Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G535850.2,Sobic.001G535850.6,Sobic.001G535850.4,Sobic.001G535850.1,Sobic.001G535850.5,Sobic.001G535850.3
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SBW6 , A0A1Z5SC33
Pfam -
Panther DB PTHR31704 PTHR31704:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g16400.1 : transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G286450 - -
2 Sobic.005G139900 chloroplast 30S ribosomal protein S7, putative, expressed K02992: RP-S7, MRPS7, small subunit ribosomal protein S7
3 Sobic.004G303433 - K02950: RP-S12, MRPS12, small subunit ribosomal protein S12
4 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein
5 Sobic.001G394532 - K02110: ATPF0C, F-type H+-transporting ATPase subunit c
6 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
7 Sobic.005G139750 - -
8 Sobic.001G154000 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.005G104900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
10 Sobic.009G174150 - -
11 Sobic.003G159101 - -
12 Sobic.002G159750 - -
13 Sobic.004G019550 - -
14 Sobic.003G169200 chloroplast ATP synthase a chain precursor, putative, expressed K02108: ATPF0A, F-type H+-transporting ATPase subunit a
15 Sobic.001G230050 - K05580: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I
16 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
17 Sobic.003G053100 - -
18 Sobic.010G035600 - -
19 Sobic.005G036450 - -
20 Sobic.001G530201 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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