Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G182700.1
Synonym
Functional annotation disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S6K3
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF637
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14470 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g38330.1 : disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G182800 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
2 Sobic.001G530201 - -
3 Sobic.006G124800 - -
4 Sobic.005G139750 - -
5 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
6 Sobic.K032300 uncharacterized protein ycf72, putative -
7 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
8 Sobic.004G077700 - -
9 Sobic.003G169100 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed K02704: photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein
10 Sobic.001G075500 - -
11 Sobic.001G230050 - K05580: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I
12 Sobic.002G083332 - -
13 Sobic.003G172600 - -
14 Sobic.009G123100 - K02710: photosystem II PsbI protein
K02712: photosystem II PsbK protein
15 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
16 Sobic.002G159750 - -
17 Sobic.001G394532 - K02110: ATPF0C, F-type H+-transporting ATPase subunit c
18 Sobic.003G369533 - -
19 Sobic.006G124700 chloroplast 30S ribosomal protein S8, putative, expressed K02994: RP-S8, small subunit ribosomal protein S8
20 Sobic.007G065000 proton-dependent oligopeptide transport, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic001G182700--Sobic001G182800 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic001G182700--Sobic001G530201 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic001G182700--Sobic006G124800 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic001G182700--Sobic005G139750 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic001G182700--Sobic010G206600 SobicK032300 SobicK032300 Sobic001G182700--SobicK032300 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic001G182700--Sobic007G145801 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic001G182700--Sobic004G077700 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic001G182700--Sobic003G169100 Sobic001G182800--Sobic001G182700 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic001G182800--Sobic003G369533 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic001G182800--Sobic001G182900 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic001G182800--Sobic002G165200 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic001G182800--Sobic003G218950 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic001G182800--Sobic010G185250 Sobic003G369566 Sobic003G369566 Sobic001G182800--Sobic003G369566 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic001G182800--Sobic002G159750 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic001G182800--Sobic007G065000 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic001G530201--Sobic003G169200 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic001G530201--Sobic005G139900 Sobic002G083332 Sobic002G083332 Sobic001G530201--Sobic002G083332 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic001G530201--Sobic001G394532 Sobic001G530201--Sobic010G206600 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic001G530201--Sobic003G172600 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic001G530201--Sobic001G230050 Sobic001G530201--Sobic001G182700 Sobic001G530201--SobicK032300 Sobic006G124800--Sobic003G172600 Sobic006G124800--SobicK032300 Sobic006G124800--Sobic001G230050 Sobic006G124800--Sobic007G145801 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic006G124800--Sobic006G183100 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic006G124800--Sobic009G123100 Sobic006G124800--Sobic010G206600 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic006G124800--Sobic006G124700 Sobic006G124800--Sobic003G169200 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic005G139750--Sobic001G022700 Sobic005G139750--Sobic004G077700 Sobic005G139750--Sobic007G145801 Sobic005G139750--Sobic010G206600 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic005G139750--Sobic001G535850 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic005G139750--Sobic005G104900 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic005G139750--Sobic003G173116 Sobic005G139750--Sobic001G230050 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic005G139750--Sobic003G286450 Sobic010G206600--Sobic001G394532 Sobic010G206600--Sobic001G230050 Sobic010G206600--Sobic003G169200 Sobic010G206600--SobicK032300 Sobic010G206600--Sobic006G183100 Sobic010G206600--Sobic006G124700 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic010G206600--Sobic003G172500 Sobic010G206600--Sobic005G139900 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic010G206600--Sobic009G174150 SobicK032300--Sobic001G230050 SobicK032300--Sobic003G172500 SobicK032300--Sobic006G124700 SobicK032300--Sobic010G206600 SobicK032300--Sobic009G123100 SobicK032300--Sobic006G183100 Sobic010G052866 Sobic010G052866 SobicK032300--Sobic010G052866 SobicK032300--Sobic006G124800 SobicK032300--Sobic003G169200 Sobic007G145801--Sobic009G123100 Sobic007G145801--Sobic003G169100 Sobic007G145801--Sobic005G139750 Sobic007G145801--Sobic006G124800 Sobic007G145801--SobicK032300 Sobic007G145801--Sobic010G206600 Sobic007G145801--Sobic006G183100 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic007G145801--Sobic009G148950 Sobic007G145801--Sobic006G124700 Sobic004G077700--Sobic005G139750 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic004G077700--Sobic009G101500 Sobic004G077700--Sobic001G022700 Sobic004G077700--Sobic007G145801 Sobic004G077700--Sobic005G104900 Sobic004G077700--Sobic001G182700 Sobic004G077700--Sobic002G159750 Sobic004G077700--Sobic001G535850 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic004G077700--Sobic002G401533 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic003G169100--Sobic003G169000 Sobic003G169100--Sobic007G065000 Sobic003G169100--Sobic007G145801 Sobic003G169100--Sobic009G123100 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic003G169100--Sobic003G168200 Sobic003G169100--SobicK032300 Sobic007G149200 Sobic007G149200 Sobic003G169100--Sobic007G149200 Sobic003G169100--Sobic003G172500 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic003G169100--Sobic010G139200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.