Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G169700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q3T1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G093400 - -
2 Sobic.009G260550 - -
3 Sobic.001G420150 - -
4 Sobic.007G116300 - -
5 Sobic.004G303900 - -
6 Sobic.006G100150 - -
7 Sobic.003G208200 - -
8 Sobic.004G276600 expressed protein -
9 Sobic.007G085400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G351501 - -
11 Sobic.002G337400 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
12 Sobic.006G261650 - -
13 Sobic.003G163000 - -
14 Sobic.003G169800 - -
15 Sobic.001G136850 - -
16 Sobic.001G202450 - -
17 Sobic.001G413300 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
18 Sobic.004G332200 - -
19 Sobic.001G373850 - -
20 Sobic.001G423200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic003G169700--Sobic001G093400 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic003G169700--Sobic009G260550 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic003G169700--Sobic001G420150 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic003G169700--Sobic007G116300 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic003G169700--Sobic004G303900 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic003G169700--Sobic006G100150 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic003G169700--Sobic003G208200 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic003G169700--Sobic004G276600 Sobic007G085400 Sobic007G085400 Sobic003G169700--Sobic007G085400 Sobic001G093400--Sobic007G116300 Sobic001G093400--Sobic001G420150 Sobic001G093400--Sobic009G260550 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic001G093400--Sobic009G257000 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic001G093400--Sobic001G255866 Sobic001G093400--Sobic003G169700 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic001G093400--Sobic007G090433 Sobic001G093400--Sobic004G276600 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic001G093400--Sobic001G423200 Sobic009G260550--Sobic001G093400 Sobic009G260550--Sobic003G169700 Sobic009G260550--Sobic007G116300 Sobic004G252600 Sobic004G252600 Sobic009G260550--Sobic004G252600 Sobic009G260550--Sobic006G100150 Sobic009G260550--Sobic004G303900 Sobic009G260550--Sobic001G420150 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic009G260550--Sobic001G136850 Sobic009G260550--Sobic009G257000 Sobic001G420150--Sobic007G116300 Sobic001G420150--Sobic001G093400 Sobic001G420150--Sobic004G276600 Sobic001G420150--Sobic001G423200 Sobic001G420150--Sobic001G255866 Sobic001G420150--Sobic007G090433 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic001G420150--Sobic004G129400 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic001G420150--Sobic004G133201 Sobic001G420150--Sobic003G169700 Sobic007G116300--Sobic001G420150 Sobic007G116300--Sobic001G093400 Sobic007G116300--Sobic001G255866 Sobic007G116300--Sobic007G090433 Sobic007G116300--Sobic001G423200 Sobic007G116300--Sobic004G276600 Sobic007G116300--Sobic009G260550 Sobic007G116300--Sobic004G129400 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic007G116300--Sobic006G059150 Sobic004G303900--Sobic006G100150 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic004G303900--Sobic007G028300 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic004G303900--Sobic004G078200 Sobic004G303900--Sobic009G260550 Sobic004G303900--Sobic003G169700 Sobic004G303900--Sobic004G252600 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic004G303900--Sobic003G163000 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic004G303900--Sobic006G206600 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic004G303900--Sobic004G207800 Sobic006G100150--Sobic004G303900 Sobic006G100150--Sobic004G078200 Sobic006G100150--Sobic007G028300 Sobic006G100150--Sobic009G260550 Sobic006G100150--Sobic004G252600 Sobic006G100150--Sobic003G169700 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic006G100150--Sobic001G118050 Sobic006G100150--Sobic004G207800 Sobic006G100150--Sobic006G206600 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic003G208200--Sobic001G373850 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic003G208200--Sobic003G161900 Sobic003G351501 Sobic003G351501 Sobic003G208200--Sobic003G351501 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic003G208200--Sobic001G261444 Sobic001G413300 Sobic001G413300 Sobic003G208200--Sobic001G413300 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic003G208200--Sobic001G202450 Sobic003G208200--Sobic001G093400 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic003G208200--Sobic008G100201 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic003G208200--Sobic004G115100 Sobic004G276600--Sobic001G420150 Sobic004G276600--Sobic007G090433 Sobic004G276600--Sobic007G116300 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic004G276600--Sobic005G154600 Sobic004G276600--Sobic001G093400 Sobic004G276600--Sobic001G255866 Sobic004G276600--Sobic004G133201 Sobic004G276600--Sobic001G423200 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic004G276600--Sobic006G261650 Sobic007G085400--Sobic001G093400 Sobic007G085400--Sobic001G420150 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic007G085400--Sobic004G134400 Sobic007G085400--Sobic004G276600 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic007G085400--Sobic008G093300 Sobic007G085400--Sobic003G169700 Sobic007G085400--Sobic004G133201 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic007G085400--Sobic004G274300 Sobic002G337400 Sobic002G337400 Sobic007G085400--Sobic002G337400
Octagon: transcription factors


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