Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G145801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R9X2 , A1E9Q7
Pfam PF02533
Panther DB PTHR35325 PTHR35325:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology K02712; photosystem II PsbK protein
Gene Ontology GO:0015979; photosynthesis GO:0009539photosystem II reaction center GO:0009523photosystem II


Orthologs (automatic annotation)
TAIR ATCG00070 : photosystem II reaction center protein K precursor
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g16866.1 : photosystem II reaction center protein K precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057698 , Zm00025a010041 , Zm00025a057597 , Zm00025a010034 , Zm00025a057877
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
2 Sobic.003G169100 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed K02704: photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein
3 Sobic.005G139750 - -
4 Sobic.006G124800 - -
5 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -
6 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
7 Sobic.006G183100 RFC2 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 2, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
8 Sobic.009G148950 - -
9 Sobic.006G124700 chloroplast 30S ribosomal protein S8, putative, expressed K02994: RP-S8, small subunit ribosomal protein S8
10 Sobic.003G172500 - -
11 Sobic.004G337850 - -
12 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
13 Sobic.007G065000 proton-dependent oligopeptide transport, putative, expressed -
14 Sobic.004G077700 - -
15 Sobic.001G230050 - K05580: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I
16 Sobic.002G270733 - -
17 Sobic.003G169000 - K02718: photosystem II PsbT protein
18 Sobic.003G172600 - -
19 Sobic.006G057050 - -
20 Sobic.010G035600 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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