Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G159101.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VXG8
Pfam PF02874
Panther DB PTHR15184 PTHR15184:SF43
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR ATCG00480 : ATP synthase subunit beta
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g10570.1 : ATP synthase subunit beta, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057670 , Zm00025a057754 , Zm00025a057709 , Zm00025a057582 , Zm00025a057721 , Zm00025a057612 , Zm00025a057688 , Zm00025a057921 , Zm00025a012674
Brachypodium KQK05579 , KQJ96832 , KQK18173 , KQK04348 , PNT67424 , PNT60816
Barley HORVU0Hr1G031360.2 , HORVU5Hr1G064710.3 , HORVU0Hr1G033790.1 , HORVU5Hr1G064690.9 , HORVU0Hr1G029780.1 , HORVU3Hr1G053770.3 , HORVU3Hr1G053770.2 , HORVU3Hr1G053770.1 , AGP50762 , HORVU5Hr1G064710.1 , HORVU5Hr1G064710.2 , HORVU6Hr1G049250.6 , HORVU6Hr1G049250.7
Wheat TraesCS5D02G010300 , TraesCS2D02G584400 , TraesCS3D02G338500 , TraesCS1D02G181600 , TraesCS6D02G181900
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein
2 Sobic.005G036450 - -
3 Sobic.003G169200 chloroplast ATP synthase a chain precursor, putative, expressed K02108: ATPF0A, F-type H+-transporting ATPase subunit a
4 Sobic.005G139900 chloroplast 30S ribosomal protein S7, putative, expressed K02992: RP-S7, MRPS7, small subunit ribosomal protein S7
5 Sobic.004G303433 - K02950: RP-S12, MRPS12, small subunit ribosomal protein S12
6 Sobic.001G230050 - K05580: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I
7 Sobic.009G174150 - -
8 Sobic.001G535850 - -
9 Sobic.003G053100 - -
10 Sobic.001G394532 - K02110: ATPF0C, F-type H+-transporting ATPase subunit c
11 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
12 Sobic.003G117850 - -
13 Sobic.003G172600 - -
14 Sobic.010G052866 - K02892: RP-L23, MRPL23, large subunit ribosomal protein L23
15 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -
16 Sobic.005G184900 - -
17 Sobic.001G530201 - -
18 Sobic.005G139750 - -
19 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
20 Sobic.003G286450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic003G159101--Sobic003G173116 Sobic005G036450 Sobic005G036450 Sobic003G159101--Sobic005G036450 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic003G159101--Sobic003G169200 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic003G159101--Sobic005G139900 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic003G159101--Sobic004G303433 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic003G159101--Sobic001G230050 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic003G159101--Sobic009G174150 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic003G159101--Sobic001G535850 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic003G159101--Sobic003G053100 Sobic003G173116--Sobic003G159101 Sobic003G173116--Sobic001G230050 Sobic003G173116--Sobic005G139900 Sobic003G173116--Sobic009G174150 Sobic003G173116--Sobic003G169200 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic003G173116--Sobic003G172600 Sobic003G173116--Sobic001G535850 Sobic003G173116--Sobic003G053100 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic003G173116--Sobic010G206600 Sobic005G036450--Sobic003G159101 Sobic005G036450--Sobic004G303433 Sobic005G036450--Sobic003G173116 Sobic005G036450--Sobic005G139900 Sobic005G036450--Sobic003G169200 Sobic005G036450--Sobic001G535850 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic005G036450--Sobic001G394532 Sobic005G036450--Sobic009G174150 Sobic005G036450--Sobic001G230050 Sobic003G169200--Sobic001G230050 Sobic003G169200--Sobic010G206600 Sobic003G169200--Sobic003G172600 Sobic003G169200--Sobic005G139900 SobicK032300 SobicK032300 Sobic003G169200--SobicK032300 Sobic003G169200--Sobic001G394532 Sobic003G169200--Sobic003G173116 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic003G169200--Sobic001G530201 Sobic003G169200--Sobic003G159101 Sobic005G139900--Sobic003G169200 Sobic005G139900--Sobic003G173116 Sobic005G139900--Sobic004G303433 Sobic005G139900--Sobic001G535850 Sobic005G139900--Sobic003G053100 Sobic005G139900--Sobic010G206600 Sobic005G139900--Sobic003G172600 Sobic005G139900--Sobic001G530201 Sobic005G139900--Sobic001G230050 Sobic004G303433--Sobic005G139900 Sobic004G303433--Sobic001G535850 Sobic004G303433--Sobic003G159101 Sobic004G303433--Sobic001G394532 Sobic004G303433--Sobic005G036450 Sobic005G184900 Sobic005G184900 Sobic004G303433--Sobic005G184900 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic004G303433--Sobic003G286450 Sobic004G303433--Sobic003G169200 Sobic004G303433--Sobic003G173116 Sobic001G230050--SobicK032300 Sobic001G230050--Sobic003G169200 Sobic001G230050--Sobic010G206600 Sobic001G230050--Sobic003G172600 Sobic001G230050--Sobic003G173116 Sobic001G230050--Sobic001G394532 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic001G230050--Sobic006G183100 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic001G230050--Sobic003G172500 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic001G230050--Sobic006G124700 Sobic009G174150--Sobic003G173116 Sobic009G174150--Sobic001G230050 Sobic009G174150--Sobic010G206600 Sobic009G174150--Sobic003G169200 Sobic009G174150--Sobic001G394532 Sobic009G174150--Sobic003G159101 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic009G174150--Sobic010G052866 Sobic009G174150--Sobic001G535850 Sobic009G174150--SobicK032300 Sobic001G535850--Sobic003G286450 Sobic001G535850--Sobic005G139900 Sobic001G535850--Sobic004G303433 Sobic001G535850--Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic001G394532 Sobic001G535850--Sobic010G206600 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic001G535850--Sobic005G139750 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic001G535850--Sobic001G154000 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic001G535850--Sobic005G104900 Sobic003G053100--Sobic005G139900 Sobic003G053100--Sobic003G173116 Sobic003G053100--Sobic005G104900 Sobic003G053100--Sobic003G172600 Sobic003G053100--Sobic003G159101 Sobic003G053100--Sobic003G169200 Sobic003G053100--Sobic001G535850 Sobic003G053100--Sobic004G303433 Sobic003G053100--Sobic001G230050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.