Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G207100.1
Synonym Sb07g027430
Functional annotation chloroplast 30S ribosomal protein S3, putative, expressed
UniProt A0A109ND28 , A0A1Z5RBZ3 , A0A120GUI4 , A1E9W3
Pfam PF00189
Panther DB PTHR11760 PTHR11760:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology K02982; RP-S3, small subunit ribosomal protein S3
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR ATCG00800 : structural constituent of ribosome
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g24416.1 : chloroplast 30S ribosomal protein S3, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057945 , Zm00025a057662 , Zm00025a057696 , Zm00025a057759 , Zm00025a057576 , Zm00025a015876 , Zm00025a057926 , Zm00025a057604 , Zm00025a057925 , Zm00025a057840 , Zm00025a058028 , Zm00025a058027 , Zm00025a058093 , Zm00025a057876
Brachypodium KQK18202 , KQK12764 , KQJ96824
Barley HORVU5Hr1G064960.1 , HORVU7Hr1G107940.2 , HORVU2Hr1G051420.1 , HORVU7Hr1G107940.1 , HORVU6Hr1G049480.1 , AGP50793 , HORVU2Hr1G043270.1 , HORVU0Hr1G026940.1 , HORVU6Hr1G037280.1 , HORVU0Hr1G026780.1 , HORVU2Hr1G062210.1 , HORVU7Hr1G065880.1
Wheat TraesCS6A02G194400 , TraesCS1A02G299700 , TraesCS7A02G289700
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Gene co-expression network
sample Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic007G207100--Sobic002G150200 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic007G207100--Sobic004G210400 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic007G207100--Sobic003G130200 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic007G207100--Sobic003G117850 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic007G207100--Sobic002G148166 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic007G207100--Sobic005G002050 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic007G207100--Sobic002G270733 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic007G207100--Sobic003G172600 Sobic001G487900 Sobic001G487900 Sobic007G207100--Sobic001G487900 Sobic002G150200--Sobic003G130200 Sobic002G150200--Sobic004G210400 Sobic002G150200--Sobic002G148166 Sobic002G150200--Sobic005G002050 Sobic002G150200--Sobic007G207100 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic002G150200--Sobic005G110493 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic002G150200--Sobic003G168425 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic002G150200--Sobic003G172701 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic002G150200--Sobic003G169300 Sobic004G210400--Sobic003G130200 Sobic004G210400--Sobic002G150200 Sobic004G210400--Sobic002G148166 Sobic004G210400--Sobic003G168425 Sobic004G210400--Sobic005G110493 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic004G210400--Sobic010G139200 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic004G210400--Sobic004G087050 Sobic004G210400--Sobic003G172701 Sobic004G210400--Sobic005G002050 Sobic003G130200--Sobic002G150200 Sobic003G130200--Sobic004G210400 Sobic003G130200--Sobic002G148166 Sobic003G130200--Sobic005G002050 Sobic003G130200--Sobic005G110493 Sobic003G130200--Sobic003G168425 Sobic003G130200--Sobic003G169300 Sobic003G130200--Sobic010G139200 Sobic003G130200--Sobic004G087050 Sobic003G117850--Sobic003G172600 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic003G117850--Sobic003G173116 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic003G117850--Sobic001G230050 Sobic003G117850--Sobic002G270733 Sobic003G117850--Sobic007G207100 Sobic003G117850--Sobic003G172701 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic003G117850--Sobic009G148950 Sobic003G117850--Sobic002G148166 Sobic003G117850--Sobic002G150200 Sobic002G148166--Sobic002G150200 Sobic002G148166--Sobic003G130200 Sobic002G148166--Sobic003G172701 Sobic002G148166--Sobic005G110493 Sobic002G148166--Sobic004G210400 Sobic002G148166--Sobic005G002050 Sobic002G148166--Sobic003G169300 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic002G148166--Sobic004G087000 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic002G148166--Sobic002G222000 Sobic005G002050--Sobic003G130200 Sobic005G002050--Sobic002G150200 Sobic005G002050--Sobic002G148166 Sobic010G254000 Sobic010G254000 Sobic005G002050--Sobic010G254000 Sobic005G002050--Sobic004G210400 Sobic005G002050--Sobic002G222000 Sobic005G002050--Sobic003G168425 Sobic005G002050--Sobic005G110493 Sobic003G166400 Sobic003G166400 Sobic005G002050--Sobic003G166400 Sobic002G270733--Sobic009G148950 Sobic002G270733--Sobic003G172701 Sobic002G270733--Sobic004G210400 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic002G270733--Sobic009G123100 Sobic002G270733--Sobic005G110493 SobicK032300 SobicK032300 Sobic002G270733--SobicK032300 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic002G270733--Sobic006G057050 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic002G270733--Sobic003G172500 Sobic002G270733--Sobic002G148166 Sobic003G172600--Sobic001G230050 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic003G172600--Sobic006G124800 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic003G172600--Sobic003G169200 Sobic003G172600--SobicK032300 Sobic003G172600--Sobic003G173116 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic003G172600--Sobic005G139900 Sobic003G172600--Sobic003G117850 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic003G172600--Sobic010G206600 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic003G172600--Sobic001G530201 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic001G487900--Sobic009G143750 Sobic001G075500 Sobic001G075500 Sobic001G487900--Sobic001G075500 Sobic001G487900--Sobic006G124800 Sobic001G487900--Sobic004G210400 Sobic001G487900--Sobic003G172600 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic001G487900--Sobic003G169100 Sobic001G487900--SobicK032300 Sobic001G487900--Sobic007G207100 Sobic001G487900--Sobic010G139200
Octagon: transcription factors


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