Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G344300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5XNZ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G168800 photosystem II reaction center protein H, putative, expressed K02709: photosystem II PsbH protein
2 Sobic.002G165200 - -
3 Sobic.004G019550 - -
4 Sobic.010G035600 - -
5 Sobic.003G119750 - -
6 Sobic.001G154000 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.010G185250 - -
8 Sobic.001G293900 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
9 Sobic.006G192600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat protein PPR868-14, putative, expressed -
10 Sobic.001G182900 - -
11 Sobic.010G052866 - K02892: RP-L23, MRPL23, large subunit ribosomal protein L23
12 Sobic.003G172850 - K03043: DNA-directed RNA polymerase subunit beta
13 Sobic.010G132200 inhibitor I family protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G412500 - -
15 Sobic.001G476800 - -
16 Sobic.004G337600 - -
17 Sobic.003G172500 - -
18 Sobic.003G286450 - -
19 Sobic.K029400 conserved hypothetical protein -
20 Sobic.003G423400 OsFBX191 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G344300 Sobic003G344300 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic003G344300--Sobic003G168800 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic003G344300--Sobic002G165200 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic003G344300--Sobic004G019550 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic003G344300--Sobic010G035600 Sobic003G119750 Sobic003G119750 Sobic003G344300--Sobic003G119750 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic003G344300--Sobic001G154000 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic003G344300--Sobic010G185250 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic003G344300--Sobic001G293900 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic003G344300--Sobic006G192600 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic003G168800--Sobic003G172850 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic003G168800--Sobic010G052866 Sobic003G168800--Sobic003G344300 Sobic003G168800--Sobic006G192600 Sobic003G168800--Sobic001G293900 Sobic010G132200 Sobic010G132200 Sobic003G168800--Sobic010G132200 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic003G168800--Sobic004G251400 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic003G168800--Sobic003G173266 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic003G168800--Sobic003G168500 Sobic002G165200--Sobic010G185250 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic002G165200--Sobic001G182900 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic002G165200--Sobic003G218950 SobicK029400 SobicK029400 Sobic002G165200--SobicK029400 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic002G165200--Sobic003G369533 Sobic002G165200--Sobic010G035600 Sobic002G165200--Sobic006G192600 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic002G165200--Sobic003G412500 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic002G165200--Sobic003G172500 Sobic004G019550--Sobic001G154000 Sobic004G019550--Sobic010G035600 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic004G019550--Sobic003G286450 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic004G019550--Sobic002G220400 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic004G019550--Sobic001G476800 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic004G019550--Sobic001G535850 Sobic004G019550--Sobic003G344300 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic004G019550--Sobic005G139750 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic004G019550--Sobic006G135701 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic010G035600--Sobic007G065000 Sobic010G035600--Sobic001G182900 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic010G035600--Sobic004G337850 Sobic010G035600--Sobic010G185250 Sobic010G035600--SobicK029400 Sobic010G035600--Sobic004G019550 Sobic010G035600--Sobic001G476800 Sobic010G035600--Sobic003G172500 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic010G035600--Sobic010G206600 Sobic003G119750--Sobic001G293900 Sobic003G119750--Sobic003G344300 Sobic007G004750 Sobic007G004750 Sobic003G119750--Sobic007G004750 Sobic003G119750--Sobic010G132200 Sobic003G119750--Sobic003G168800 Sobic003G423400 Sobic003G423400 Sobic003G119750--Sobic003G423400 Sobic003G119750--Sobic006G192600 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic003G119750--Sobic001G128000 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic003G119750--Sobic003G169400 Sobic001G154000--Sobic004G019550 Sobic001G154000--Sobic001G535850 Sobic001G154000--Sobic003G286450 Sobic001G154000--Sobic010G035600 Sobic001G154000--Sobic002G220400 Sobic009G174150 Sobic009G174150 Sobic001G154000--Sobic009G174150 Sobic001G154000--Sobic003G344300 Sobic001G154000--Sobic001G476800 Sobic001G154000--Sobic005G139750 Sobic010G185250--Sobic002G165200 Sobic010G185250--Sobic001G182900 Sobic010G185250--Sobic010G035600 Sobic010G185250--SobicK029400 Sobic010G185250--Sobic003G369533 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic010G185250--Sobic006G057100 Sobic010G185250--Sobic003G218950 Sobic010G185250--Sobic003G168800 Sobic010G185250--Sobic003G172500 Sobic001G293900--Sobic003G119750 Sobic001G293900--Sobic010G132200 Sobic001G293900--Sobic003G169400 Sobic001G293900--Sobic003G168800 Sobic001G293900--Sobic003G172850 Sobic001G293900--Sobic003G423400 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic001G293900--Sobic006G124850 Sobic001G293900--Sobic006G192600 Sobic001G293900--Sobic003G168500 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic006G192600--Sobic004G337600 Sobic006G192600--Sobic003G168500 Sobic006G192600--Sobic003G172850 Sobic006G192600--Sobic003G168800 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic006G192600--Sobic002G044500 Sobic006G192600--Sobic004G251400 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic006G192600--Sobic003G172400 Sobic006G192600--Sobic002G165200 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic006G192600--Sobic008G160300
Octagon: transcription factors


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