Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G165200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QBR5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G185250 - -
2 Sobic.001G182900 - -
3 Sobic.003G218950 - -
4 Sobic.K029400 conserved hypothetical protein -
5 Sobic.003G369533 - -
6 Sobic.010G035600 - -
7 Sobic.006G192600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat protein PPR868-14, putative, expressed -
8 Sobic.003G412500 - -
9 Sobic.003G172500 - -
10 Sobic.001G182800 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
11 Sobic.006G057100 - -
12 Sobic.003G344300 - -
13 Sobic.008G160300 NADPH-dependent oxidoreductase, putative K05576: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L
14 Sobic.003G171900 - -
15 Sobic.010G052866 - K02892: RP-L23, MRPL23, large subunit ribosomal protein L23
16 Sobic.003G168800 photosystem II reaction center protein H, putative, expressed K02709: photosystem II PsbH protein
17 Sobic.003G352000 growth regulator related protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G337600 - -
19 Sobic.003G172400 conserved hypothetical protein -
20 Sobic.003G168200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic002G165200--Sobic010G185250 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic002G165200--Sobic001G182900 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic002G165200--Sobic003G218950 SobicK029400 SobicK029400 Sobic002G165200--SobicK029400 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic002G165200--Sobic003G369533 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic002G165200--Sobic010G035600 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic002G165200--Sobic006G192600 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic002G165200--Sobic003G412500 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic002G165200--Sobic003G172500 Sobic010G185250--Sobic002G165200 Sobic010G185250--Sobic001G182900 Sobic010G185250--Sobic010G035600 Sobic010G185250--SobicK029400 Sobic010G185250--Sobic003G369533 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic010G185250--Sobic006G057100 Sobic010G185250--Sobic003G218950 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic010G185250--Sobic003G168800 Sobic010G185250--Sobic003G172500 Sobic001G182900--Sobic010G185250 Sobic001G182900--Sobic010G035600 Sobic001G182900--Sobic002G165200 Sobic001G182900--Sobic003G369533 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic001G182900--Sobic007G065000 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic001G182900--Sobic001G182800 Sobic001G182900--SobicK029400 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic001G182900--Sobic001G476800 Sobic001G182900--Sobic003G218950 Sobic003G218950--Sobic006G057100 Sobic003G218950--Sobic003G369533 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic003G218950--Sobic003G352000 Sobic003G218950--SobicK029400 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic003G218950--Sobic006G131700 Sobic003G218950--Sobic002G165200 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic003G218950--Sobic007G085900 Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic003G218950--Sobic003G113100 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic003G218950--Sobic003G169000 SobicK029400--Sobic003G352000 Sobic003G168200 Sobic003G168200 SobicK029400--Sobic003G168200 Sobic002G278100 Sobic002G278100 SobicK029400--Sobic002G278100 SobicK029400--Sobic003G369533 Sobic010G201266 Sobic010G201266 SobicK029400--Sobic010G201266 Sobic007G149200 Sobic007G149200 SobicK029400--Sobic007G149200 Sobic003G172400 Sobic003G172400 SobicK029400--Sobic003G172400 Sobic005G116400 Sobic005G116400 SobicK029400--Sobic005G116400 Sobic008G160300 Sobic008G160300 SobicK029400--Sobic008G160300 Sobic003G369533--SobicK029400 Sobic003G369533--Sobic003G218950 Sobic003G369533--Sobic003G168200 Sobic003G369533--Sobic007G149200 Sobic003G369533--Sobic005G116400 Sobic003G369533--Sobic007G065000 Sobic003G369533--Sobic003G352000 Sobic003G369566 Sobic003G369566 Sobic003G369533--Sobic003G369566 Sobic003G369533--Sobic003G169000 Sobic010G035600--Sobic007G065000 Sobic010G035600--Sobic001G182900 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic010G035600--Sobic004G337850 Sobic010G035600--Sobic010G185250 Sobic010G035600--SobicK029400 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic010G035600--Sobic004G019550 Sobic010G035600--Sobic001G476800 Sobic010G035600--Sobic003G172500 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic010G035600--Sobic010G206600 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic006G192600--Sobic004G337600 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic006G192600--Sobic003G168500 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic006G192600--Sobic003G172850 Sobic006G192600--Sobic003G168800 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic006G192600--Sobic002G044500 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic006G192600--Sobic004G251400 Sobic006G192600--Sobic003G172400 Sobic006G192600--Sobic002G165200 Sobic006G192600--Sobic008G160300 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic003G412500--Sobic009G029100 Sobic003G412500--Sobic002G165200 Sobic003G412500--Sobic010G185250 Sobic003G412500--Sobic006G057100 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic003G412500--Sobic003G160400 Sobic003G412500--Sobic001G182900 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic003G412500--Sobic005G216900 Sobic003G412500--Sobic003G218950 Sobic003G412500--Sobic003G113100 Sobic010G052866 Sobic010G052866 Sobic003G172500--Sobic010G052866 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic003G172500--Sobic004G087050 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic003G172500--Sobic009G123100 SobicK032300 SobicK032300 Sobic003G172500--SobicK032300 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic003G172500--Sobic010G139200 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic003G172500--Sobic005G110493 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic003G172500--Sobic006G124700 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic003G172500--Sobic003G168425 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic003G172500--Sobic003G169300
Octagon: transcription factors


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