Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G053100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q1M0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G139900 chloroplast 30S ribosomal protein S7, putative, expressed K02992: RP-S7, MRPS7, small subunit ribosomal protein S7
2 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein
3 Sobic.005G104900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
4 Sobic.003G172600 - -
5 Sobic.003G159101 - -
6 Sobic.003G169200 chloroplast ATP synthase a chain precursor, putative, expressed K02108: ATPF0A, F-type H+-transporting ATPase subunit a
7 Sobic.001G535850 - -
8 Sobic.004G303433 - K02950: RP-S12, MRPS12, small subunit ribosomal protein S12
9 Sobic.001G230050 - K05580: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I
10 Sobic.003G117850 - -
11 Sobic.003G161900 - -
12 Sobic.001G530201 - -
13 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
14 Sobic.005G036450 - -
15 Sobic.009G174150 - -
16 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
17 Sobic.005G139750 - -
18 Sobic.001G261444 - -
19 Sobic.003G172800 ribulose bisphosphate carboxylase large chain precursor, putative, expressed K01601: ribulose-bisphosphate carboxylase large chain
20 Sobic.003G208200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic003G053100--Sobic005G139900 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic003G053100--Sobic003G173116 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic003G053100--Sobic005G104900 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic003G053100--Sobic003G172600 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic003G053100--Sobic003G159101 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic003G053100--Sobic003G169200 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic003G053100--Sobic001G535850 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic003G053100--Sobic004G303433 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic003G053100--Sobic001G230050 Sobic005G139900--Sobic003G169200 Sobic005G139900--Sobic003G173116 Sobic005G139900--Sobic004G303433 Sobic005G139900--Sobic001G535850 Sobic005G139900--Sobic003G053100 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic005G139900--Sobic010G206600 Sobic005G139900--Sobic003G172600 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic005G139900--Sobic001G530201 Sobic005G139900--Sobic001G230050 Sobic003G173116--Sobic003G159101 Sobic003G173116--Sobic001G230050 Sobic003G173116--Sobic005G139900 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic003G173116--Sobic009G174150 Sobic003G173116--Sobic003G169200 Sobic003G173116--Sobic003G172600 Sobic003G173116--Sobic001G535850 Sobic003G173116--Sobic003G053100 Sobic003G173116--Sobic010G206600 Sobic005G104900--Sobic005G139900 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic005G104900--Sobic005G139750 Sobic005G104900--Sobic003G173116 Sobic005G104900--Sobic003G053100 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic005G104900--Sobic003G161900 Sobic005G104900--Sobic001G535850 Sobic005G104900--Sobic003G172600 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic005G104900--Sobic001G022700 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic005G104900--Sobic004G077700 Sobic003G172600--Sobic001G230050 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic003G172600--Sobic006G124800 Sobic003G172600--Sobic003G169200 SobicK032300 SobicK032300 Sobic003G172600--SobicK032300 Sobic003G172600--Sobic003G173116 Sobic003G172600--Sobic005G139900 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic003G172600--Sobic003G117850 Sobic003G172600--Sobic010G206600 Sobic003G172600--Sobic001G530201 Sobic003G159101--Sobic003G173116 Sobic005G036450 Sobic005G036450 Sobic003G159101--Sobic005G036450 Sobic003G159101--Sobic003G169200 Sobic003G159101--Sobic005G139900 Sobic003G159101--Sobic004G303433 Sobic003G159101--Sobic001G230050 Sobic003G159101--Sobic009G174150 Sobic003G159101--Sobic001G535850 Sobic003G159101--Sobic003G053100 Sobic003G169200--Sobic001G230050 Sobic003G169200--Sobic010G206600 Sobic003G169200--Sobic003G172600 Sobic003G169200--Sobic005G139900 Sobic003G169200--SobicK032300 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic003G169200--Sobic001G394532 Sobic003G169200--Sobic003G173116 Sobic003G169200--Sobic001G530201 Sobic003G169200--Sobic003G159101 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic001G535850--Sobic003G286450 Sobic001G535850--Sobic005G139900 Sobic001G535850--Sobic004G303433 Sobic001G535850--Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic001G394532 Sobic001G535850--Sobic010G206600 Sobic001G535850--Sobic005G139750 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic001G535850--Sobic001G154000 Sobic001G535850--Sobic005G104900 Sobic004G303433--Sobic005G139900 Sobic004G303433--Sobic001G535850 Sobic004G303433--Sobic003G159101 Sobic004G303433--Sobic001G394532 Sobic004G303433--Sobic005G036450 Sobic005G184900 Sobic005G184900 Sobic004G303433--Sobic005G184900 Sobic004G303433--Sobic003G286450 Sobic004G303433--Sobic003G169200 Sobic004G303433--Sobic003G173116 Sobic001G230050--SobicK032300 Sobic001G230050--Sobic003G169200 Sobic001G230050--Sobic010G206600 Sobic001G230050--Sobic003G172600 Sobic001G230050--Sobic003G173116 Sobic001G230050--Sobic001G394532 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic001G230050--Sobic006G183100 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic001G230050--Sobic003G172500 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic001G230050--Sobic006G124700
Octagon: transcription factors


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