Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G113100.1
Synonym Sb03g009520
Functional annotation OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5XFR8
Pfam -
Panther DB PTHR33207 PTHR33207:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g17190.1 : OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G131700 CRS1/YhbY domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G057100 - -
3 Sobic.003G218950 - -
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15 Sobic.003G369533 - -
16 Sobic.003G172400 conserved hypothetical protein -
17 Sobic.001G182900 - -
18 Sobic.003G160300 - -
19 Sobic.006G192600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat protein PPR868-14, putative, expressed -
20 Sobic.004G337850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic003G113100--Sobic006G131700 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic003G113100--Sobic006G057100 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic003G113100--Sobic003G218950 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic003G113100--Sobic001G054050 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic003G113100--Sobic007G085900 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic003G113100--Sobic008G140050 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic003G113100--Sobic002G165200 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic003G113100--Sobic009G192200 SobicK029400 SobicK029400 Sobic003G113100--SobicK029400 Sobic006G131700--Sobic003G218950 Sobic006G131700--Sobic003G113100 Sobic006G131700--Sobic006G057100 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic006G131700--Sobic009G101500 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic006G131700--Sobic003G330350 Sobic006G131700--Sobic009G192200 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic006G131700--Sobic004G337850 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic006G131700--Sobic010G035600 Sobic006G131700--Sobic002G165200 Sobic006G057100--Sobic003G218950 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic006G057100--Sobic003G352000 Sobic006G057100--Sobic007G085900 Sobic006G057100--SobicK029400 Sobic006G057100--Sobic006G131700 Sobic006G057100--Sobic003G113100 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic006G057100--Sobic003G369533 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic006G057100--Sobic003G160400 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic006G057100--Sobic010G185250 Sobic003G218950--Sobic006G057100 Sobic003G218950--Sobic003G369533 Sobic003G218950--Sobic003G352000 Sobic003G218950--SobicK029400 Sobic003G218950--Sobic006G131700 Sobic003G218950--Sobic002G165200 Sobic003G218950--Sobic007G085900 Sobic003G218950--Sobic003G113100 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic003G218950--Sobic003G169000 Sobic001G054050--Sobic007G085900 Sobic001G054050--Sobic003G160400 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic001G054050--Sobic003G160300 Sobic001G054050--Sobic003G113100 Sobic001G054050--Sobic008G140050 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic001G054050--Sobic003G160433 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic001G054050--Sobic005G216900 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic001G054050--Sobic005G167100 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic001G054050--Sobic001G128000 Sobic007G085900--Sobic003G160300 Sobic007G085900--Sobic003G160433 Sobic007G085900--Sobic009G192200 Sobic007G085900--Sobic003G160400 Sobic007G085900--Sobic008G140050 Sobic007G085900--Sobic006G057100 Sobic007G085900--Sobic001G128000 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic007G085900--Sobic002G390200 Sobic007G085900--Sobic001G054050 Sobic008G140050--Sobic007G085900 Sobic008G140050--Sobic003G160300 Sobic008G140050--Sobic003G160400 Sobic008G140050--Sobic005G167100 Sobic008G140050--Sobic003G352000 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic008G140050--Sobic010G225400 Sobic008G140050--Sobic002G390200 Sobic008G140050--SobicK029400 Sobic008G140050--Sobic009G192200 Sobic002G165200--Sobic010G185250 Sobic001G182900 Sobic001G182900 Sobic002G165200--Sobic001G182900 Sobic002G165200--Sobic003G218950 Sobic002G165200--SobicK029400 Sobic002G165200--Sobic003G369533 Sobic002G165200--Sobic010G035600 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic002G165200--Sobic006G192600 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic002G165200--Sobic003G412500 Sobic003G172500 Sobic003G172500 Sobic002G165200--Sobic003G172500 Sobic009G192200--Sobic007G085900 Sobic009G192200--Sobic006G057100 Sobic009G192200--Sobic003G160300 Sobic004G282933 Sobic004G282933 Sobic009G192200--Sobic004G282933 Sobic009G192200--Sobic008G140050 Sobic009G192200--Sobic003G218950 Sobic009G192200--Sobic003G160433 Sobic009G192200--Sobic006G131700 Sobic009G192200--Sobic003G352000 SobicK029400--Sobic003G352000 Sobic003G168200 Sobic003G168200 SobicK029400--Sobic003G168200 Sobic002G278100 Sobic002G278100 SobicK029400--Sobic002G278100 SobicK029400--Sobic003G369533 Sobic010G201266 Sobic010G201266 SobicK029400--Sobic010G201266 Sobic007G149200 Sobic007G149200 SobicK029400--Sobic007G149200 Sobic003G172400 Sobic003G172400 SobicK029400--Sobic003G172400 Sobic005G116400 Sobic005G116400 SobicK029400--Sobic005G116400 Sobic008G160300 Sobic008G160300 SobicK029400--Sobic008G160300
Octagon: transcription factors


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