Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G465600.1
Synonym AT4CL1, 4CL.1, 4CL1, Sb01g043680
Functional annotation AMP-binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QPU6
Pfam -
Panther DB PTHR24096 PTHR24096:SF217
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G51680 : 4-coumarate:CoA ligase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g14760.1 : AMP-binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.002G274300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic001G465600--Sobic010G002301 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic001G465600--Sobic003G139600 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic001G465600--Sobic001G331650 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic001G465600--Sobic004G157050 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic001G465600--Sobic004G207800 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic001G465600--Sobic007G113566 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic001G465600--Sobic006G219400 Sobic002G191900 Sobic002G191900 Sobic001G465600--Sobic002G191900 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic001G465600--Sobic001G201933 Sobic010G002301--Sobic003G139600 Sobic010G002301--Sobic001G465600 Sobic010G002301--Sobic001G201933 Sobic010G002301--Sobic004G157050 Sobic010G002301--Sobic007G113566 Sobic010G002301--Sobic002G191900 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic010G002301--Sobic008G171200 Sobic010G002301--Sobic001G331650 Sobic010G002301--Sobic004G207800 Sobic003G139600--Sobic010G002301 Sobic003G139600--Sobic001G465600 Sobic004G282966 Sobic004G282966 Sobic003G139600--Sobic004G282966 Sobic003G139600--Sobic001G201933 Sobic003G139600--Sobic007G113566 Sobic003G139600--Sobic004G207800 Sobic001G395600 Sobic001G395600 Sobic003G139600--Sobic001G395600 Sobic003G139600--Sobic004G157050 Sobic003G139600--Sobic001G331650 Sobic001G331650--Sobic004G207800 Sobic003G233266 Sobic003G233266 Sobic001G331650--Sobic003G233266 Sobic001G331650--Sobic001G465600 Sobic001G331650--Sobic008G171200 Sobic001G331650--Sobic007G113566 Sobic001G331650--Sobic004G157050 Sobic001G331650--Sobic010G002301 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic001G331650--Sobic007G065000 Sobic001G331650--Sobic003G139600 Sobic004G157050--Sobic008G171200 Sobic004G157050--Sobic007G113566 Sobic004G157050--Sobic010G002301 Sobic004G157050--Sobic001G465600 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic004G157050--Sobic003G160433 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic004G157050--Sobic001G476800 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic004G157050--Sobic001G128000 Sobic004G157050--Sobic001G331650 Sobic010G267300 Sobic010G267300 Sobic004G157050--Sobic010G267300 Sobic004G207800--Sobic001G331650 Sobic004G207800--Sobic008G171200 Sobic004G207800--Sobic007G113566 Sobic004G207800--Sobic001G476800 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic004G207800--Sobic004G078200 Sobic004G207800--Sobic001G465600 Sobic004G207800--Sobic003G139600 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic004G207800--Sobic006G100150 Sobic004G207800--Sobic003G233266 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic007G113566--Sobic001G118050 Sobic007G113566--Sobic008G171200 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic007G113566--Sobic006G135701 Sobic007G113566--Sobic004G157050 Sobic007G113566--Sobic010G002301 Sobic007G113566--Sobic004G207800 Sobic007G113566--Sobic001G476800 Sobic007G113566--Sobic003G139600 Sobic007G113566--Sobic001G465600 Sobic006G219400--Sobic004G078200 Sobic005G028500 Sobic005G028500 Sobic006G219400--Sobic005G028500 Sobic006G219400--Sobic001G465600 Sobic006G219400--Sobic002G191900 Sobic006G219400--Sobic001G331650 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic006G219400--Sobic004G224733 Sobic006G219400--Sobic003G139600 Sobic003G271100 Sobic003G271100 Sobic006G219400--Sobic003G271100 Sobic006G074600 Sobic006G074600 Sobic006G219400--Sobic006G074600 Sobic002G191900--Sobic001G201933 Sobic002G191900--Sobic010G002301 Sobic002G191900--Sobic001G465600 Sobic002G191900--Sobic006G219400 Sobic002G191900--Sobic003G139600 Sobic002G191900--Sobic005G028500 Sobic002G191900--Sobic003G271100 Sobic002G191900--Sobic007G113566 Sobic002G191900--Sobic004G157050 Sobic001G201933--Sobic010G002301 Sobic001G201933--Sobic003G139600 Sobic001G201933--Sobic002G191900 Sobic001G201933--Sobic007G113566 Sobic001G201933--Sobic001G465600 Sobic004G162100 Sobic004G162100 Sobic001G201933--Sobic004G162100 Sobic001G201933--Sobic004G078200 Sobic001G201933--Sobic006G219400 Sobic001G201933--Sobic004G157050
Octagon: transcription factors


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