Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G358366.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S9A5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G065000 proton-dependent oligopeptide transport, putative, expressed -
2 Sobic.002G083332 - -
3 Sobic.002G159750 - -
4 Sobic.001G182900 - -
5 Sobic.001G182800 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
6 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
7 Sobic.008G171200 OsWAK129b - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
8 Sobic.010G035600 - -
9 Sobic.001G394532 - K02110: ATPF0C, F-type H+-transporting ATPase subunit c
10 Sobic.002G274300 - -
11 Sobic.002G311900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G185250 - -
13 Sobic.003G286450 - -
14 Sobic.001G094550 - -
15 Sobic.001G182700 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
16 Sobic.003G369566 - -
17 Sobic.003G369533 - -
18 Sobic.001G476800 - -
19 Sobic.002G380550 - -
20 Sobic.001G037033 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G358366 Sobic001G358366 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic001G358366--Sobic007G065000 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic001G358366--Sobic002G083332 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic001G358366--Sobic002G159750 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic001G358366--Sobic001G182900 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic001G358366--Sobic001G182800 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic001G358366--Sobic010G206600 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic001G358366--Sobic008G171200 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic001G358366--Sobic010G035600 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic001G358366--Sobic001G394532 Sobic007G065000--Sobic010G035600 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic007G065000--Sobic003G169000 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic007G065000--Sobic003G169100 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic007G065000--Sobic003G369533 SobicK029400 SobicK029400 Sobic007G065000--SobicK029400 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic007G065000--Sobic007G145801 Sobic007G065000--Sobic010G206600 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic007G065000--Sobic003G352000 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic007G065000--Sobic003G168200 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic002G083332--Sobic001G530201 Sobic002G380550 Sobic002G380550 Sobic002G083332--Sobic002G380550 Sobic002G083332--Sobic002G159750 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic002G083332--Sobic003G056200 Sobic002G083332--Sobic001G394532 Sobic002G083332--Sobic001G358366 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic002G083332--Sobic009G204501 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic002G083332--Sobic001G182700 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic002G083332--Sobic005G139900 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic002G159750--Sobic003G286450 Sobic002G159750--Sobic002G083332 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic002G159750--Sobic001G535850 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic002G159750--Sobic001G476800 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic002G159750--Sobic005G139750 Sobic002G159750--Sobic001G394532 Sobic002G159750--Sobic001G182900 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic002G159750--Sobic010G175550 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic002G159750--Sobic004G077700 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic001G182900--Sobic010G185250 Sobic001G182900--Sobic010G035600 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic001G182900--Sobic002G165200 Sobic001G182900--Sobic003G369533 Sobic001G182900--Sobic007G065000 Sobic001G182900--Sobic001G182800 Sobic001G182900--SobicK029400 Sobic001G182900--Sobic001G476800 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic001G182900--Sobic003G218950 Sobic001G182800--Sobic001G182700 Sobic001G182800--Sobic003G369533 Sobic001G182800--Sobic001G182900 Sobic001G182800--Sobic002G165200 Sobic001G182800--Sobic003G218950 Sobic001G182800--Sobic010G185250 Sobic003G369566 Sobic003G369566 Sobic001G182800--Sobic003G369566 Sobic001G182800--Sobic002G159750 Sobic001G182800--Sobic007G065000 Sobic010G206600--Sobic001G394532 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic010G206600--Sobic001G230050 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic010G206600--Sobic003G169200 SobicK032300 SobicK032300 Sobic010G206600--SobicK032300 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic010G206600--Sobic006G183100 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic010G206600--Sobic006G124700 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic010G206600--Sobic003G172500 Sobic010G206600--Sobic005G139900 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic010G206600--Sobic009G174150 Sobic008G171200--Sobic001G476800 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic008G171200--Sobic004G157050 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic008G171200--Sobic007G113566 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic008G171200--Sobic004G207800 Sobic008G171200--Sobic010G175550 Sobic008G171200--Sobic010G035600 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic008G171200--Sobic001G331650 Sobic008G171200--Sobic001G182900 Sobic008G171200--Sobic003G286450 Sobic010G035600--Sobic007G065000 Sobic010G035600--Sobic001G182900 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic010G035600--Sobic004G337850 Sobic010G035600--Sobic010G185250 Sobic010G035600--SobicK029400 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic010G035600--Sobic004G019550 Sobic010G035600--Sobic001G476800 Sobic010G035600--Sobic003G172500 Sobic010G035600--Sobic010G206600 Sobic001G394532--Sobic010G206600 Sobic001G394532--Sobic001G230050 Sobic001G394532--Sobic003G169200 Sobic001G394532--SobicK032300 Sobic001G394532--Sobic001G535850 Sobic001G394532--Sobic005G139900 Sobic001G394532--Sobic001G530201 Sobic001G394532--Sobic006G183100 Sobic001G394532--Sobic009G174150
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.