Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G154000.1
Synonym Sb01g013380, UCC1
Functional annotation plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5WR53
Pfam PF02298
Panther DB PTHR33021 PTHR33021:SF34
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0009055; electron transfer activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G32300 : uclacyanin 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g44630.1 : plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5D02G382300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G019550 - -
2 Sobic.001G535850 - -
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8 Sobic.001G476800 - -
9 Sobic.005G139750 - -
10 Sobic.003G168800 photosystem II reaction center protein H, putative, expressed K02709: photosystem II PsbH protein
11 Sobic.001G450900 UNE2, putative, expressed -
12 Sobic.001G394532 - K02110: ATPF0C, F-type H+-transporting ATPase subunit c
13 Sobic.003G173116 - K02724: photosystem II PsbZ protein
14 Sobic.010G206600 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
15 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
16 Sobic.010G052866 - K02892: RP-L23, MRPL23, large subunit ribosomal protein L23
17 Sobic.003G159101 - -
18 Sobic.006G135701 - -
19 Sobic.004G303433 - K02950: RP-S12, MRPS12, small subunit ribosomal protein S12
20 Sobic.001G118050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic001G154000--Sobic004G019550 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic001G154000--Sobic001G535850 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic001G154000--Sobic003G286450 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic001G154000--Sobic010G035600 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic001G154000--Sobic002G220400 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic001G154000--Sobic009G174150 Sobic003G344300 Sobic003G344300 Sobic001G154000--Sobic003G344300 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic001G154000--Sobic001G476800 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic001G154000--Sobic005G139750 Sobic004G019550--Sobic001G154000 Sobic004G019550--Sobic010G035600 Sobic004G019550--Sobic003G286450 Sobic004G019550--Sobic002G220400 Sobic004G019550--Sobic001G476800 Sobic004G019550--Sobic001G535850 Sobic004G019550--Sobic003G344300 Sobic004G019550--Sobic005G139750 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic004G019550--Sobic006G135701 Sobic001G535850--Sobic003G286450 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic001G535850--Sobic005G139900 Sobic004G303433 Sobic004G303433 Sobic001G535850--Sobic004G303433 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic001G535850--Sobic003G173116 Sobic001G394532 Sobic001G394532 Sobic001G535850--Sobic001G394532 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic001G535850--Sobic010G206600 Sobic001G535850--Sobic005G139750 Sobic001G535850--Sobic001G154000 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic001G535850--Sobic005G104900 Sobic003G286450--Sobic001G535850 Sobic002G159750 Sobic002G159750 Sobic003G286450--Sobic002G159750 Sobic003G286450--Sobic001G154000 Sobic003G286450--Sobic004G019550 Sobic003G286450--Sobic001G476800 Sobic003G286450--Sobic001G394532 Sobic003G286450--Sobic005G139750 Sobic003G286450--Sobic004G303433 Sobic003G286450--Sobic010G206600 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic010G035600--Sobic007G065000 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic010G035600--Sobic001G182900 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic010G035600--Sobic004G337850 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic010G035600--Sobic010G185250 SobicK029400 SobicK029400 Sobic010G035600--SobicK029400 Sobic010G035600--Sobic004G019550 Sobic010G035600--Sobic001G476800 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic010G035600--Sobic003G172500 Sobic010G035600--Sobic010G206600 Sobic002G220400--Sobic004G019550 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic002G220400--Sobic001G118050 Sobic002G220400--Sobic006G135701 Sobic002G220400--Sobic001G154000 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic002G220400--Sobic009G260550 Sobic004G252600 Sobic004G252600 Sobic002G220400--Sobic004G252600 Sobic001G222150 Sobic001G222150 Sobic002G220400--Sobic001G222150 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic002G220400--Sobic006G100150 Sobic007G011100 Sobic007G011100 Sobic002G220400--Sobic007G011100 Sobic009G174150--Sobic003G173116 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic009G174150--Sobic001G230050 Sobic009G174150--Sobic010G206600 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic009G174150--Sobic003G169200 Sobic009G174150--Sobic001G394532 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic009G174150--Sobic003G159101 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic009G174150--Sobic010G052866 Sobic009G174150--Sobic001G535850 SobicK032300 SobicK032300 Sobic009G174150--SobicK032300 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic003G344300--Sobic003G168800 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic003G344300--Sobic002G165200 Sobic003G344300--Sobic004G019550 Sobic003G344300--Sobic010G035600 Sobic003G119750 Sobic003G119750 Sobic003G344300--Sobic003G119750 Sobic003G344300--Sobic001G154000 Sobic003G344300--Sobic010G185250 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic003G344300--Sobic001G293900 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic003G344300--Sobic006G192600 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic001G476800--Sobic008G171200 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic001G476800--Sobic010G175550 Sobic001G476800--Sobic010G035600 Sobic001G476800--Sobic003G286450 Sobic001G476800--Sobic004G019550 Sobic001G476800--Sobic002G159750 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic001G476800--Sobic007G113566 Sobic001G476800--Sobic001G182900 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic001G476800--Sobic004G207800 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic005G139750--Sobic001G022700 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic005G139750--Sobic004G077700 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic005G139750--Sobic007G145801 Sobic005G139750--Sobic010G206600 Sobic005G139750--Sobic001G535850 Sobic005G139750--Sobic005G104900 Sobic005G139750--Sobic003G173116 Sobic005G139750--Sobic001G230050 Sobic005G139750--Sobic003G286450
Octagon: transcription factors


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