Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G320900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YTQ8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G117850 - -
2 Sobic.007G207100 chloroplast 30S ribosomal protein S3, putative, expressed K02982: RP-S3, small subunit ribosomal protein S3
3 Sobic.002G270733 - -
4 Sobic.001G489550 - -
5 Sobic.002G148166 - -
6 Sobic.005G093901 - -
7 Sobic.009G148950 - -
8 Sobic.002G150200 cytochrome c biogenesis protein ccsA, putative, expressed -
9 Sobic.003G172600 - -
10 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein
11 Sobic.002G288700 - K02711: photosystem II PsbJ protein
12 Sobic.003G159101 - -
13 Sobic.003G172701 - -
14 Sobic.001G230050 - K05580: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I
15 Sobic.004G210400 expressed protein -
16 Sobic.007G109200 ATP synthase epsilon chain, putative, expressed K02114: ATPF1E, F-type H+-transporting ATPase subunit epsilon
17 Sobic.003G169200 chloroplast ATP synthase a chain precursor, putative, expressed K02108: ATPF0A, F-type H+-transporting ATPase subunit a
18 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
19 Sobic.003G130200 embryonic protein DC-8, putative, expressed -
20 Sobic.003G053100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G320900 Sobic004G320900 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic004G320900--Sobic003G117850 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic004G320900--Sobic007G207100 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic004G320900--Sobic002G270733 Sobic001G489550 Sobic001G489550 Sobic004G320900--Sobic001G489550 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic004G320900--Sobic002G148166 Sobic005G093901 Sobic005G093901 Sobic004G320900--Sobic005G093901 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic004G320900--Sobic009G148950 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic004G320900--Sobic002G150200 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic004G320900--Sobic003G172600 Sobic003G117850--Sobic003G172600 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic003G117850--Sobic003G173116 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic003G117850--Sobic001G230050 Sobic003G117850--Sobic002G270733 Sobic003G117850--Sobic007G207100 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic003G117850--Sobic003G172701 Sobic003G117850--Sobic009G148950 Sobic003G117850--Sobic002G148166 Sobic003G117850--Sobic002G150200 Sobic007G207100--Sobic002G150200 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic007G207100--Sobic004G210400 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic007G207100--Sobic003G130200 Sobic007G207100--Sobic003G117850 Sobic007G207100--Sobic002G148166 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic007G207100--Sobic005G002050 Sobic007G207100--Sobic002G270733 Sobic007G207100--Sobic003G172600 Sobic001G487900 Sobic001G487900 Sobic007G207100--Sobic001G487900 Sobic002G270733--Sobic009G148950 Sobic002G270733--Sobic003G172701 Sobic002G270733--Sobic004G210400 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic002G270733--Sobic009G123100 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic002G270733--Sobic005G110493 SobicK032300 SobicK032300 Sobic002G270733--SobicK032300 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic002G270733--Sobic006G057050 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic002G270733--Sobic003G172500 Sobic002G270733--Sobic002G148166 Sobic010G008433 Sobic010G008433 Sobic001G489550--Sobic010G008433 Sobic001G489550--Sobic004G320900 Sobic001G472050 Sobic001G472050 Sobic001G489550--Sobic001G472050 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic001G489550--Sobic002G423901 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic001G489550--Sobic007G223250 Sobic001G489550--Sobic005G093901 Sobic002G288700 Sobic002G288700 Sobic001G489550--Sobic002G288700 Sobic001G489550--Sobic002G148166 Sobic010G102700 Sobic010G102700 Sobic001G489550--Sobic010G102700 Sobic002G148166--Sobic002G150200 Sobic002G148166--Sobic003G130200 Sobic002G148166--Sobic003G172701 Sobic002G148166--Sobic005G110493 Sobic002G148166--Sobic004G210400 Sobic002G148166--Sobic005G002050 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic002G148166--Sobic003G169300 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic002G148166--Sobic004G087000 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic002G148166--Sobic002G222000 Sobic002G413100 Sobic002G413100 Sobic005G093901--Sobic002G413100 Sobic005G093901--Sobic009G148950 Sobic005G093901--Sobic003G172701 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic005G093901--Sobic007G109200 Sobic005G093901--Sobic002G270733 Sobic005G093901--Sobic003G117850 Sobic005G093901--Sobic004G087000 Sobic005G093901--Sobic006G057050 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic005G093901--Sobic001G022700 Sobic009G148950--Sobic002G270733 Sobic009G148950--Sobic003G172701 Sobic009G148950--Sobic009G123100 Sobic009G148950--Sobic006G057050 Sobic009G148950--Sobic005G110493 Sobic009G148950--Sobic003G172500 Sobic009G148950--Sobic004G210400 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic009G148950--Sobic004G087050 Sobic009G148950--SobicK032300 Sobic002G150200--Sobic003G130200 Sobic002G150200--Sobic004G210400 Sobic002G150200--Sobic002G148166 Sobic002G150200--Sobic005G002050 Sobic002G150200--Sobic007G207100 Sobic002G150200--Sobic005G110493 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic002G150200--Sobic003G168425 Sobic002G150200--Sobic003G172701 Sobic002G150200--Sobic003G169300 Sobic003G172600--Sobic001G230050 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic003G172600--Sobic006G124800 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic003G172600--Sobic003G169200 Sobic003G172600--SobicK032300 Sobic003G172600--Sobic003G173116 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic003G172600--Sobic005G139900 Sobic003G172600--Sobic003G117850 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic003G172600--Sobic010G206600 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic003G172600--Sobic001G530201
Octagon: transcription factors


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