Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G110493.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A109NE12
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g21388.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G169300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed K02967: RP-S2, MRPS2, small subunit ribosomal protein S2
2 Sobic.003G168425 - K02963: RP-S18, MRPS18, small subunit ribosomal protein S18
3 Sobic.004G087050 - -
4 Sobic.003G172701 - -
5 Sobic.010G139200 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed -
6 Sobic.003G172500 - -
7 Sobic.003G130200 embryonic protein DC-8, putative, expressed -
8 Sobic.002G148166 - -
9 Sobic.010G052866 - K02892: RP-L23, MRPL23, large subunit ribosomal protein L23
10 Sobic.004G210400 expressed protein -
11 Sobic.003G173266 - K02956: RP-S15, MRPS15, small subunit ribosomal protein S15
12 Sobic.003G171900 - -
13 Sobic.002G150200 cytochrome c biogenesis protein ccsA, putative, expressed -
14 Sobic.009G148950 - -
15 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
16 Sobic.006G057050 - -
17 Sobic.004G251400 - -
18 Sobic.004G337600 - -
19 Sobic.008G160300 NADPH-dependent oxidoreductase, putative K05576: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L
20 Sobic.003G172900 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed K05581: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J


Gene co-expression network
sample Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic005G110493--Sobic003G169300 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic005G110493--Sobic003G168425 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic005G110493--Sobic004G087050 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic005G110493--Sobic003G172701 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic005G110493--Sobic010G139200 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic005G110493--Sobic003G172500 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic005G110493--Sobic003G130200 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic005G110493--Sobic002G148166 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic005G110493--Sobic010G052866 Sobic003G169300--Sobic005G110493 Sobic003G169300--Sobic003G168425 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic003G169300--Sobic003G173266 Sobic003G169300--Sobic010G052866 Sobic003G169300--Sobic004G087050 Sobic003G169300--Sobic003G172701 Sobic003G169300--Sobic003G172500 Sobic003G169300--Sobic002G148166 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic003G169300--Sobic004G251400 Sobic003G168425--Sobic004G087050 Sobic003G168425--Sobic005G110493 Sobic003G168425--Sobic010G139200 Sobic003G168425--Sobic003G169300 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic003G168425--Sobic003G171900 Sobic003G168425--Sobic003G172500 Sobic003G168425--Sobic003G130200 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic003G168425--Sobic004G210400 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic003G168425--Sobic008G160300 Sobic004G087050--Sobic010G139200 Sobic004G087050--Sobic003G168425 Sobic004G087050--Sobic005G110493 Sobic004G087050--Sobic003G172500 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic004G087050--Sobic003G168200 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic004G087050--Sobic009G123100 Sobic004G087050--Sobic003G169300 Sobic004G087050--Sobic003G171900 Sobic004G087050--Sobic004G210400 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic003G172701--Sobic007G109200 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic003G172701--Sobic009G148950 Sobic003G172701--Sobic005G110493 Sobic003G172701--Sobic002G148166 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic003G172701--Sobic006G057050 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic003G172701--Sobic004G087000 Sobic003G172701--Sobic003G169300 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic003G172701--Sobic002G270733 Sobic003G172701--Sobic004G210400 Sobic010G139200--Sobic004G087050 Sobic010G139200--Sobic003G168425 Sobic010G139200--Sobic005G110493 Sobic010G139200--Sobic003G172500 Sobic010G139200--Sobic003G168200 Sobic010G139200--Sobic004G210400 Sobic010G139200--Sobic003G169300 SobicK032300 SobicK032300 Sobic010G139200--SobicK032300 Sobic010G139200--Sobic009G123100 Sobic003G172500--Sobic010G052866 Sobic003G172500--Sobic004G087050 Sobic003G172500--Sobic009G123100 Sobic003G172500--SobicK032300 Sobic003G172500--Sobic010G139200 Sobic003G172500--Sobic005G110493 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic003G172500--Sobic006G124700 Sobic003G172500--Sobic003G168425 Sobic003G172500--Sobic003G169300 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic003G130200--Sobic002G150200 Sobic003G130200--Sobic004G210400 Sobic003G130200--Sobic002G148166 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic003G130200--Sobic005G002050 Sobic003G130200--Sobic005G110493 Sobic003G130200--Sobic003G168425 Sobic003G130200--Sobic003G169300 Sobic003G130200--Sobic010G139200 Sobic003G130200--Sobic004G087050 Sobic002G148166--Sobic002G150200 Sobic002G148166--Sobic003G130200 Sobic002G148166--Sobic003G172701 Sobic002G148166--Sobic005G110493 Sobic002G148166--Sobic004G210400 Sobic002G148166--Sobic005G002050 Sobic002G148166--Sobic003G169300 Sobic002G148166--Sobic004G087000 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic002G148166--Sobic002G222000 Sobic010G052866--Sobic003G172500 Sobic010G052866--Sobic003G169300 Sobic010G052866--Sobic005G110493 Sobic010G052866--SobicK032300 Sobic010G052866--Sobic003G173266 Sobic010G052866--Sobic004G087050 Sobic010G052866--Sobic003G168425 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic010G052866--Sobic003G168800 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic010G052866--Sobic001G230050
Octagon: transcription factors


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