Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G168425.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VXM3 , A0A120GUW5 , A1E9U6
Pfam PF01084
Panther DB PTHR13479
NCBI CDD -
KEGG Orthology K02963; RP-S18, MRPS18, small subunit ribosomal protein S18
Gene Ontology GO:0006412; translation GO:0005840ribosome GO:0005622intracellular GO:0003735structural constituent of ribosome


Orthologs (automatic annotation)
TAIR ATCG00650 : ribosomal protein S18
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g15308.1 : chloroplast 30S ribosomal protein S18, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK00492 , KQK11276 , KQK18184 , PNT61992 , PNT63589 , KQK12744
Barley HORVU0Hr1G029880.1 , HORVU6Hr1G049360.1 , AGP50776 , HORVU7Hr1G065900.1 , HORVU0Hr1G026130.1 , HORVU6Hr1G073720.1 , HORVU5Hr1G065080.1 , HORVU0Hr1G033480.1 , HORVU0Hr1G037610.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G087050 - -
2 Sobic.005G110493 - -
3 Sobic.010G139200 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed -
4 Sobic.003G169300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed K02967: RP-S2, MRPS2, small subunit ribosomal protein S2
5 Sobic.003G171900 - -
6 Sobic.003G172500 - -
7 Sobic.003G130200 embryonic protein DC-8, putative, expressed -
8 Sobic.004G210400 expressed protein -
9 Sobic.008G160300 NADPH-dependent oxidoreductase, putative K05576: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L
10 Sobic.003G168200 - -
11 Sobic.003G172701 - -
12 Sobic.010G052866 - K02892: RP-L23, MRPL23, large subunit ribosomal protein L23
13 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
14 Sobic.002G150200 cytochrome c biogenesis protein ccsA, putative, expressed -
15 Sobic.002G148166 - -
16 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -
17 Sobic.003G168500 chloroplast 50S ribosomal protein L20, putative, expressed K02887: RP-L20, MRPL20, large subunit ribosomal protein L20
18 Sobic.003G166400 - K02911: RP-L32, MRPL32, large subunit ribosomal protein L32
19 Sobic.002G278100 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G337600 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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