Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G182800.1,Sobic.001G182800.3,Sobic.001G182800.2
Synonym Sb01g015900
Functional annotation disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S687 , A0A1B6QJN9
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF637
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14470 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g38330.1 : disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G182700 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
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13 Sobic.001G358366 - -
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15 Sobic.010G035600 - -
16 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
17 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -
18 Sobic.003G172500 - -
19 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
20 Sobic.001G530201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic001G182800--Sobic001G182700 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic001G182800--Sobic003G369533 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic001G182800--Sobic001G182900 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic001G182800--Sobic002G165200 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic001G182800--Sobic003G218950 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic001G182800--Sobic010G185250 Sobic003G369566 Sobic003G369566 Sobic001G182800--Sobic003G369566 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic001G182800--Sobic002G159750 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic001G182800--Sobic007G065000 Sobic001G182700--Sobic001G182800 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic001G182700--Sobic001G530201 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic001G182700--Sobic006G124800 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic001G182700--Sobic005G139750 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic001G182700--Sobic010G206600 SobicK032300 SobicK032300 Sobic001G182700--SobicK032300 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic001G182700--Sobic007G145801 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic001G182700--Sobic004G077700 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic001G182700--Sobic003G169100 SobicK029400 SobicK029400 Sobic003G369533--SobicK029400 Sobic003G369533--Sobic003G218950 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic003G369533--Sobic003G168200 Sobic007G149200 Sobic007G149200 Sobic003G369533--Sobic007G149200 Sobic005G116400 Sobic005G116400 Sobic003G369533--Sobic005G116400 Sobic003G369533--Sobic007G065000 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic003G369533--Sobic003G352000 Sobic003G369533--Sobic003G369566 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic003G369533--Sobic003G169000 Sobic001G182900--Sobic010G185250 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic001G182900--Sobic010G035600 Sobic001G182900--Sobic002G165200 Sobic001G182900--Sobic003G369533 Sobic001G182900--Sobic007G065000 Sobic001G182900--Sobic001G182800 Sobic001G182900--SobicK029400 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic001G182900--Sobic001G476800 Sobic001G182900--Sobic003G218950 Sobic002G165200--Sobic010G185250 Sobic002G165200--Sobic001G182900 Sobic002G165200--Sobic003G218950 Sobic002G165200--SobicK029400 Sobic002G165200--Sobic003G369533 Sobic002G165200--Sobic010G035600 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic002G165200--Sobic006G192600 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic002G165200--Sobic003G412500 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic002G165200--Sobic003G172500 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic003G218950--Sobic006G057100 Sobic003G218950--Sobic003G369533 Sobic003G218950--Sobic003G352000 Sobic003G218950--SobicK029400 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic003G218950--Sobic006G131700 Sobic003G218950--Sobic002G165200 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic003G218950--Sobic007G085900 Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic003G218950--Sobic003G113100 Sobic003G218950--Sobic003G169000 Sobic010G185250--Sobic002G165200 Sobic010G185250--Sobic001G182900 Sobic010G185250--Sobic010G035600 Sobic010G185250--SobicK029400 Sobic010G185250--Sobic003G369533 Sobic010G185250--Sobic006G057100 Sobic010G185250--Sobic003G218950 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic010G185250--Sobic003G168800 Sobic010G185250--Sobic003G172500 Sobic003G369566--Sobic003G369533 Sobic003G369566--Sobic007G149200 Sobic003G369566--Sobic003G168200 Sobic002G311900 Sobic002G311900 Sobic003G369566--Sobic002G311900 Sobic003G369566--Sobic005G116400 Sobic003G369566--Sobic003G169100 Sobic003G369566--Sobic003G352000 Sobic003G369566--SobicK029400 Sobic003G369566--Sobic003G169000 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic002G159750--Sobic003G286450 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic002G159750--Sobic002G083332 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic002G159750--Sobic001G535850 Sobic002G159750--Sobic001G476800 Sobic002G159750--Sobic005G139750 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic002G159750--Sobic001G394532 Sobic002G159750--Sobic001G182900 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic002G159750--Sobic010G175550 Sobic002G159750--Sobic004G077700 Sobic007G065000--Sobic010G035600 Sobic007G065000--Sobic003G169000 Sobic007G065000--Sobic003G169100 Sobic007G065000--Sobic003G369533 Sobic007G065000--SobicK029400 Sobic007G065000--Sobic007G145801 Sobic007G065000--Sobic010G206600 Sobic007G065000--Sobic003G352000 Sobic007G065000--Sobic003G168200
Octagon: transcription factors


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