Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G130200.1
Synonym Sb03g011080
Functional annotation embryonic protein DC-8, putative, expressed
UniProt C5XH88
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g16920.1 : embryonic protein DC-8, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035208
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3B02G217900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G150200 cytochrome c biogenesis protein ccsA, putative, expressed -
2 Sobic.004G210400 expressed protein -
3 Sobic.002G148166 - -
4 Sobic.005G002050 - -
5 Sobic.005G110493 - -
6 Sobic.003G168425 - K02963: RP-S18, MRPS18, small subunit ribosomal protein S18
7 Sobic.003G169300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed K02967: RP-S2, MRPS2, small subunit ribosomal protein S2
8 Sobic.010G139200 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed -
9 Sobic.004G087050 - -
10 Sobic.003G172701 - -
11 Sobic.003G166400 - K02911: RP-L32, MRPL32, large subunit ribosomal protein L32
12 Sobic.010G254000 cycloartenol synthase, putative, expressed K19011: achilleol B synthase
13 Sobic.002G222000 - -
14 Sobic.002G270733 - -
15 Sobic.007G207100 chloroplast 30S ribosomal protein S3, putative, expressed K02982: RP-S3, small subunit ribosomal protein S3
16 Sobic.003G173266 - K02956: RP-S15, MRPS15, small subunit ribosomal protein S15
17 Sobic.009G148950 - -
18 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -
19 Sobic.003G172500 - -
20 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein


Gene co-expression network
sample Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic003G130200--Sobic002G150200 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic003G130200--Sobic004G210400 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic003G130200--Sobic002G148166 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic003G130200--Sobic005G002050 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic003G130200--Sobic005G110493 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic003G130200--Sobic003G168425 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic003G130200--Sobic003G169300 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic003G130200--Sobic010G139200 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic003G130200--Sobic004G087050 Sobic002G150200--Sobic003G130200 Sobic002G150200--Sobic004G210400 Sobic002G150200--Sobic002G148166 Sobic002G150200--Sobic005G002050 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic002G150200--Sobic007G207100 Sobic002G150200--Sobic005G110493 Sobic002G150200--Sobic003G168425 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic002G150200--Sobic003G172701 Sobic002G150200--Sobic003G169300 Sobic004G210400--Sobic003G130200 Sobic004G210400--Sobic002G150200 Sobic004G210400--Sobic002G148166 Sobic004G210400--Sobic003G168425 Sobic004G210400--Sobic005G110493 Sobic004G210400--Sobic010G139200 Sobic004G210400--Sobic004G087050 Sobic004G210400--Sobic003G172701 Sobic004G210400--Sobic005G002050 Sobic002G148166--Sobic002G150200 Sobic002G148166--Sobic003G130200 Sobic002G148166--Sobic003G172701 Sobic002G148166--Sobic005G110493 Sobic002G148166--Sobic004G210400 Sobic002G148166--Sobic005G002050 Sobic002G148166--Sobic003G169300 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic002G148166--Sobic004G087000 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic002G148166--Sobic002G222000 Sobic005G002050--Sobic003G130200 Sobic005G002050--Sobic002G150200 Sobic005G002050--Sobic002G148166 Sobic010G254000 Sobic010G254000 Sobic005G002050--Sobic010G254000 Sobic005G002050--Sobic004G210400 Sobic005G002050--Sobic002G222000 Sobic005G002050--Sobic003G168425 Sobic005G002050--Sobic005G110493 Sobic003G166400 Sobic003G166400 Sobic005G002050--Sobic003G166400 Sobic005G110493--Sobic003G169300 Sobic005G110493--Sobic003G168425 Sobic005G110493--Sobic004G087050 Sobic005G110493--Sobic003G172701 Sobic005G110493--Sobic010G139200 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic005G110493--Sobic003G172500 Sobic005G110493--Sobic003G130200 Sobic005G110493--Sobic002G148166 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic005G110493--Sobic010G052866 Sobic003G168425--Sobic004G087050 Sobic003G168425--Sobic005G110493 Sobic003G168425--Sobic010G139200 Sobic003G168425--Sobic003G169300 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic003G168425--Sobic003G171900 Sobic003G168425--Sobic003G172500 Sobic003G168425--Sobic003G130200 Sobic003G168425--Sobic004G210400 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic003G168425--Sobic008G160300 Sobic003G169300--Sobic005G110493 Sobic003G169300--Sobic003G168425 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic003G169300--Sobic003G173266 Sobic003G169300--Sobic010G052866 Sobic003G169300--Sobic004G087050 Sobic003G169300--Sobic003G172701 Sobic003G169300--Sobic003G172500 Sobic003G169300--Sobic002G148166 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic003G169300--Sobic004G251400 Sobic010G139200--Sobic004G087050 Sobic010G139200--Sobic003G168425 Sobic010G139200--Sobic005G110493 Sobic010G139200--Sobic003G172500 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic010G139200--Sobic003G168200 Sobic010G139200--Sobic004G210400 Sobic010G139200--Sobic003G169300 SobicK032300 SobicK032300 Sobic010G139200--SobicK032300 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic010G139200--Sobic009G123100 Sobic004G087050--Sobic010G139200 Sobic004G087050--Sobic003G168425 Sobic004G087050--Sobic005G110493 Sobic004G087050--Sobic003G172500 Sobic004G087050--Sobic003G168200 Sobic004G087050--Sobic009G123100 Sobic004G087050--Sobic003G169300 Sobic004G087050--Sobic003G171900 Sobic004G087050--Sobic004G210400
Octagon: transcription factors


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