Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G139750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJQ5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
2 Sobic.004G077700 - -
3 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
4 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
5 Sobic.001G535850 - -
6 Sobic.005G104900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
7 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein
8 Sobic.001G230050 - K05580: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I
9 Sobic.003G286450 - -
10 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
11 Sobic.009G101500 - -
12 Sobic.009G174150 - -
13 Sobic.010G035600 - -
14 Sobic.001G182700 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
15 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -
16 Sobic.009G148950 - -
17 Sobic.003G172600 - -
18 Sobic.001G394532 - K02110: ATPF0C, F-type H+-transporting ATPase subunit c
19 Sobic.006G183100 RFC2 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 2, expressed K10755: replication factor C subunit 2/4
20 Sobic.006G124800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic005G139750--Sobic001G022700 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic005G139750--Sobic004G077700 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic005G139750--Sobic007G145801 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic005G139750--Sobic010G206600 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic005G139750--Sobic001G535850 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic005G139750--Sobic005G104900 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic005G139750--Sobic003G173116 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic005G139750--Sobic001G230050 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic005G139750--Sobic003G286450 Sobic001G022700--Sobic005G139750 Sobic001G022700--Sobic004G077700 Sobic001G022700--Sobic003G173116 Sobic001G022700--Sobic007G145801 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic001G022700--Sobic009G148950 Sobic001G022700--Sobic005G104900 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic001G022700--Sobic009G123100 Sobic001G022700--Sobic001G230050 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic001G022700--Sobic009G174150 Sobic004G077700--Sobic005G139750 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic004G077700--Sobic009G101500 Sobic004G077700--Sobic001G022700 Sobic004G077700--Sobic007G145801 Sobic004G077700--Sobic005G104900 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic004G077700--Sobic001G182700 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic004G077700--Sobic002G159750 Sobic004G077700--Sobic001G535850 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic004G077700--Sobic002G401533 Sobic007G145801--Sobic009G123100 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic007G145801--Sobic003G169100 Sobic007G145801--Sobic005G139750 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic007G145801--Sobic006G124800 SobicK032300 SobicK032300 Sobic007G145801--SobicK032300 Sobic007G145801--Sobic010G206600 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic007G145801--Sobic006G183100 Sobic007G145801--Sobic009G148950 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic007G145801--Sobic006G124700 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic010G206600--Sobic001G394532 Sobic010G206600--Sobic001G230050 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic010G206600--Sobic003G169200 Sobic010G206600--SobicK032300 Sobic010G206600--Sobic006G183100 Sobic010G206600--Sobic006G124700 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic010G206600--Sobic003G172500 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic010G206600--Sobic005G139900 Sobic010G206600--Sobic009G174150 Sobic001G535850--Sobic003G286450 Sobic001G535850--Sobic005G139900 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic001G535850--Sobic004G303433 Sobic001G535850--Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic001G394532 Sobic001G535850--Sobic010G206600 Sobic001G535850--Sobic005G139750 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic001G535850--Sobic001G154000 Sobic001G535850--Sobic005G104900 Sobic005G104900--Sobic005G139900 Sobic005G104900--Sobic005G139750 Sobic005G104900--Sobic003G173116 Sobic003G053100 Sobic003G053100 Sobic005G104900--Sobic003G053100 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic005G104900--Sobic003G161900 Sobic005G104900--Sobic001G535850 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic005G104900--Sobic003G172600 Sobic005G104900--Sobic001G022700 Sobic005G104900--Sobic004G077700 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic003G173116--Sobic003G159101 Sobic003G173116--Sobic001G230050 Sobic003G173116--Sobic005G139900 Sobic003G173116--Sobic009G174150 Sobic003G173116--Sobic003G169200 Sobic003G173116--Sobic003G172600 Sobic003G173116--Sobic001G535850 Sobic003G173116--Sobic003G053100 Sobic003G173116--Sobic010G206600 Sobic001G230050--SobicK032300 Sobic001G230050--Sobic003G169200 Sobic001G230050--Sobic010G206600 Sobic001G230050--Sobic003G172600 Sobic001G230050--Sobic003G173116 Sobic001G230050--Sobic001G394532 Sobic001G230050--Sobic006G183100 Sobic001G230050--Sobic003G172500 Sobic001G230050--Sobic006G124700 Sobic003G286450--Sobic001G535850 Sobic003G286450--Sobic002G159750 Sobic003G286450--Sobic001G154000 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic003G286450--Sobic004G019550 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic003G286450--Sobic001G476800 Sobic003G286450--Sobic001G394532 Sobic003G286450--Sobic005G139750 Sobic003G286450--Sobic004G303433 Sobic003G286450--Sobic010G206600
Octagon: transcription factors


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