Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G332200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YTW0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052283
Brachypodium KQK01077 , PNT73884 , PNT73885 , PNT73880 , KQJ97674 , PNT78263
Barley HORVU7Hr1G092270.1 , HORVU5Hr1G114010.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G276600 expressed protein -
2 Sobic.001G420150 - -
3 Sobic.004G224733 - -
4 Sobic.007G090433 - -
5 Sobic.001G202450 - -
6 Sobic.002G214000 protein Kinase, putative, expressed -
7 Sobic.001G423200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
8 Sobic.003G163000 - -
9 Sobic.005G154600 - -
10 Sobic.001G093400 - -
11 Sobic.001G255866 - -
12 Sobic.007G116300 - -
13 Sobic.006G107700 OsMADS27 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
14 Sobic.003G169700 - -
15 Sobic.005G045250 - -
16 Sobic.007G190600 - -
17 Sobic.007G190466 - -
18 Sobic.K031900 - -
19 Sobic.001G397550 - -
20 Sobic.010G132400 Os6bglu24 - beta-glucosidase homologue, similar to G. max isohydroxyurate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase


Gene co-expression network
sample Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic004G332200--Sobic004G276600 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic004G332200--Sobic001G420150 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic004G332200--Sobic004G224733 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic004G332200--Sobic007G090433 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic004G332200--Sobic001G202450 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G332200--Sobic002G214000 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic004G332200--Sobic001G423200 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic004G332200--Sobic003G163000 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic004G332200--Sobic005G154600 Sobic004G276600--Sobic001G420150 Sobic004G276600--Sobic007G090433 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic004G276600--Sobic007G116300 Sobic004G276600--Sobic005G154600 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic004G276600--Sobic001G093400 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic004G276600--Sobic001G255866 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G276600--Sobic004G133201 Sobic004G276600--Sobic001G423200 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic004G276600--Sobic006G261650 Sobic001G420150--Sobic007G116300 Sobic001G420150--Sobic001G093400 Sobic001G420150--Sobic004G276600 Sobic001G420150--Sobic001G423200 Sobic001G420150--Sobic001G255866 Sobic001G420150--Sobic007G090433 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic001G420150--Sobic004G129400 Sobic001G420150--Sobic004G133201 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic001G420150--Sobic003G169700 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic004G224733--Sobic001G397550 Sobic004G224733--Sobic004G332200 Sobic003G327950 Sobic003G327950 Sobic004G224733--Sobic003G327950 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic004G224733--Sobic006G219400 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic004G224733--Sobic007G028300 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic004G224733--Sobic004G078200 Sobic004G282966 Sobic004G282966 Sobic004G224733--Sobic004G282966 Sobic006G074600 Sobic006G074600 Sobic004G224733--Sobic006G074600 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic004G224733--Sobic003G139600 Sobic007G090433--Sobic001G255866 Sobic007G090433--Sobic007G116300 Sobic007G090433--Sobic004G276600 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic007G090433--Sobic009G257000 Sobic007G090433--Sobic001G420150 Sobic007G090433--Sobic001G093400 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic007G090433--Sobic003G394701 Sobic007G090433--Sobic001G423200 Sobic007G090433--Sobic004G133201 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic001G202450--Sobic001G373850 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic001G202450--Sobic009G077000 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic001G202450--Sobic005G045250 Sobic001G202450--Sobic002G214000 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic001G202450--Sobic005G019250 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic001G202450--Sobic009G210250 Sobic001G202450--Sobic003G163000 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic001G202450--Sobic003G208200 Sobic001G202450--Sobic004G332200 Sobic002G214000--Sobic001G373850 Sobic002G214000--Sobic009G077000 Sobic002G214000--Sobic001G202450 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic002G214000--Sobic004G310350 SobicK031900 SobicK031900 Sobic002G214000--SobicK031900 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic002G214000--Sobic008G100201 Sobic007G200700 Sobic007G200700 Sobic002G214000--Sobic007G200700 Sobic002G214000--Sobic005G019250 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic002G214000--Sobic010G219200 Sobic001G423200--Sobic001G420150 Sobic001G423200--Sobic001G255866 Sobic001G423200--Sobic007G116300 Sobic001G423200--Sobic007G090433 Sobic001G423200--Sobic001G093400 Sobic001G423200--Sobic004G276600 Sobic001G423200--Sobic004G129400 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic001G423200--Sobic006G035350 Sobic001G423200--Sobic009G257000 Sobic003G163000--Sobic001G202450 Sobic003G163000--Sobic002G214000 Sobic003G163000--Sobic001G373850 Sobic003G163000--Sobic003G169700 Sobic003G163000--Sobic004G332200 Sobic001G422432 Sobic001G422432 Sobic003G163000--Sobic001G422432 Sobic003G163000--Sobic005G045250 Sobic003G163000--Sobic004G276600 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic003G163000--Sobic004G303900 Sobic005G154600--Sobic006G261650 Sobic005G154600--Sobic004G276600 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic005G154600--Sobic002G154450 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic005G154600--Sobic010G247750 Sobic005G154600--Sobic004G310350 Sobic005G154600--Sobic006G035350 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic005G154600--Sobic008G093300 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic005G154600--Sobic010G132400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic005G154600--Sobic007G127200
Octagon: transcription factors


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