Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G172600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q3U9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK18164 , KQK05901
Barley -
Wheat TraesCS7A02G290200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G230050 - K05580: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I
2 Sobic.006G124800 - -
3 Sobic.003G169200 chloroplast ATP synthase a chain precursor, putative, expressed K02108: ATPF0A, F-type H+-transporting ATPase subunit a
4 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -
5 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein
6 Sobic.005G139900 chloroplast 30S ribosomal protein S7, putative, expressed K02992: RP-S7, MRPS7, small subunit ribosomal protein S7
7 Sobic.003G117850 - -
8 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
9 Sobic.001G530201 - -
10 Sobic.003G053100 - -
11 Sobic.005G104900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
12 Sobic.006G183100 RFC2 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 2, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
13 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
14 Sobic.001G394532 - K02110: ATPF0C, F-type H+-transporting ATPase subunit c
15 Sobic.005G139750 - -
16 Sobic.006G124700 chloroplast 30S ribosomal protein S8, putative, expressed K02994: RP-S8, small subunit ribosomal protein S8
17 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
18 Sobic.002G270733 - -
19 Sobic.009G174150 - -
20 Sobic.003G159101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic003G172600--Sobic001G230050 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic003G172600--Sobic006G124800 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic003G172600--Sobic003G169200 SobicK032300 SobicK032300 Sobic003G172600--SobicK032300 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic003G172600--Sobic003G173116 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic003G172600--Sobic005G139900 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic003G172600--Sobic003G117850 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic003G172600--Sobic010G206600 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic003G172600--Sobic001G530201 Sobic001G230050--SobicK032300 Sobic001G230050--Sobic003G169200 Sobic001G230050--Sobic010G206600 Sobic001G230050--Sobic003G172600 Sobic001G230050--Sobic003G173116 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic001G230050--Sobic001G394532 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic001G230050--Sobic006G183100 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic001G230050--Sobic003G172500 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic001G230050--Sobic006G124700 Sobic006G124800--Sobic003G172600 Sobic006G124800--SobicK032300 Sobic006G124800--Sobic001G230050 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic006G124800--Sobic007G145801 Sobic006G124800--Sobic006G183100 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic006G124800--Sobic009G123100 Sobic006G124800--Sobic010G206600 Sobic006G124800--Sobic006G124700 Sobic006G124800--Sobic003G169200 Sobic003G169200--Sobic001G230050 Sobic003G169200--Sobic010G206600 Sobic003G169200--Sobic003G172600 Sobic003G169200--Sobic005G139900 Sobic003G169200--SobicK032300 Sobic003G169200--Sobic001G394532 Sobic003G169200--Sobic003G173116 Sobic003G169200--Sobic001G530201 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic003G169200--Sobic003G159101 SobicK032300--Sobic001G230050 SobicK032300--Sobic003G172500 SobicK032300--Sobic006G124700 SobicK032300--Sobic010G206600 SobicK032300--Sobic009G123100 SobicK032300--Sobic006G183100 Sobic010G052866 Sobic010G052866 SobicK032300--Sobic010G052866 SobicK032300--Sobic006G124800 SobicK032300--Sobic003G169200 Sobic003G173116--Sobic003G159101 Sobic003G173116--Sobic001G230050 Sobic003G173116--Sobic005G139900 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic003G173116--Sobic009G174150 Sobic003G173116--Sobic003G169200 Sobic003G173116--Sobic003G172600 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic003G173116--Sobic001G535850 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic003G173116--Sobic003G053100 Sobic003G173116--Sobic010G206600 Sobic005G139900--Sobic003G169200 Sobic005G139900--Sobic003G173116 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic005G139900--Sobic004G303433 Sobic005G139900--Sobic001G535850 Sobic005G139900--Sobic003G053100 Sobic005G139900--Sobic010G206600 Sobic005G139900--Sobic003G172600 Sobic005G139900--Sobic001G530201 Sobic005G139900--Sobic001G230050 Sobic003G117850--Sobic003G172600 Sobic003G117850--Sobic003G173116 Sobic003G117850--Sobic001G230050 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic003G117850--Sobic002G270733 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic003G117850--Sobic007G207100 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic003G117850--Sobic003G172701 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic003G117850--Sobic009G148950 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic003G117850--Sobic002G148166 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic003G117850--Sobic002G150200 Sobic010G206600--Sobic001G394532 Sobic010G206600--Sobic001G230050 Sobic010G206600--Sobic003G169200 Sobic010G206600--SobicK032300 Sobic010G206600--Sobic006G183100 Sobic010G206600--Sobic006G124700 Sobic010G206600--Sobic003G172500 Sobic010G206600--Sobic005G139900 Sobic010G206600--Sobic009G174150 Sobic001G530201--Sobic003G169200 Sobic001G530201--Sobic005G139900 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic001G530201--Sobic002G083332 Sobic001G530201--Sobic001G394532 Sobic001G530201--Sobic010G206600 Sobic001G530201--Sobic003G172600 Sobic001G530201--Sobic001G230050 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic001G530201--Sobic001G182700 Sobic001G530201--SobicK032300
Octagon: transcription factors


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