobic006G206600 Sobic004G078200--Sobic007G028300 Sobic004G078200--Sobic006G100150 Sobic004G078200--Sobic004G303900 Sobic004G078200--Sobic004G207800 Sobic004G078200--Sobic006G219400 Sobic005G028500 Sobic005G028500 Sobic004G078200--Sobic005G028500 Sobic004G078200--Sobic007G113566 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic004G078200--Sobic003G139600 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic004G078200--Sobic001G331650 Sobic004G303900--Sobic006G100150 Sobic004G303900--Sobic007G028300 Sobic004G303900--Sobic004G078200 Sobic004G303900--Sobic009G260550 Sobic004G303900--Sobic003G169700 Sobic004G303900--Sobic004G252600 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic004G303900--Sobic003G163000 Sobic004G303900--Sobic006G206600 Sobic004G303900--Sobic004G207800 Sobic009G218700--Sobic006G206600 Sobic009G218700--Sobic003G169700 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic009G218700--Sobic002G220400 Sobic009G218700--Sobic006G100150 Sobic009G218700--Sobic004G303900 Sobic009G218700--Sobic009G260550 Sobic002G198900 Sobic002G198900 Sobic009G218700--Sobic002G198900 Sobic009G218700--Sobic007G028300 Sobic003G169800 Sobic003G169800 Sobic009G218700--Sobic003G169800 Sobic006G135701--Sobic001G118050 Sobic006G135701--Sobic007G113566 Sobic006G135701--Sobic002G220400 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic006G135701--Sobic004G019550 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic006G135701--Sobic001G476800 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic006G135701--Sobic001G154000 Sobic006G135701--Sobic004G252600 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic006G135701--Sobic010G175550 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic006G135701--Sobic008G171200 Sobic001G118050--Sobic006G135701 Sobic001G118050--Sobic007G113566 Sobic001G118050--Sobic002G220400 Sobic001G118050--Sobic004G252600 Sobic001G118050--Sobic001G476800 Sobic001G118050--Sobic004G019550 Sobic001G118050--Sobic006G100150 Sobic001G118050--Sobic010G175550 Sobic001G118050--Sobic001G154000 Sobic003G340200 Sobic003G340200 Sobic002G088300--Sobic003G340200 Sobic002G088300--Sobic007G028300 Sobic002G025200 Sobic002G025200 Sobic002G088300--Sobic002G025200 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic002G088300--Sobic005G166200 Sobic009G131032 Sobic009G131032 Sobic002G088300--Sobic009G131032 Sobic002G419550 Sobic002G419550 Sobic002G088300--Sobic002G419550 Sobic002G088300--Sobic006G206600 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic002G088300--Sobic001G201933 Sobic002G088300--Sobic001G397550 Sobic007G113566--Sobic001G118050 Sobic007G113566--Sobic008G171200 Sobic007G113566--Sobic006G135701 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic007G113566--Sobic004G157050 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic007G113566--Sobic010G002301 Sobic007G113566--Sobic004G207800 Sobic007G113566--Sobic001G476800 Sobic007G113566--Sobic003G139600 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic007G113566--Sobic001G465600
Octagon: transcription factors


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