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Transcriptome id Sobic.004G337600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5XV52
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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1 Sobic.003G168500 chloroplast 50S ribosomal protein L20, putative, expressed K02887: RP-L20, MRPL20, large subunit ribosomal protein L20
2 Sobic.002G044500 chloroplast 30S ribosomal protein S16, putative, expressed K02959: RP-S16, MRPS16, small subunit ribosomal protein S16
3 Sobic.008G160300 NADPH-dependent oxidoreductase, putative K05576: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L
4 Sobic.004G251400 - -
5 Sobic.003G171900 - -
6 Sobic.003G172900 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed K05581: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J
7 Sobic.003G169300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed K02967: RP-S2, MRPS2, small subunit ribosomal protein S2
8 Sobic.003G172850 - K03043: DNA-directed RNA polymerase subunit beta
9 Sobic.005G110493 - -
10 Sobic.003G172400 conserved hypothetical protein -
11 Sobic.006G192600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat protein PPR868-14, putative, expressed -
12 Sobic.006G057050 - -
13 Sobic.003G168425 - K02963: RP-S18, MRPS18, small subunit ribosomal protein S18
14 Sobic.003G173266 - K02956: RP-S15, MRPS15, small subunit ribosomal protein S15
15 Sobic.002G149966 - -
16 Sobic.003G169400 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03046: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
17 Sobic.002G150032 - -
18 Sobic.003G172701 - -
19 Sobic.004G087000 ATP synthase subunit beta, putative, expressed K02112: ATPF1B, F-type H+/Na+-transporting ATPase subunit beta
20 Sobic.004G087050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic004G337600--Sobic003G168500 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic004G337600--Sobic002G044500 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic004G337600--Sobic008G160300 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic004G337600--Sobic004G251400 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic004G337600--Sobic003G171900 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic004G337600--Sobic003G172900 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic004G337600--Sobic003G169300 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic004G337600--Sobic003G172850 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic004G337600--Sobic005G110493 Sobic003G168500--Sobic002G044500 Sobic003G168500--Sobic003G171900 Sobic003G168500--Sobic008G160300 Sobic003G168500--Sobic003G172850 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic003G168500--Sobic003G169400 Sobic003G168500--Sobic004G337600 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic003G168500--Sobic003G172400 Sobic010G107601 Sobic010G107601 Sobic003G168500--Sobic010G107601 Sobic003G168500--Sobic003G169300 Sobic002G044500--Sobic003G168500 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic002G044500--Sobic002G149966 Sobic002G044500--Sobic003G169400 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic002G044500--Sobic002G150032 Sobic002G044500--Sobic004G337600 Sobic002G044500--Sobic003G172850 Sobic002G044500--Sobic003G172900 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic002G044500--Sobic006G124850 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic002G044500--Sobic001G266000 Sobic008G160300--Sobic003G171900 Sobic008G160300--Sobic003G172400 Sobic008G160300--Sobic003G168500 Sobic002G278100 Sobic002G278100 Sobic008G160300--Sobic002G278100 Sobic008G160300--Sobic010G107601 Sobic010G201266 Sobic010G201266 Sobic008G160300--Sobic010G201266 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic008G160300--Sobic003G168425 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic008G160300--Sobic003G168200 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic008G160300--Sobic005G167100 Sobic004G251400--Sobic003G172900 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic004G251400--Sobic004G087000 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic004G251400--Sobic007G109200 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic004G251400--Sobic003G173266 Sobic004G251400--Sobic003G169300 Sobic004G251400--Sobic003G172850 Sobic004G251400--Sobic004G337600 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic004G251400--Sobic003G172701 Sobic004G251400--Sobic005G110493 Sobic003G171900--Sobic008G160300 Sobic003G171900--Sobic003G168500 Sobic003G171900--Sobic003G172400 Sobic003G171900--Sobic002G278100 Sobic003G171900--Sobic010G201266 Sobic003G171900--Sobic010G107601 Sobic003G171900--Sobic003G168425 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic003G171900--Sobic004G087050 Sobic003G171900--Sobic003G168200 Sobic003G172900--Sobic004G251400 Sobic003G172900--Sobic002G150032 Sobic003G172900--Sobic001G266000 Sobic003G172900--Sobic003G173266 Sobic003G172900--Sobic004G087000 Sobic003G172900--Sobic003G172850 Sobic003G172900--Sobic002G044500 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic003G172900--Sobic002G222000 Sobic003G172900--Sobic002G149966 Sobic003G169300--Sobic005G110493 Sobic003G169300--Sobic003G168425 Sobic003G169300--Sobic003G173266 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic003G169300--Sobic010G052866 Sobic003G169300--Sobic004G087050 Sobic003G169300--Sobic003G172701 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic003G169300--Sobic003G172500 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic003G169300--Sobic002G148166 Sobic003G169300--Sobic004G251400 Sobic003G172850--Sobic003G168500 Sobic003G172850--Sobic001G266000 Sobic003G172850--Sobic003G173266 Sobic003G172850--Sobic002G044500 Sobic003G172850--Sobic003G172900 Sobic003G172850--Sobic002G150032 Sobic003G172850--Sobic003G169300 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic003G172850--Sobic003G168800 Sobic003G172850--Sobic004G251400 Sobic005G110493--Sobic003G169300 Sobic005G110493--Sobic003G168425 Sobic005G110493--Sobic004G087050 Sobic005G110493--Sobic003G172701 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic005G110493--Sobic010G139200 Sobic005G110493--Sobic003G172500 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic005G110493--Sobic003G130200 Sobic005G110493--Sobic002G148166 Sobic005G110493--Sobic010G052866
Octagon: transcription factors


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