Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G160400.1
Synonym
Functional annotation zinc knuckle family protein, expressed
UniProt A0A1B6Q3I0
Pfam -
Panther DB PTHR33075 PTHR33075:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g28300.1 : zinc knuckle family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G085900 - -
2 Sobic.005G216900 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G160300 - -
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8 Sobic.008G140050 - -
9 Sobic.006G057100 - -
10 Sobic.K029400 conserved hypothetical protein -
11 Sobic.005G167100 - -
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14 Sobic.009G104850 - -
15 Sobic.010G107601 - -
16 Sobic.003G172400 conserved hypothetical protein -
17 Sobic.003G218950 - -
18 Sobic.010G201266 - K05573: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2
K02992: RP-S7, MRPS7, small subunit ribosomal protein S7
19 Sobic.010G185250 - -
20 Sobic.003G412500 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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