Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G218700.1
Synonym Sb09g027340
Functional annotation pentatricopeptide, putative, expressed
UniProt C5YUY5
Pfam PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF227
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G07740 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g47510.1 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036509
Brachypodium KQK05060
Barley HORVU1Hr1G078400.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G206600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tyrosine phosphatase, putative, expressed -
2 Sobic.003G169700 - -
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16 Sobic.004G252600 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G118050 - -
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19 Sobic.002G337400 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
20 Sobic.006G135701 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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