Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G104900.1
Synonym Sb05g009490
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
expressed protein
UniProt C5Y1Z3
Pfam -
Panther DB PTHR37763 PTHR37763:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G25500 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g10110.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012711
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G017110.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G139900 chloroplast 30S ribosomal protein S7, putative, expressed K02992: RP-S7, MRPS7, small subunit ribosomal protein S7
2 Sobic.005G139750 - -
3 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein
4 Sobic.003G053100 - -
5 Sobic.003G161900 - -
6 Sobic.001G535850 - -
7 Sobic.003G172600 - -
8 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
9 Sobic.004G077700 - -
10 Sobic.002G401533 - -
11 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
12 Sobic.001G230050 - K05580: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I
13 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
14 Sobic.003G169200 chloroplast ATP synthase a chain precursor, putative, expressed K02108: ATPF0A, F-type H+-transporting ATPase subunit a
15 Sobic.006G183100 RFC2 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 2, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
16 Sobic.006G124800 - -
17 Sobic.009G174150 - -
18 Sobic.003G286450 - -
19 Sobic.001G394532 - K02110: ATPF0C, F-type H+-transporting ATPase subunit c
20 Sobic.001G530201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic005G104900--Sobic005G139900 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic005G104900--Sobic005G139750 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic005G104900--Sobic003G173116 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic005G104900--Sobic003G053100 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic005G104900--Sobic003G161900 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic005G104900--Sobic001G535850 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic005G104900--Sobic003G172600 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic005G104900--Sobic001G022700 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic005G104900--Sobic004G077700 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic005G139900--Sobic003G169200 Sobic005G139900--Sobic003G173116 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic005G139900--Sobic004G303433 Sobic005G139900--Sobic001G535850 Sobic005G139900--Sobic003G053100 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic005G139900--Sobic010G206600 Sobic005G139900--Sobic003G172600 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic005G139900--Sobic001G530201 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic005G139900--Sobic001G230050 Sobic005G139750--Sobic001G022700 Sobic005G139750--Sobic004G077700 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic005G139750--Sobic007G145801 Sobic005G139750--Sobic010G206600 Sobic005G139750--Sobic001G535850 Sobic005G139750--Sobic005G104900 Sobic005G139750--Sobic003G173116 Sobic005G139750--Sobic001G230050 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic005G139750--Sobic003G286450 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic003G173116--Sobic003G159101 Sobic003G173116--Sobic001G230050 Sobic003G173116--Sobic005G139900 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic003G173116--Sobic009G174150 Sobic003G173116--Sobic003G169200 Sobic003G173116--Sobic003G172600 Sobic003G173116--Sobic001G535850 Sobic003G173116--Sobic003G053100 Sobic003G173116--Sobic010G206600 Sobic003G053100--Sobic005G139900 Sobic003G053100--Sobic003G173116 Sobic003G053100--Sobic005G104900 Sobic003G053100--Sobic003G172600 Sobic003G053100--Sobic003G159101 Sobic003G053100--Sobic003G169200 Sobic003G053100--Sobic001G535850 Sobic003G053100--Sobic004G303433 Sobic003G053100--Sobic001G230050 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic003G161900--Sobic002G401533 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic003G161900--Sobic001G261444 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic003G161900--Sobic006G107700 Sobic003G161900--Sobic005G104900 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic003G161900--Sobic003G208200 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic003G161900--Sobic009G077000 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic003G161900--Sobic001G475950 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic003G161900--Sobic003G056200 SobicK032200 SobicK032200 Sobic003G161900--SobicK032200 Sobic001G535850--Sobic003G286450 Sobic001G535850--Sobic005G139900 Sobic001G535850--Sobic004G303433 Sobic001G535850--Sobic003G173116 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic001G535850--Sobic001G394532 Sobic001G535850--Sobic010G206600 Sobic001G535850--Sobic005G139750 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic001G535850--Sobic001G154000 Sobic001G535850--Sobic005G104900 Sobic003G172600--Sobic001G230050 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic003G172600--Sobic006G124800 Sobic003G172600--Sobic003G169200 SobicK032300 SobicK032300 Sobic003G172600--SobicK032300 Sobic003G172600--Sobic003G173116 Sobic003G172600--Sobic005G139900 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic003G172600--Sobic003G117850 Sobic003G172600--Sobic010G206600 Sobic003G172600--Sobic001G530201 Sobic001G022700--Sobic005G139750 Sobic001G022700--Sobic004G077700 Sobic001G022700--Sobic003G173116 Sobic001G022700--Sobic007G145801 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic001G022700--Sobic009G148950 Sobic001G022700--Sobic005G104900 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic001G022700--Sobic009G123100 Sobic001G022700--Sobic001G230050 Sobic001G022700--Sobic009G174150 Sobic004G077700--Sobic005G139750 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic004G077700--Sobic009G101500 Sobic004G077700--Sobic001G022700 Sobic004G077700--Sobic007G145801 Sobic004G077700--Sobic005G104900 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic004G077700--Sobic001G182700 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic004G077700--Sobic002G159750 Sobic004G077700--Sobic001G535850 Sobic004G077700--Sobic002G401533
Octagon: transcription factors


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