Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G019550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RKI1
Pfam PF03936
Panther DB PTHR31225 PTHR31225:SF0
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016829; lyase activity GO:0010333terpene synthase activity GO:0000287magnesium ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G61680 : terpene synthase 14
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g02930.1 : terpene synthase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018765 , Zm00025a018761
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS6B02G091300 , TraesCSU02G116600 , TraesCS6B02G091100 , TraesCS6A02G067500 , TraesCSU02G116700 , TraesCS6A02G067600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G154000 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.010G035600 - -
3 Sobic.003G286450 - -
4 Sobic.002G220400 - -
5 Sobic.001G476800 - -
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8 Sobic.005G139750 - -
9 Sobic.006G135701 - -
10 Sobic.001G450900 UNE2, putative, expressed -
11 Sobic.001G118050 - -
12 Sobic.003G168800 photosystem II reaction center protein H, putative, expressed K02709: photosystem II PsbH protein
13 Sobic.009G174150 - -
14 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
15 Sobic.008G171200 OsWAK129b - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
16 Sobic.004G252600 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
17 Sobic.010G175550 - -
18 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
19 Sobic.001G394532 - K02110: ATPF0C, F-type H+-transporting ATPase subunit c
20 Sobic.004G337850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic004G019550--Sobic001G154000 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic004G019550--Sobic010G035600 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic004G019550--Sobic003G286450 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic004G019550--Sobic002G220400 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic004G019550--Sobic001G476800 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic004G019550--Sobic001G535850 Sobic003G344300 Sobic003G344300 Sobic004G019550--Sobic003G344300 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic004G019550--Sobic005G139750 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic004G019550--Sobic006G135701 Sobic001G154000--Sobic004G019550 Sobic001G154000--Sobic001G535850 Sobic001G154000--Sobic003G286450 Sobic001G154000--Sobic010G035600 Sobic001G154000--Sobic002G220400 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic001G154000--Sobic009G174150 Sobic001G154000--Sobic003G344300 Sobic001G154000--Sobic001G476800 Sobic001G154000--Sobic005G139750 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic010G035600--Sobic007G065000 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic010G035600--Sobic001G182900 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic010G035600--Sobic004G337850 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic010G035600--Sobic010G185250 SobicK029400 SobicK029400 Sobic010G035600--SobicK029400 Sobic010G035600--Sobic004G019550 Sobic010G035600--Sobic001G476800 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic010G035600--Sobic003G172500 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic010G035600--Sobic010G206600 Sobic003G286450--Sobic001G535850 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic003G286450--Sobic002G159750 Sobic003G286450--Sobic001G154000 Sobic003G286450--Sobic004G019550 Sobic003G286450--Sobic001G476800 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic003G286450--Sobic001G394532 Sobic003G286450--Sobic005G139750 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic003G286450--Sobic004G303433 Sobic003G286450--Sobic010G206600 Sobic002G220400--Sobic004G019550 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic002G220400--Sobic001G118050 Sobic002G220400--Sobic006G135701 Sobic002G220400--Sobic001G154000 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic002G220400--Sobic009G260550 Sobic004G252600 Sobic004G252600 Sobic002G220400--Sobic004G252600 Sobic001G222150 Sobic001G222150 Sobic002G220400--Sobic001G222150 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic002G220400--Sobic006G100150 Sobic007G011100 Sobic007G011100 Sobic002G220400--Sobic007G011100 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic001G476800--Sobic008G171200 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic001G476800--Sobic010G175550 Sobic001G476800--Sobic010G035600 Sobic001G476800--Sobic003G286450 Sobic001G476800--Sobic004G019550 Sobic001G476800--Sobic002G159750 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic001G476800--Sobic007G113566 Sobic001G476800--Sobic001G182900 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic001G476800--Sobic004G207800 Sobic001G535850--Sobic003G286450 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic001G535850--Sobic005G139900 Sobic001G535850--Sobic004G303433 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic001G394532 Sobic001G535850--Sobic010G206600 Sobic001G535850--Sobic005G139750 Sobic001G535850--Sobic001G154000 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic001G535850--Sobic005G104900 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic003G344300--Sobic003G168800 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic003G344300--Sobic002G165200 Sobic003G344300--Sobic004G019550 Sobic003G344300--Sobic010G035600 Sobic003G119750 Sobic003G119750 Sobic003G344300--Sobic003G119750 Sobic003G344300--Sobic001G154000 Sobic003G344300--Sobic010G185250 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic003G344300--Sobic001G293900 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic003G344300--Sobic006G192600 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic005G139750--Sobic001G022700 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic005G139750--Sobic004G077700 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic005G139750--Sobic007G145801 Sobic005G139750--Sobic010G206600 Sobic005G139750--Sobic001G535850 Sobic005G139750--Sobic005G104900 Sobic005G139750--Sobic003G173116 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic005G139750--Sobic001G230050 Sobic005G139750--Sobic003G286450 Sobic006G135701--Sobic001G118050 Sobic006G135701--Sobic007G113566 Sobic006G135701--Sobic002G220400 Sobic006G135701--Sobic004G019550 Sobic006G135701--Sobic001G476800 Sobic006G135701--Sobic001G154000 Sobic006G135701--Sobic004G252600 Sobic006G135701--Sobic010G175550 Sobic006G135701--Sobic008G171200
Octagon: transcription factors


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