Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G077700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YN85
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G139750 - -
2 Sobic.009G101500 - -
3 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
4 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
5 Sobic.005G104900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
6 Sobic.001G182700 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
7 Sobic.002G159750 - -
8 Sobic.001G535850 - -
9 Sobic.002G401533 - -
10 Sobic.003G286450 - -
11 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
12 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
13 Sobic.010G035600 - -
14 Sobic.001G182800 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
15 Sobic.007G065000 proton-dependent oligopeptide transport, putative, expressed -
16 Sobic.001G107550 - -
17 Sobic.006G124800 - -
18 Sobic.001G094550 - -
19 Sobic.003G172600 - -
20 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein


Gene co-expression network
sample Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic004G077700--Sobic005G139750 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic004G077700--Sobic009G101500 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic004G077700--Sobic001G022700 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic004G077700--Sobic007G145801 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic004G077700--Sobic005G104900 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic004G077700--Sobic001G182700 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic004G077700--Sobic002G159750 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic004G077700--Sobic001G535850 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic004G077700--Sobic002G401533 Sobic005G139750--Sobic001G022700 Sobic005G139750--Sobic004G077700 Sobic005G139750--Sobic007G145801 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic005G139750--Sobic010G206600 Sobic005G139750--Sobic001G535850 Sobic005G139750--Sobic005G104900 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic005G139750--Sobic003G173116 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic005G139750--Sobic001G230050 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic005G139750--Sobic003G286450 Sobic009G101500--Sobic004G077700 Sobic009G101500--Sobic005G139750 Sobic009G101500--Sobic001G022700 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic009G101500--Sobic006G131700 Sobic009G101500--Sobic007G145801 Sobic001G094550 Sobic001G094550 Sobic009G101500--Sobic001G094550 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic009G101500--Sobic004G337850 Sobic009G101500--Sobic001G182700 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic009G101500--Sobic001G182800 Sobic001G022700--Sobic005G139750 Sobic001G022700--Sobic004G077700 Sobic001G022700--Sobic003G173116 Sobic001G022700--Sobic007G145801 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic001G022700--Sobic009G148950 Sobic001G022700--Sobic005G104900 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic001G022700--Sobic009G123100 Sobic001G022700--Sobic001G230050 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic001G022700--Sobic009G174150 Sobic007G145801--Sobic009G123100 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic007G145801--Sobic003G169100 Sobic007G145801--Sobic005G139750 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic007G145801--Sobic006G124800 SobicK032300 SobicK032300 Sobic007G145801--SobicK032300 Sobic007G145801--Sobic010G206600 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic007G145801--Sobic006G183100 Sobic007G145801--Sobic009G148950 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic007G145801--Sobic006G124700 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic005G104900--Sobic005G139900 Sobic005G104900--Sobic005G139750 Sobic005G104900--Sobic003G173116 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic005G104900--Sobic003G053100 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic005G104900--Sobic003G161900 Sobic005G104900--Sobic001G535850 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic005G104900--Sobic003G172600 Sobic005G104900--Sobic001G022700 Sobic005G104900--Sobic004G077700 Sobic001G182700--Sobic001G182800 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic001G182700--Sobic001G530201 Sobic001G182700--Sobic006G124800 Sobic001G182700--Sobic005G139750 Sobic001G182700--Sobic010G206600 Sobic001G182700--SobicK032300 Sobic001G182700--Sobic007G145801 Sobic001G182700--Sobic004G077700 Sobic001G182700--Sobic003G169100 Sobic002G159750--Sobic003G286450 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic002G159750--Sobic002G083332 Sobic002G159750--Sobic001G535850 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic002G159750--Sobic001G476800 Sobic002G159750--Sobic005G139750 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic002G159750--Sobic001G394532 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic002G159750--Sobic001G182900 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic002G159750--Sobic010G175550 Sobic002G159750--Sobic004G077700 Sobic001G535850--Sobic003G286450 Sobic001G535850--Sobic005G139900 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic001G535850--Sobic004G303433 Sobic001G535850--Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic001G394532 Sobic001G535850--Sobic010G206600 Sobic001G535850--Sobic005G139750 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic001G535850--Sobic001G154000 Sobic001G535850--Sobic005G104900 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic002G401533--Sobic006G107700 Sobic002G401533--Sobic003G161900 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic002G401533--Sobic003G056200 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic002G401533--Sobic001G475950 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic002G401533--Sobic001G261444 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic002G401533--Sobic009G077000 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic002G401533--Sobic003G172966 SobicK032200 SobicK032200 Sobic002G401533--SobicK032200 Sobic002G401533--Sobic005G104900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.