Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G286450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VZD8
Pfam -
Panther DB PTHR24193 PTHR24193:SF70
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G24530 : AAA-type ATPase family protein / ankyrin repeat family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g16660.1 : cbxX, chromosomal, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034405
Brachypodium KQJ94325 , PNT66307
Barley HORVU6Hr1G043280.3 , HORVU6Hr1G043280.2 , HORVU6Hr1G043280.1
Wheat TraesCS6A02G193400 , TraesCS6D02G179400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G535850 - -
2 Sobic.002G159750 - -
3 Sobic.001G154000 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G019550 - -
5 Sobic.001G476800 - -
6 Sobic.001G394532 - K02110: ATPF0C, F-type H+-transporting ATPase subunit c
7 Sobic.005G139750 - -
8 Sobic.004G303433 - K02950: RP-S12, MRPS12, small subunit ribosomal protein S12
9 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
10 Sobic.010G035600 - -
11 Sobic.005G139900 chloroplast 30S ribosomal protein S7, putative, expressed K02992: RP-S7, MRPS7, small subunit ribosomal protein S7
12 Sobic.009G174150 - -
13 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein
14 Sobic.008G171200 OsWAK129b - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
15 Sobic.004G077700 - -
16 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
17 Sobic.005G104900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
18 Sobic.009G260550 - -
19 Sobic.001G182900 - -
20 Sobic.004G252600 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic003G286450--Sobic001G535850 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic003G286450--Sobic002G159750 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic003G286450--Sobic001G154000 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic003G286450--Sobic004G019550 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic003G286450--Sobic001G476800 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic003G286450--Sobic001G394532 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic003G286450--Sobic005G139750 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic003G286450--Sobic004G303433 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic003G286450--Sobic010G206600 Sobic001G535850--Sobic003G286450 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic001G535850--Sobic005G139900 Sobic001G535850--Sobic004G303433 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic001G394532 Sobic001G535850--Sobic010G206600 Sobic001G535850--Sobic005G139750 Sobic001G535850--Sobic001G154000 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic001G535850--Sobic005G104900 Sobic002G159750--Sobic003G286450 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic002G159750--Sobic002G083332 Sobic002G159750--Sobic001G535850 Sobic002G159750--Sobic001G476800 Sobic002G159750--Sobic005G139750 Sobic002G159750--Sobic001G394532 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic002G159750--Sobic001G182900 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic002G159750--Sobic010G175550 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic002G159750--Sobic004G077700 Sobic001G154000--Sobic004G019550 Sobic001G154000--Sobic001G535850 Sobic001G154000--Sobic003G286450 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic001G154000--Sobic010G035600 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic001G154000--Sobic002G220400 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic001G154000--Sobic009G174150 Sobic003G344300 Sobic003G344300 Sobic001G154000--Sobic003G344300 Sobic001G154000--Sobic001G476800 Sobic001G154000--Sobic005G139750 Sobic004G019550--Sobic001G154000 Sobic004G019550--Sobic010G035600 Sobic004G019550--Sobic003G286450 Sobic004G019550--Sobic002G220400 Sobic004G019550--Sobic001G476800 Sobic004G019550--Sobic001G535850 Sobic004G019550--Sobic003G344300 Sobic004G019550--Sobic005G139750 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic004G019550--Sobic006G135701 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic001G476800--Sobic008G171200 Sobic001G476800--Sobic010G175550 Sobic001G476800--Sobic010G035600 Sobic001G476800--Sobic003G286450 Sobic001G476800--Sobic004G019550 Sobic001G476800--Sobic002G159750 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic001G476800--Sobic007G113566 Sobic001G476800--Sobic001G182900 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic001G476800--Sobic004G207800 Sobic001G394532--Sobic010G206600 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic001G394532--Sobic001G230050 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic001G394532--Sobic003G169200 SobicK032300 SobicK032300 Sobic001G394532--SobicK032300 Sobic001G394532--Sobic001G535850 Sobic001G394532--Sobic005G139900 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic001G394532--Sobic001G530201 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic001G394532--Sobic006G183100 Sobic001G394532--Sobic009G174150 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic005G139750--Sobic001G022700 Sobic005G139750--Sobic004G077700 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic005G139750--Sobic007G145801 Sobic005G139750--Sobic010G206600 Sobic005G139750--Sobic001G535850 Sobic005G139750--Sobic005G104900 Sobic005G139750--Sobic003G173116 Sobic005G139750--Sobic001G230050 Sobic005G139750--Sobic003G286450 Sobic004G303433--Sobic005G139900 Sobic004G303433--Sobic001G535850 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic004G303433--Sobic003G159101 Sobic004G303433--Sobic001G394532 Sobic005G036450 Sobic005G036450 Sobic004G303433--Sobic005G036450 Sobic005G184900 Sobic005G184900 Sobic004G303433--Sobic005G184900 Sobic004G303433--Sobic003G286450 Sobic004G303433--Sobic003G169200 Sobic004G303433--Sobic003G173116 Sobic010G206600--Sobic001G394532 Sobic010G206600--Sobic001G230050 Sobic010G206600--Sobic003G169200 Sobic010G206600--SobicK032300 Sobic010G206600--Sobic006G183100 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic010G206600--Sobic006G124700 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic010G206600--Sobic003G172500 Sobic010G206600--Sobic005G139900 Sobic010G206600--Sobic009G174150
Octagon: transcription factors


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