Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G337850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RRA0 , A1E9U2
Pfam PF05115
Panther DB PTHR37266 PTHR37266:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0009512; cytochrome b6f complex GO:0009055electron transfer activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR ATCG00590 : electron carriers
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU0Hr1G027570.1 , HORVU4Hr1G079290.1 , AGP50772 , HORVU0Hr1G031380.1 , HORVU0Hr1G035200.1 , HORVU5Hr1G065100.1 , HORVU6Hr1G049340.1 , HORVU0Hr1G034280.1 , HORVU0Hr1G032980.1 , HORVU0Hr1G029850.1 , HORVU6Hr1G037190.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G057050 - -
2 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
3 Sobic.003G352000 growth regulator related protein, putative, expressed -
4 Sobic.010G035600 - -
5 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
6 Sobic.003G172500 - -
7 Sobic.K029400 conserved hypothetical protein -
8 Sobic.003G168200 - -
9 Sobic.009G148950 - -
10 Sobic.006G057100 - -
11 Sobic.004G087050 - -
12 Sobic.007G065000 proton-dependent oligopeptide transport, putative, expressed -
13 Sobic.003G169000 - K02718: photosystem II PsbT protein
14 Sobic.003G172701 - -
15 Sobic.003G218950 - -
16 Sobic.006G124700 chloroplast 30S ribosomal protein S8, putative, expressed K02994: RP-S8, small subunit ribosomal protein S8
17 Sobic.010G052866 - K02892: RP-L23, MRPL23, large subunit ribosomal protein L23
18 Sobic.003G172400 conserved hypothetical protein -
19 Sobic.003G169100 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed K02704: photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein
20 Sobic.005G139750 - -


Gene co-expression network
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