Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G224733.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RPP5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G397550 - -
2 Sobic.004G332200 - -
3 Sobic.003G327950 - -
4 Sobic.006G219400 - -
5 Sobic.007G028300 - -
6 Sobic.004G078200 - -
7 Sobic.004G282966 - -
8 Sobic.006G074600 E2F family transcription factor protein, putative, expressed K06620: transcription factor E2F3
9 Sobic.003G139600 expressed protein -
10 Sobic.003G163000 - -
11 Sobic.006G100150 - -
12 Sobic.004G303900 - -
13 Sobic.007G190600 - -
14 Sobic.005G045250 - -
15 Sobic.007G190466 - -
16 Sobic.004G207800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
17 Sobic.004G276600 expressed protein -
18 Sobic.001G420150 - -
19 Sobic.003G169700 - -
20 Sobic.001G465600 AMP-binding domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic004G224733--Sobic001G397550 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic004G224733--Sobic004G332200 Sobic003G327950 Sobic003G327950 Sobic004G224733--Sobic003G327950 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic004G224733--Sobic006G219400 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic004G224733--Sobic007G028300 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic004G224733--Sobic004G078200 Sobic004G282966 Sobic004G282966 Sobic004G224733--Sobic004G282966 Sobic006G074600 Sobic006G074600 Sobic004G224733--Sobic006G074600 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic004G224733--Sobic003G139600 Sobic001G397550--Sobic004G224733 Sobic001G397550--Sobic007G028300 Sobic001G397550--Sobic003G327950 Sobic001G397550--Sobic004G078200 Sobic001G397550--Sobic004G332200 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic001G397550--Sobic004G303900 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic001G397550--Sobic006G100150 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic001G397550--Sobic003G163000 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic001G397550--Sobic004G199100 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic004G332200--Sobic004G276600 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic004G332200--Sobic001G420150 Sobic004G332200--Sobic004G224733 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic004G332200--Sobic007G090433 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic004G332200--Sobic001G202450 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G332200--Sobic002G214000 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic004G332200--Sobic001G423200 Sobic004G332200--Sobic003G163000 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic004G332200--Sobic005G154600 Sobic003G327950--Sobic001G397550 Sobic003G327950--Sobic004G224733 Sobic003G327950--Sobic007G028300 Sobic003G327950--Sobic003G163000 Sobic003G327950--Sobic004G332200 Sobic003G327950--Sobic004G199100 Sobic010G203400 Sobic010G203400 Sobic003G327950--Sobic010G203400 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic003G327950--Sobic005G045250 Sobic003G327950--Sobic006G219400 Sobic006G219400--Sobic004G078200 Sobic005G028500 Sobic005G028500 Sobic006G219400--Sobic005G028500 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic006G219400--Sobic001G465600 Sobic002G191900 Sobic002G191900 Sobic006G219400--Sobic002G191900 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic006G219400--Sobic001G331650 Sobic006G219400--Sobic004G224733 Sobic006G219400--Sobic003G139600 Sobic003G271100 Sobic003G271100 Sobic006G219400--Sobic003G271100 Sobic006G219400--Sobic006G074600 Sobic007G028300--Sobic004G078200 Sobic007G028300--Sobic006G100150 Sobic007G028300--Sobic004G303900 Sobic007G028300--Sobic001G397550 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic007G028300--Sobic006G206600 Sobic002G088300 Sobic002G088300 Sobic007G028300--Sobic002G088300 Sobic007G028300--Sobic004G224733 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic007G028300--Sobic003G169700 Sobic007G028300--Sobic006G219400 Sobic004G078200--Sobic007G028300 Sobic004G078200--Sobic006G100150 Sobic004G078200--Sobic004G303900 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic004G078200--Sobic004G207800 Sobic004G078200--Sobic006G219400 Sobic004G078200--Sobic005G028500 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic004G078200--Sobic007G113566 Sobic004G078200--Sobic003G139600 Sobic004G078200--Sobic001G331650 Sobic004G282966--Sobic003G139600 Sobic001G395600 Sobic001G395600 Sobic004G282966--Sobic001G395600 Sobic004G282966--Sobic001G465600 Sobic003G147800 Sobic003G147800 Sobic004G282966--Sobic003G147800 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic004G282966--Sobic003G244250 Sobic004G282966--Sobic004G332200 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic004G282966--Sobic010G002301 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic004G282966--Sobic010G176000 Sobic004G282966--Sobic004G224733 Sobic006G074600--Sobic006G219400 Sobic006G074600--Sobic004G078200 Sobic006G074600--Sobic004G224733 Sobic006G074600--Sobic001G331650 Sobic006G074600--Sobic004G207800 Sobic003G233266 Sobic003G233266 Sobic006G074600--Sobic003G233266 Sobic006G074600--Sobic007G028300 Sobic006G074600--Sobic001G397550 Sobic006G074600--Sobic005G028500 Sobic003G139600--Sobic010G002301 Sobic003G139600--Sobic001G465600 Sobic003G139600--Sobic004G282966 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic003G139600--Sobic001G201933 Sobic003G139600--Sobic007G113566 Sobic003G139600--Sobic004G207800 Sobic003G139600--Sobic001G395600 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic003G139600--Sobic004G157050 Sobic003G139600--Sobic001G331650
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.