Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G160300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q3J6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
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Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G160433 - -
2 Sobic.002G390200 pentatricopeptide, putative, expressed -
3 Sobic.007G085900 - -
4 Sobic.003G160400 zinc knuckle family protein, expressed -
5 Sobic.008G140050 - -
6 Sobic.005G216900 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G128000 expressed protein -
8 Sobic.002G180732 - -
9 Sobic.001G054050 - -
10 Sobic.009G192200 outer membrane protein, OMP85 family, putative, expressed -
11 Sobic.K029400 conserved hypothetical protein -
12 Sobic.006G057100 - -
13 Sobic.003G352000 growth regulator related protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G218950 - -
15 Sobic.010G225400 expressed protein -
16 Sobic.003G050100 polygalacturonase, putative, expressed -
17 Sobic.005G116400 apocytochrome f precursor, putative, expressed K02634: apocytochrome f
18 Sobic.003G369533 - -
19 Sobic.004G282933 - -
20 Sobic.005G167100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic003G160300--Sobic003G160433 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic003G160300--Sobic002G390200 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic003G160300--Sobic007G085900 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic003G160300--Sobic003G160400 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic003G160300--Sobic008G140050 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic003G160300--Sobic005G216900 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic003G160300--Sobic001G128000 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic003G160300--Sobic002G180732 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic003G160300--Sobic001G054050 Sobic003G160433--Sobic003G160300 Sobic003G160433--Sobic002G390200 Sobic003G160433--Sobic007G085900 Sobic003G160433--Sobic001G128000 Sobic003G160433--Sobic005G216900 Sobic003G160433--Sobic002G180732 Sobic003G160433--Sobic003G160400 Sobic003G160433--Sobic001G054050 Sobic003G160433--Sobic008G140050 Sobic002G390200--Sobic003G160300 Sobic002G390200--Sobic003G160433 Sobic002G390200--Sobic002G180732 Sobic002G390200--Sobic007G085900 Sobic002G390200--Sobic003G160400 Sobic006G139200 Sobic006G139200 Sobic002G390200--Sobic006G139200 Sobic002G390200--Sobic008G140050 Sobic002G040550 Sobic002G040550 Sobic002G390200--Sobic002G040550 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic002G390200--Sobic003G172450 Sobic007G085900--Sobic003G160300 Sobic007G085900--Sobic003G160433 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic007G085900--Sobic009G192200 Sobic007G085900--Sobic003G160400 Sobic007G085900--Sobic008G140050 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic007G085900--Sobic006G057100 Sobic007G085900--Sobic001G128000 Sobic007G085900--Sobic002G390200 Sobic007G085900--Sobic001G054050 Sobic003G160400--Sobic007G085900 Sobic003G160400--Sobic005G216900 Sobic003G160400--Sobic003G160300 Sobic003G160400--Sobic003G160433 Sobic003G160400--Sobic001G128000 Sobic003G160400--Sobic001G054050 Sobic003G160400--Sobic002G390200 Sobic003G160400--Sobic008G140050 Sobic003G160400--Sobic006G057100 Sobic008G140050--Sobic007G085900 Sobic008G140050--Sobic003G160300 Sobic008G140050--Sobic003G160400 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic008G140050--Sobic005G167100 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic008G140050--Sobic003G352000 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic008G140050--Sobic010G225400 Sobic008G140050--Sobic002G390200 SobicK029400 SobicK029400 Sobic008G140050--SobicK029400 Sobic008G140050--Sobic009G192200 Sobic005G216900--Sobic003G160400 Sobic005G216900--Sobic003G160433 Sobic005G216900--Sobic003G160300 Sobic005G216900--Sobic007G085900 Sobic005G216900--Sobic001G128000 Sobic005G216900--Sobic001G054050 Sobic005G216900--Sobic006G057100 Sobic005G216900--Sobic002G390200 Sobic005G216900--SobicK029400 Sobic001G128000--Sobic003G160433 Sobic001G128000--Sobic007G085900 Sobic001G128000--Sobic003G160300 Sobic001G128000--Sobic003G160400 Sobic001G128000--Sobic005G216900 Sobic001G128000--Sobic001G054050 Sobic001G128000--Sobic002G390200 Sobic010G267300 Sobic010G267300 Sobic001G128000--Sobic010G267300 Sobic001G128000--Sobic008G140050 Sobic002G180732--Sobic002G390200 Sobic002G180732--Sobic003G160433 Sobic002G180732--Sobic003G160300 Sobic002G180732--Sobic006G139200 Sobic002G180732--Sobic002G040550 Sobic002G180732--Sobic003G172450 Sobic002G180732--Sobic001G128000 Sobic002G180732--Sobic007G085900 Sobic005G199151 Sobic005G199151 Sobic002G180732--Sobic005G199151 Sobic001G054050--Sobic007G085900 Sobic001G054050--Sobic003G160400 Sobic001G054050--Sobic003G160300 Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic001G054050--Sobic003G113100 Sobic001G054050--Sobic008G140050 Sobic001G054050--Sobic003G160433 Sobic001G054050--Sobic005G216900 Sobic001G054050--Sobic005G167100 Sobic001G054050--Sobic001G128000
Octagon: transcription factors


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