Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G180732.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W4U1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G390200 pentatricopeptide, putative, expressed -
2 Sobic.003G160433 - -
3 Sobic.003G160300 - -
4 Sobic.006G139200 zinc knuckle family protein, expressed -
5 Sobic.002G040550 - -
6 Sobic.003G172450 - -
7 Sobic.001G128000 expressed protein -
8 Sobic.007G085900 - -
9 Sobic.005G199151 - -
10 Sobic.003G160400 zinc knuckle family protein, expressed -
11 Sobic.005G216900 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.004G268600 nodulin, putative, expressed -
13 Sobic.001G054050 - -
14 Sobic.009G087480 - -
15 Sobic.010G107901 - K13104: ZNF830, zinc finger protein 830
16 Sobic.005G163932 - -
17 Sobic.008G140050 - -
18 Sobic.003G337200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat-containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G351000 - -
20 Sobic.004G234766 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic002G180732--Sobic002G390200 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic002G180732--Sobic003G160433 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic002G180732--Sobic003G160300 Sobic006G139200 Sobic006G139200 Sobic002G180732--Sobic006G139200 Sobic002G040550 Sobic002G040550 Sobic002G180732--Sobic002G040550 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic002G180732--Sobic003G172450 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic002G180732--Sobic001G128000 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic002G180732--Sobic007G085900 Sobic005G199151 Sobic005G199151 Sobic002G180732--Sobic005G199151 Sobic002G390200--Sobic003G160300 Sobic002G390200--Sobic003G160433 Sobic002G390200--Sobic002G180732 Sobic002G390200--Sobic007G085900 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic002G390200--Sobic003G160400 Sobic002G390200--Sobic006G139200 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic002G390200--Sobic008G140050 Sobic002G390200--Sobic002G040550 Sobic002G390200--Sobic003G172450 Sobic003G160433--Sobic003G160300 Sobic003G160433--Sobic002G390200 Sobic003G160433--Sobic007G085900 Sobic003G160433--Sobic001G128000 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic003G160433--Sobic005G216900 Sobic003G160433--Sobic002G180732 Sobic003G160433--Sobic003G160400 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic003G160433--Sobic001G054050 Sobic003G160433--Sobic008G140050 Sobic003G160300--Sobic003G160433 Sobic003G160300--Sobic002G390200 Sobic003G160300--Sobic007G085900 Sobic003G160300--Sobic003G160400 Sobic003G160300--Sobic008G140050 Sobic003G160300--Sobic005G216900 Sobic003G160300--Sobic001G128000 Sobic003G160300--Sobic002G180732 Sobic003G160300--Sobic001G054050 Sobic006G139200--Sobic002G040550 Sobic006G139200--Sobic003G172450 Sobic006G139200--Sobic002G390200 Sobic006G139200--Sobic002G180732 Sobic009G087480 Sobic009G087480 Sobic006G139200--Sobic009G087480 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic006G139200--Sobic010G107901 Sobic002G397700 Sobic002G397700 Sobic006G139200--Sobic002G397700 Sobic006G139200--Sobic003G160300 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic006G139200--Sobic004G234766 Sobic002G040550--Sobic006G139200 Sobic002G040550--Sobic003G172450 Sobic002G040550--Sobic002G390200 Sobic002G040550--Sobic002G180732 Sobic002G040550--Sobic009G087480 Sobic002G040550--Sobic010G107901 Sobic002G040550--Sobic002G397700 Sobic002G040550--Sobic003G160300 Sobic002G040550--Sobic004G234766 Sobic003G172450--Sobic010G107901 Sobic003G172450--Sobic006G139200 Sobic003G172450--Sobic002G397700 Sobic003G172450--Sobic002G040550 Sobic003G172450--Sobic004G234766 Sobic003G172450--Sobic002G390200 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic003G172450--Sobic006G093550 Sobic008G024900 Sobic008G024900 Sobic003G172450--Sobic008G024900 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic003G172450--Sobic010G225400 Sobic001G128000--Sobic003G160433 Sobic001G128000--Sobic007G085900 Sobic001G128000--Sobic003G160300 Sobic001G128000--Sobic003G160400 Sobic001G128000--Sobic005G216900 Sobic001G128000--Sobic001G054050 Sobic001G128000--Sobic002G390200 Sobic010G267300 Sobic010G267300 Sobic001G128000--Sobic010G267300 Sobic001G128000--Sobic008G140050 Sobic007G085900--Sobic003G160300 Sobic007G085900--Sobic003G160433 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic007G085900--Sobic009G192200 Sobic007G085900--Sobic003G160400 Sobic007G085900--Sobic008G140050 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic007G085900--Sobic006G057100 Sobic007G085900--Sobic001G128000 Sobic007G085900--Sobic002G390200 Sobic007G085900--Sobic001G054050 Sobic004G351000 Sobic004G351000 Sobic005G199151--Sobic004G351000 Sobic005G199151--Sobic002G180732 Sobic008G029000 Sobic008G029000 Sobic005G199151--Sobic008G029000 Sobic002G232300 Sobic002G232300 Sobic005G199151--Sobic002G232300 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic005G199151--Sobic010G018200 Sobic005G187800 Sobic005G187800 Sobic005G199151--Sobic005G187800 Sobic005G199151--Sobic009G087480 Sobic001G259850 Sobic001G259850 Sobic005G199151--Sobic001G259850 Sobic005G199151--Sobic002G390200
Octagon: transcription factors


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