Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G218950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VYG0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G057100 - -
2 Sobic.003G369533 - -
3 Sobic.003G352000 growth regulator related protein, putative, expressed -
4 Sobic.K029400 conserved hypothetical protein -
5 Sobic.006G131700 CRS1/YhbY domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G165200 - -
7 Sobic.007G085900 - -
8 Sobic.003G113100 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G169000 - K02718: photosystem II PsbT protein
10 Sobic.003G168200 - -
11 Sobic.007G149200 "DEP1/GGC2(Ortholog in rice:Huang et al., 2009(PubMedID : 31659905)@keratin-associated protein 5-4, putative, expressed -
12 Sobic.010G185250 - -
13 Sobic.001G182900 - -
14 Sobic.007G065000 proton-dependent oligopeptide transport, putative, expressed -
15 Sobic.010G035600 - -
16 Sobic.001G182800 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
17 Sobic.004G337850 - -
18 Sobic.002G278100 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G192200 outer membrane protein, OMP85 family, putative, expressed -
20 Sobic.003G369566 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic003G218950--Sobic006G057100 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic003G218950--Sobic003G369533 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic003G218950--Sobic003G352000 SobicK029400 SobicK029400 Sobic003G218950--SobicK029400 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic003G218950--Sobic006G131700 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic003G218950--Sobic002G165200 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic003G218950--Sobic007G085900 Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic003G218950--Sobic003G113100 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic003G218950--Sobic003G169000 Sobic006G057100--Sobic003G218950 Sobic006G057100--Sobic003G352000 Sobic006G057100--Sobic007G085900 Sobic006G057100--SobicK029400 Sobic006G057100--Sobic006G131700 Sobic006G057100--Sobic003G113100 Sobic006G057100--Sobic003G369533 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic006G057100--Sobic003G160400 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic006G057100--Sobic010G185250 Sobic003G369533--SobicK029400 Sobic003G369533--Sobic003G218950 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic003G369533--Sobic003G168200 Sobic007G149200 Sobic007G149200 Sobic003G369533--Sobic007G149200 Sobic005G116400 Sobic005G116400 Sobic003G369533--Sobic005G116400 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic003G369533--Sobic007G065000 Sobic003G369533--Sobic003G352000 Sobic003G369566 Sobic003G369566 Sobic003G369533--Sobic003G369566 Sobic003G369533--Sobic003G169000 Sobic003G352000--SobicK029400 Sobic003G352000--Sobic003G168200 Sobic003G352000--Sobic007G149200 Sobic002G278100 Sobic002G278100 Sobic003G352000--Sobic002G278100 Sobic010G201266 Sobic010G201266 Sobic003G352000--Sobic010G201266 Sobic003G352000--Sobic006G057100 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic003G352000--Sobic003G172400 Sobic003G352000--Sobic003G369533 Sobic003G352000--Sobic003G218950 SobicK029400--Sobic003G352000 SobicK029400--Sobic003G168200 SobicK029400--Sobic002G278100 SobicK029400--Sobic003G369533 SobicK029400--Sobic010G201266 SobicK029400--Sobic007G149200 SobicK029400--Sobic003G172400 SobicK029400--Sobic005G116400 Sobic008G160300 Sobic008G160300 SobicK029400--Sobic008G160300 Sobic006G131700--Sobic003G218950 Sobic006G131700--Sobic003G113100 Sobic006G131700--Sobic006G057100 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic006G131700--Sobic009G101500 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic006G131700--Sobic003G330350 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic006G131700--Sobic009G192200 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic006G131700--Sobic004G337850 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic006G131700--Sobic010G035600 Sobic006G131700--Sobic002G165200 Sobic002G165200--Sobic010G185250 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic002G165200--Sobic001G182900 Sobic002G165200--Sobic003G218950 Sobic002G165200--SobicK029400 Sobic002G165200--Sobic003G369533 Sobic002G165200--Sobic010G035600 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic002G165200--Sobic006G192600 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic002G165200--Sobic003G412500 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic002G165200--Sobic003G172500 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic007G085900--Sobic003G160300 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic007G085900--Sobic003G160433 Sobic007G085900--Sobic009G192200 Sobic007G085900--Sobic003G160400 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic007G085900--Sobic008G140050 Sobic007G085900--Sobic006G057100 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic007G085900--Sobic001G128000 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic007G085900--Sobic002G390200 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic007G085900--Sobic001G054050 Sobic003G113100--Sobic006G131700 Sobic003G113100--Sobic006G057100 Sobic003G113100--Sobic003G218950 Sobic003G113100--Sobic001G054050 Sobic003G113100--Sobic007G085900 Sobic003G113100--Sobic008G140050 Sobic003G113100--Sobic002G165200 Sobic003G113100--Sobic009G192200 Sobic003G113100--SobicK029400 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic003G169000--Sobic003G169100 Sobic003G169000--Sobic007G065000 Sobic003G169000--Sobic007G149200 Sobic003G169000--Sobic003G352000 Sobic003G169000--Sobic003G369533 Sobic003G169000--Sobic003G168200 Sobic003G169000--SobicK029400 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic003G169000--Sobic007G145801 Sobic003G169000--Sobic003G218950
Octagon: transcription factors


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