Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G131700.2,Sobic.006G131700.1
Synonym Sb06g021160
Functional annotation CRS1/YhbY domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5YBE3 , A0A1B6PLL2
Pfam PF01985
Panther DB PTHR31426 PTHR31426:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003723; RNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G25440 : RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g41550.1 : CRS1/YhbY domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010860
Brachypodium PNT61360 , KQJ83319 , KQJ83318 , PNT61359
Barley HORVU2Hr1G084980.10 , HORVU2Hr1G084980.1 , HORVU2Hr1G084980.3 , HORVU2Hr1G084980.2 , HORVU2Hr1G084980.5 , HORVU2Hr1G084980.4 , HORVU2Hr1G084980.7 , HORVU2Hr1G084980.6 , HORVU2Hr1G084980.9 , HORVU2Hr1G084980.8
Wheat TraesCS2A02G349000 , TraesCS2D02G347400 , TraesCS2D02G347400 , TraesCS2A02G366200 , TraesCS2B02G367400
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic006G131700--Sobic003G218950 Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic006G131700--Sobic003G113100 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic006G131700--Sobic006G057100 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic006G131700--Sobic009G101500 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic006G131700--Sobic003G330350 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic006G131700--Sobic009G192200 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic006G131700--Sobic004G337850 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic006G131700--Sobic010G035600 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic006G131700--Sobic002G165200 Sobic003G218950--Sobic006G057100 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic003G218950--Sobic003G369533 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic003G218950--Sobic003G352000 SobicK029400 SobicK029400 Sobic003G218950--SobicK029400 Sobic003G218950--Sobic006G131700 Sobic003G218950--Sobic002G165200 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic003G218950--Sobic007G085900 Sobic003G218950--Sobic003G113100 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic003G218950--Sobic003G169000 Sobic003G113100--Sobic006G131700 Sobic003G113100--Sobic006G057100 Sobic003G113100--Sobic003G218950 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic003G113100--Sobic001G054050 Sobic003G113100--Sobic007G085900 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic003G113100--Sobic008G140050 Sobic003G113100--Sobic002G165200 Sobic003G113100--Sobic009G192200 Sobic003G113100--SobicK029400 Sobic006G057100--Sobic003G218950 Sobic006G057100--Sobic003G352000 Sobic006G057100--Sobic007G085900 Sobic006G057100--SobicK029400 Sobic006G057100--Sobic006G131700 Sobic006G057100--Sobic003G113100 Sobic006G057100--Sobic003G369533 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic006G057100--Sobic003G160400 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic006G057100--Sobic010G185250 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic009G101500--Sobic004G077700 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic009G101500--Sobic005G139750 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic009G101500--Sobic001G022700 Sobic009G101500--Sobic006G131700 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic009G101500--Sobic007G145801 Sobic001G094550 Sobic001G094550 Sobic009G101500--Sobic001G094550 Sobic009G101500--Sobic004G337850 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic009G101500--Sobic001G182700 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic009G101500--Sobic001G182800 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic003G330350--Sobic001G270800 Sobic003G050100 Sobic003G050100 Sobic003G330350--Sobic003G050100 Sobic003G330350--Sobic006G131700 Sobic003G330350--Sobic003G218950 Sobic001G098700 Sobic001G098700 Sobic003G330350--Sobic001G098700 Sobic004G091900 Sobic004G091900 Sobic003G330350--Sobic004G091900 Sobic003G330350--Sobic006G057100 Sobic003G330350--Sobic009G192200 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic003G330350--Sobic001G167000 Sobic009G192200--Sobic007G085900 Sobic009G192200--Sobic006G057100 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic009G192200--Sobic003G160300 Sobic004G282933 Sobic004G282933 Sobic009G192200--Sobic004G282933 Sobic009G192200--Sobic008G140050 Sobic009G192200--Sobic003G218950 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic009G192200--Sobic003G160433 Sobic009G192200--Sobic006G131700 Sobic009G192200--Sobic003G352000 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic004G337850--Sobic006G057050 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic004G337850--Sobic009G123100 Sobic004G337850--Sobic003G352000 Sobic004G337850--Sobic010G035600 Sobic004G337850--Sobic007G145801 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic004G337850--Sobic003G172500 Sobic004G337850--SobicK029400 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic004G337850--Sobic003G168200 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic004G337850--Sobic009G148950 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic010G035600--Sobic007G065000 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic010G035600--Sobic001G182900 Sobic010G035600--Sobic004G337850 Sobic010G035600--Sobic010G185250 Sobic010G035600--SobicK029400 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic010G035600--Sobic004G019550 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic010G035600--Sobic001G476800 Sobic010G035600--Sobic003G172500 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic010G035600--Sobic010G206600 Sobic002G165200--Sobic010G185250 Sobic002G165200--Sobic001G182900 Sobic002G165200--Sobic003G218950 Sobic002G165200--SobicK029400 Sobic002G165200--Sobic003G369533 Sobic002G165200--Sobic010G035600 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic002G165200--Sobic006G192600 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic002G165200--Sobic003G412500 Sobic002G165200--Sobic003G172500
Octagon: transcription factors


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