Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G169300.1
Synonym Sb03g017620
Functional annotation chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed
UniProt C5XLA3 , A1E9R7
Pfam PF00318
Panther DB PTHR12534
NCBI CDD KOG0832; Mitochondrial/chloroplast ribosomal protein S2
KEGG Orthology K02967; RP-S2, MRPS2, small subunit ribosomal protein S2
Gene Ontology GO:0006412; translation GO:0005840ribosome GO:0005622intracellular GO:0003735structural constituent of ribosome GO:0015935small ribosomal subunit


Orthologs (automatic annotation)
TAIR ATCG00160 : ribosomal protein S2
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g38278.1 : chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057591 , Zm00025a018304 , Zm00025a057941 , Zm00025a058076 , Zm00025a058031 , Zm00025a057882 , Zm00025a054973 , Zm00025a041313 , Zm00025a057677 , Zm00025a044831 , Zm00025a057704 , Zm00025a057620
Brachypodium KQK12760 , KQK18167 , KQJ84934 , PNT65949
Barley HORVU4Hr1G045360.1 , HORVU0Hr1G028540.1 , HORVU0Hr1G032730.1 , HORVU6Hr1G049140.1 , HORVU6Hr1G040880.1 , HORVU6Hr1G040880.2 , AGP50748
Wheat TraesCS4D02G042600 , TraesCS1D02G169400 , TraesCS4A02G152700
Populus PNS90113 , PNT08323


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic003G169300--Sobic005G110493 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic003G169300--Sobic003G168425 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic003G169300--Sobic003G173266 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic003G169300--Sobic010G052866 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic003G169300--Sobic004G087050 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic003G169300--Sobic003G172701 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic003G169300--Sobic003G172500 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic003G169300--Sobic002G148166 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic003G169300--Sobic004G251400 Sobic005G110493--Sobic003G169300 Sobic005G110493--Sobic003G168425 Sobic005G110493--Sobic004G087050 Sobic005G110493--Sobic003G172701 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic005G110493--Sobic010G139200 Sobic005G110493--Sobic003G172500 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic005G110493--Sobic003G130200 Sobic005G110493--Sobic002G148166 Sobic005G110493--Sobic010G052866 Sobic003G168425--Sobic004G087050 Sobic003G168425--Sobic005G110493 Sobic003G168425--Sobic010G139200 Sobic003G168425--Sobic003G169300 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic003G168425--Sobic003G171900 Sobic003G168425--Sobic003G172500 Sobic003G168425--Sobic003G130200 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic003G168425--Sobic004G210400 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic003G168425--Sobic008G160300 Sobic003G173266--Sobic003G169300 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic003G173266--Sobic003G172900 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic003G173266--Sobic003G172850 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic003G173266--Sobic001G266000 Sobic003G173266--Sobic004G251400 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic003G173266--Sobic002G222000 Sobic003G173266--Sobic005G110493 Sobic003G173266--Sobic002G148166 Sobic003G173266--Sobic010G052866 Sobic010G052866--Sobic003G172500 Sobic010G052866--Sobic003G169300 Sobic010G052866--Sobic005G110493 SobicK032300 SobicK032300 Sobic010G052866--SobicK032300 Sobic010G052866--Sobic003G173266 Sobic010G052866--Sobic004G087050 Sobic010G052866--Sobic003G168425 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic010G052866--Sobic003G168800 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic010G052866--Sobic001G230050 Sobic004G087050--Sobic010G139200 Sobic004G087050--Sobic003G168425 Sobic004G087050--Sobic005G110493 Sobic004G087050--Sobic003G172500 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic004G087050--Sobic003G168200 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic004G087050--Sobic009G123100 Sobic004G087050--Sobic003G169300 Sobic004G087050--Sobic003G171900 Sobic004G087050--Sobic004G210400 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic003G172701--Sobic007G109200 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic003G172701--Sobic009G148950 Sobic003G172701--Sobic005G110493 Sobic003G172701--Sobic002G148166 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic003G172701--Sobic006G057050 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic003G172701--Sobic004G087000 Sobic003G172701--Sobic003G169300 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic003G172701--Sobic002G270733 Sobic003G172701--Sobic004G210400 Sobic003G172500--Sobic010G052866 Sobic003G172500--Sobic004G087050 Sobic003G172500--Sobic009G123100 Sobic003G172500--SobicK032300 Sobic003G172500--Sobic010G139200 Sobic003G172500--Sobic005G110493 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic003G172500--Sobic006G124700 Sobic003G172500--Sobic003G168425 Sobic003G172500--Sobic003G169300 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic002G148166--Sobic002G150200 Sobic002G148166--Sobic003G130200 Sobic002G148166--Sobic003G172701 Sobic002G148166--Sobic005G110493 Sobic002G148166--Sobic004G210400 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic002G148166--Sobic005G002050 Sobic002G148166--Sobic003G169300 Sobic002G148166--Sobic004G087000 Sobic002G148166--Sobic002G222000 Sobic004G251400--Sobic003G172900 Sobic004G251400--Sobic004G087000 Sobic004G251400--Sobic007G109200 Sobic004G251400--Sobic003G173266 Sobic004G251400--Sobic003G169300 Sobic004G251400--Sobic003G172850 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic004G251400--Sobic004G337600 Sobic004G251400--Sobic003G172701 Sobic004G251400--Sobic005G110493
Octagon: transcription factors


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