Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G148950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R2S8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G270733 - -
2 Sobic.003G172701 - -
3 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
4 Sobic.006G057050 - -
5 Sobic.005G110493 - -
6 Sobic.003G172500 - -
7 Sobic.004G210400 expressed protein -
8 Sobic.004G087050 - -
9 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -
10 Sobic.007G109200 ATP synthase epsilon chain, putative, expressed K02114: ATPF1E, F-type H+-transporting ATPase subunit epsilon
11 Sobic.003G169300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed K02967: RP-S2, MRPS2, small subunit ribosomal protein S2
12 Sobic.003G168425 - K02963: RP-S18, MRPS18, small subunit ribosomal protein S18
13 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
14 Sobic.010G052866 - K02892: RP-L23, MRPL23, large subunit ribosomal protein L23
15 Sobic.002G148166 - -
16 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
17 Sobic.010G139200 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed -
18 Sobic.001G230050 - K05580: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I
19 Sobic.003G130200 embryonic protein DC-8, putative, expressed -
20 Sobic.006G124700 chloroplast 30S ribosomal protein S8, putative, expressed K02994: RP-S8, small subunit ribosomal protein S8


Gene co-expression network
sample Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic009G148950--Sobic002G270733 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic009G148950--Sobic003G172701 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic009G148950--Sobic009G123100 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic009G148950--Sobic006G057050 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic009G148950--Sobic005G110493 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic009G148950--Sobic003G172500 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic009G148950--Sobic004G210400 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic009G148950--Sobic004G087050 SobicK032300 SobicK032300 Sobic009G148950--SobicK032300 Sobic002G270733--Sobic009G148950 Sobic002G270733--Sobic003G172701 Sobic002G270733--Sobic004G210400 Sobic002G270733--Sobic009G123100 Sobic002G270733--Sobic005G110493 Sobic002G270733--SobicK032300 Sobic002G270733--Sobic006G057050 Sobic002G270733--Sobic003G172500 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic002G270733--Sobic002G148166 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic003G172701--Sobic007G109200 Sobic003G172701--Sobic009G148950 Sobic003G172701--Sobic005G110493 Sobic003G172701--Sobic002G148166 Sobic003G172701--Sobic006G057050 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic003G172701--Sobic004G087000 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic003G172701--Sobic003G169300 Sobic003G172701--Sobic002G270733 Sobic003G172701--Sobic004G210400 Sobic009G123100--Sobic003G172500 Sobic009G123100--Sobic009G148950 Sobic009G123100--Sobic004G087050 Sobic009G123100--Sobic006G057050 Sobic009G123100--SobicK032300 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic009G123100--Sobic007G145801 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic009G123100--Sobic006G124700 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic009G123100--Sobic010G139200 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic009G123100--Sobic004G337850 Sobic006G057050--Sobic003G172701 Sobic006G057050--Sobic009G123100 Sobic006G057050--Sobic004G337850 Sobic006G057050--Sobic009G148950 Sobic006G057050--Sobic003G172500 Sobic006G057050--Sobic005G110493 Sobic006G057050--Sobic007G109200 Sobic006G057050--Sobic004G087050 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic006G057050--Sobic010G052866 Sobic005G110493--Sobic003G169300 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic005G110493--Sobic003G168425 Sobic005G110493--Sobic004G087050 Sobic005G110493--Sobic003G172701 Sobic005G110493--Sobic010G139200 Sobic005G110493--Sobic003G172500 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic005G110493--Sobic003G130200 Sobic005G110493--Sobic002G148166 Sobic005G110493--Sobic010G052866 Sobic003G172500--Sobic010G052866 Sobic003G172500--Sobic004G087050 Sobic003G172500--Sobic009G123100 Sobic003G172500--SobicK032300 Sobic003G172500--Sobic010G139200 Sobic003G172500--Sobic005G110493 Sobic003G172500--Sobic006G124700 Sobic003G172500--Sobic003G168425 Sobic003G172500--Sobic003G169300 Sobic004G210400--Sobic003G130200 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic004G210400--Sobic002G150200 Sobic004G210400--Sobic002G148166 Sobic004G210400--Sobic003G168425 Sobic004G210400--Sobic005G110493 Sobic004G210400--Sobic010G139200 Sobic004G210400--Sobic004G087050 Sobic004G210400--Sobic003G172701 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic004G210400--Sobic005G002050 Sobic004G087050--Sobic010G139200 Sobic004G087050--Sobic003G168425 Sobic004G087050--Sobic005G110493 Sobic004G087050--Sobic003G172500 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic004G087050--Sobic003G168200 Sobic004G087050--Sobic009G123100 Sobic004G087050--Sobic003G169300 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic004G087050--Sobic003G171900 Sobic004G087050--Sobic004G210400 Sobic001G230050 Sobic001G230050 SobicK032300--Sobic001G230050 SobicK032300--Sobic003G172500 SobicK032300--Sobic006G124700 Sobic010G206600 Sobic010G206600 SobicK032300--Sobic010G206600 SobicK032300--Sobic009G123100 Sobic006G183100 Sobic006G183100 SobicK032300--Sobic006G183100 SobicK032300--Sobic010G052866 Sobic006G124800 Sobic006G124800 SobicK032300--Sobic006G124800 Sobic003G169200 Sobic003G169200 SobicK032300--Sobic003G169200
Octagon: transcription factors


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