Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G124800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PLN7 , A0A109NDA7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ96828 , KQJ94641 , KQK18193
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G172600 - -
2 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -
3 Sobic.001G230050 - K05580: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I
4 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
5 Sobic.006G183100 RFC2 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 2, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
6 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
7 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
8 Sobic.006G124700 chloroplast 30S ribosomal protein S8, putative, expressed K02994: RP-S8, small subunit ribosomal protein S8
9 Sobic.003G169200 chloroplast ATP synthase a chain precursor, putative, expressed K02108: ATPF0A, F-type H+-transporting ATPase subunit a
10 Sobic.003G169100 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed K02704: photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein
11 Sobic.003G172500 - -
12 Sobic.002G270733 - -
13 Sobic.001G182700 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
14 Sobic.001G075500 - -
15 Sobic.009G148950 - -
16 Sobic.004G210400 expressed protein -
17 Sobic.005G139750 - -
18 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein
19 Sobic.010G139200 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed -
20 Sobic.001G394532 - K02110: ATPF0C, F-type H+-transporting ATPase subunit c


Gene co-expression network
sample Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic006G124800--Sobic003G172600 SobicK032300 SobicK032300 Sobic006G124800--SobicK032300 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic006G124800--Sobic001G230050 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic006G124800--Sobic007G145801 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic006G124800--Sobic006G183100 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic006G124800--Sobic009G123100 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic006G124800--Sobic010G206600 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic006G124800--Sobic006G124700 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic006G124800--Sobic003G169200 Sobic003G172600--Sobic001G230050 Sobic003G172600--Sobic006G124800 Sobic003G172600--Sobic003G169200 Sobic003G172600--SobicK032300 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic003G172600--Sobic003G173116 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic003G172600--Sobic005G139900 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic003G172600--Sobic003G117850 Sobic003G172600--Sobic010G206600 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic003G172600--Sobic001G530201 SobicK032300--Sobic001G230050 Sobic003G172500 Sobic003G172500 SobicK032300--Sobic003G172500 SobicK032300--Sobic006G124700 SobicK032300--Sobic010G206600 SobicK032300--Sobic009G123100 SobicK032300--Sobic006G183100 Sobic010G052866 Sobic010G052866 SobicK032300--Sobic010G052866 SobicK032300--Sobic006G124800 SobicK032300--Sobic003G169200 Sobic001G230050--SobicK032300 Sobic001G230050--Sobic003G169200 Sobic001G230050--Sobic010G206600 Sobic001G230050--Sobic003G172600 Sobic001G230050--Sobic003G173116 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic001G230050--Sobic001G394532 Sobic001G230050--Sobic006G183100 Sobic001G230050--Sobic003G172500 Sobic001G230050--Sobic006G124700 Sobic007G145801--Sobic009G123100 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic007G145801--Sobic003G169100 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic007G145801--Sobic005G139750 Sobic007G145801--Sobic006G124800 Sobic007G145801--SobicK032300 Sobic007G145801--Sobic010G206600 Sobic007G145801--Sobic006G183100 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic007G145801--Sobic009G148950 Sobic007G145801--Sobic006G124700 Sobic006G183100--SobicK032300 Sobic006G183100--Sobic006G124700 Sobic006G183100--Sobic001G230050 Sobic006G183100--Sobic010G206600 Sobic006G183100--Sobic003G172500 Sobic006G183100--Sobic009G123100 Sobic006G183100--Sobic001G394532 Sobic006G183100--Sobic006G124800 Sobic006G183100--Sobic007G145801 Sobic009G123100--Sobic003G172500 Sobic009G123100--Sobic009G148950 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic009G123100--Sobic004G087050 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic009G123100--Sobic006G057050 Sobic009G123100--SobicK032300 Sobic009G123100--Sobic007G145801 Sobic009G123100--Sobic006G124700 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic009G123100--Sobic010G139200 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic009G123100--Sobic004G337850 Sobic010G206600--Sobic001G394532 Sobic010G206600--Sobic001G230050 Sobic010G206600--Sobic003G169200 Sobic010G206600--SobicK032300 Sobic010G206600--Sobic006G183100 Sobic010G206600--Sobic006G124700 Sobic010G206600--Sobic003G172500 Sobic010G206600--Sobic005G139900 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic010G206600--Sobic009G174150 Sobic006G124700--SobicK032300 Sobic006G124700--Sobic003G172500 Sobic006G124700--Sobic006G183100 Sobic006G124700--Sobic009G123100 Sobic006G124700--Sobic001G230050 Sobic006G124700--Sobic010G206600 Sobic006G124700--Sobic010G052866 Sobic006G124700--Sobic004G087050 Sobic006G124700--Sobic010G139200 Sobic003G169200--Sobic001G230050 Sobic003G169200--Sobic010G206600 Sobic003G169200--Sobic003G172600 Sobic003G169200--Sobic005G139900 Sobic003G169200--SobicK032300 Sobic003G169200--Sobic001G394532 Sobic003G169200--Sobic003G173116 Sobic003G169200--Sobic001G530201 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic003G169200--Sobic003G159101
Octagon: transcription factors


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