Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G282933.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RPN8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G192200 outer membrane protein, OMP85 family, putative, expressed -
2 Sobic.004G104200 berberine and berberine like domain containing protein, expressed -
3 Sobic.007G085900 - -
4 Sobic.008G140050 - -
5 Sobic.003G160300 - -
6 Sobic.002G390200 pentatricopeptide, putative, expressed -
7 Sobic.001G054050 - -
8 Sobic.008G024900 expressed protein -
9 Sobic.003G160400 zinc knuckle family protein, expressed -
10 Sobic.003G160433 - -
11 Sobic.001G128000 expressed protein -
12 Sobic.006G057100 - -
13 Sobic.003G113100 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G029500 GDP-mannose transporter, putative, expressed K15356: VRG4, GDP-mannose transporter
15 Sobic.002G180732 - -
16 Sobic.005G028500 expressed protein -
17 Sobic.003G050100 polygalacturonase, putative, expressed -
18 Sobic.003G172450 - -
19 Sobic.005G216900 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G040550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G282933 Sobic004G282933 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic004G282933--Sobic009G192200 Sobic004G104200 Sobic004G104200 Sobic004G282933--Sobic004G104200 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic004G282933--Sobic007G085900 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic004G282933--Sobic008G140050 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic004G282933--Sobic003G160300 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic004G282933--Sobic002G390200 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic004G282933--Sobic001G054050 Sobic008G024900 Sobic008G024900 Sobic004G282933--Sobic008G024900 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic004G282933--Sobic003G160400 Sobic009G192200--Sobic007G085900 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic009G192200--Sobic006G057100 Sobic009G192200--Sobic003G160300 Sobic009G192200--Sobic004G282933 Sobic009G192200--Sobic008G140050 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic009G192200--Sobic003G218950 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic009G192200--Sobic003G160433 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic009G192200--Sobic006G131700 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic009G192200--Sobic003G352000 Sobic004G104200--Sobic004G282933 Sobic004G104200--Sobic009G192200 Sobic004G104200--Sobic007G085900 Sobic004G104200--Sobic008G140050 Sobic004G104200--Sobic003G160400 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic004G104200--Sobic005G167100 Sobic004G104200--Sobic006G057100 Sobic004G104200--Sobic008G024900 Sobic005G028500 Sobic005G028500 Sobic004G104200--Sobic005G028500 Sobic007G085900--Sobic003G160300 Sobic007G085900--Sobic003G160433 Sobic007G085900--Sobic009G192200 Sobic007G085900--Sobic003G160400 Sobic007G085900--Sobic008G140050 Sobic007G085900--Sobic006G057100 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic007G085900--Sobic001G128000 Sobic007G085900--Sobic002G390200 Sobic007G085900--Sobic001G054050 Sobic008G140050--Sobic007G085900 Sobic008G140050--Sobic003G160300 Sobic008G140050--Sobic003G160400 Sobic008G140050--Sobic005G167100 Sobic008G140050--Sobic003G352000 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic008G140050--Sobic010G225400 Sobic008G140050--Sobic002G390200 SobicK029400 SobicK029400 Sobic008G140050--SobicK029400 Sobic008G140050--Sobic009G192200 Sobic003G160300--Sobic003G160433 Sobic003G160300--Sobic002G390200 Sobic003G160300--Sobic007G085900 Sobic003G160300--Sobic003G160400 Sobic003G160300--Sobic008G140050 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic003G160300--Sobic005G216900 Sobic003G160300--Sobic001G128000 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic003G160300--Sobic002G180732 Sobic003G160300--Sobic001G054050 Sobic002G390200--Sobic003G160300 Sobic002G390200--Sobic003G160433 Sobic002G390200--Sobic002G180732 Sobic002G390200--Sobic007G085900 Sobic002G390200--Sobic003G160400 Sobic006G139200 Sobic006G139200 Sobic002G390200--Sobic006G139200 Sobic002G390200--Sobic008G140050 Sobic002G040550 Sobic002G040550 Sobic002G390200--Sobic002G040550 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic002G390200--Sobic003G172450 Sobic001G054050--Sobic007G085900 Sobic001G054050--Sobic003G160400 Sobic001G054050--Sobic003G160300 Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic001G054050--Sobic003G113100 Sobic001G054050--Sobic008G140050 Sobic001G054050--Sobic003G160433 Sobic001G054050--Sobic005G216900 Sobic001G054050--Sobic005G167100 Sobic001G054050--Sobic001G128000 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic008G024900--Sobic006G093550 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic008G024900--Sobic004G234766 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic008G024900--Sobic010G107901 Sobic002G397700 Sobic002G397700 Sobic008G024900--Sobic002G397700 Sobic008G024900--Sobic003G172450 Sobic008G024900--Sobic001G054050 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic008G024900--Sobic002G322101 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic008G024900--Sobic001G249900 Sobic008G024900--Sobic005G167100 Sobic003G160400--Sobic007G085900 Sobic003G160400--Sobic005G216900 Sobic003G160400--Sobic003G160300 Sobic003G160400--Sobic003G160433 Sobic003G160400--Sobic001G128000 Sobic003G160400--Sobic001G054050 Sobic003G160400--Sobic002G390200 Sobic003G160400--Sobic008G140050 Sobic003G160400--Sobic006G057100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.