Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G028500.1
Synonym Sb05g002390, ANAC050, NAC050
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RGL6
Pfam PF02365
Panther DB PTHR31989 PTHR31989:SF43
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G10480 : NAC domain containing protein 50
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g04230.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3D02G535500 , TraesCS3B02G599900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.007G085900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G028500 Sobic005G028500 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic005G028500--Sobic004G078200 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic005G028500--Sobic006G219400 Sobic003G271100 Sobic003G271100 Sobic005G028500--Sobic003G271100 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic005G028500--Sobic009G192200 Sobic009G255000 Sobic009G255000 Sobic005G028500--Sobic009G255000 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic005G028500--Sobic007G113566 Sobic002G191900 Sobic002G191900 Sobic005G028500--Sobic002G191900 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic005G028500--Sobic001G465600 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic005G028500--Sobic010G002301 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic004G078200--Sobic007G028300 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic004G078200--Sobic006G100150 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic004G078200--Sobic004G303900 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic004G078200--Sobic004G207800 Sobic004G078200--Sobic006G219400 Sobic004G078200--Sobic005G028500 Sobic004G078200--Sobic007G113566 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic004G078200--Sobic003G139600 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic004G078200--Sobic001G331650 Sobic006G219400--Sobic004G078200 Sobic006G219400--Sobic005G028500 Sobic006G219400--Sobic001G465600 Sobic006G219400--Sobic002G191900 Sobic006G219400--Sobic001G331650 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic006G219400--Sobic004G224733 Sobic006G219400--Sobic003G139600 Sobic006G219400--Sobic003G271100 Sobic006G074600 Sobic006G074600 Sobic006G219400--Sobic006G074600 Sobic003G271100--Sobic005G028500 Sobic003G271100--Sobic006G219400 Sobic003G271100--Sobic004G078200 Sobic003G271100--Sobic002G191900 Sobic009G131032 Sobic009G131032 Sobic003G271100--Sobic009G131032 Sobic003G271100--Sobic007G028300 Sobic002G088300 Sobic002G088300 Sobic003G271100--Sobic002G088300 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic003G271100--Sobic001G201933 Sobic003G271100--Sobic006G074600 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic009G192200--Sobic007G085900 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic009G192200--Sobic006G057100 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic009G192200--Sobic003G160300 Sobic004G282933 Sobic004G282933 Sobic009G192200--Sobic004G282933 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic009G192200--Sobic008G140050 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic009G192200--Sobic003G218950 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic009G192200--Sobic003G160433 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic009G192200--Sobic006G131700 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic009G192200--Sobic003G352000 Sobic009G255000--Sobic005G028500 Sobic009G255000--Sobic004G078200 Sobic009G255000--Sobic009G192200 Sobic009G255000--Sobic007G113566 Sobic009G255000--Sobic006G100150 Sobic009G255000--Sobic004G207800 Sobic009G255000--Sobic006G219400 Sobic004G104200 Sobic004G104200 Sobic009G255000--Sobic004G104200 Sobic009G255000--Sobic004G303900 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic007G113566--Sobic001G118050 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic007G113566--Sobic008G171200 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic007G113566--Sobic006G135701 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic007G113566--Sobic004G157050 Sobic007G113566--Sobic010G002301 Sobic007G113566--Sobic004G207800 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic007G113566--Sobic001G476800 Sobic007G113566--Sobic003G139600 Sobic007G113566--Sobic001G465600 Sobic002G191900--Sobic001G201933 Sobic002G191900--Sobic010G002301 Sobic002G191900--Sobic001G465600 Sobic002G191900--Sobic006G219400 Sobic002G191900--Sobic003G139600 Sobic002G191900--Sobic005G028500 Sobic002G191900--Sobic003G271100 Sobic002G191900--Sobic007G113566 Sobic002G191900--Sobic004G157050 Sobic001G465600--Sobic010G002301 Sobic001G465600--Sobic003G139600 Sobic001G465600--Sobic001G331650 Sobic001G465600--Sobic004G157050 Sobic001G465600--Sobic004G207800 Sobic001G465600--Sobic007G113566 Sobic001G465600--Sobic006G219400 Sobic001G465600--Sobic002G191900 Sobic001G465600--Sobic001G201933 Sobic010G002301--Sobic003G139600 Sobic010G002301--Sobic001G465600 Sobic010G002301--Sobic001G201933 Sobic010G002301--Sobic004G157050 Sobic010G002301--Sobic007G113566 Sobic010G002301--Sobic002G191900 Sobic010G002301--Sobic008G171200 Sobic010G002301--Sobic001G331650 Sobic010G002301--Sobic004G207800
Octagon: transcription factors


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