Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G234766.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RP14
Pfam PF10551
Panther DB PTHR31669 PTHR31669:SF61
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G38180 : FAR1-related sequence 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g71850.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G107901 - K13104: ZNF830, zinc finger protein 830
2 Sobic.002G397700 - -
3 Sobic.006G093550 - -
4 Sobic.002G322101 - -
5 Sobic.003G172450 - -
6 Sobic.007G149750 - -
7 Sobic.001G249900 - -
8 Sobic.010G133225 - -
9 Sobic.003G337200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat-containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.008G024900 expressed protein -
11 Sobic.010G225400 expressed protein -
12 Sobic.003G255850 - -
13 Sobic.005G167100 - -
14 Sobic.010G107601 - -
15 Sobic.005G096500 - -
16 Sobic.006G147350 - -
17 Sobic.010G173600 cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed K00279: cytokinin dehydrogenase
18 Sobic.003G169400 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03046: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
19 Sobic.009G104850 - -
20 Sobic.007G141650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic004G234766--Sobic010G107901 Sobic002G397700 Sobic002G397700 Sobic004G234766--Sobic002G397700 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic004G234766--Sobic006G093550 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic004G234766--Sobic002G322101 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic004G234766--Sobic003G172450 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic004G234766--Sobic007G149750 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic004G234766--Sobic001G249900 Sobic010G133225 Sobic010G133225 Sobic004G234766--Sobic010G133225 Sobic003G337200 Sobic003G337200 Sobic004G234766--Sobic003G337200 Sobic010G107901--Sobic002G397700 Sobic010G107901--Sobic004G234766 Sobic010G107901--Sobic003G172450 Sobic010G107901--Sobic006G093550 Sobic010G107901--Sobic002G322101 Sobic010G107901--Sobic010G133225 Sobic008G024900 Sobic008G024900 Sobic010G107901--Sobic008G024900 Sobic010G107901--Sobic003G337200 Sobic010G107901--Sobic001G249900 Sobic002G397700--Sobic010G107901 Sobic002G397700--Sobic004G234766 Sobic002G397700--Sobic006G093550 Sobic002G397700--Sobic003G172450 Sobic002G397700--Sobic002G322101 Sobic002G397700--Sobic010G133225 Sobic002G397700--Sobic007G149750 Sobic002G397700--Sobic001G249900 Sobic002G397700--Sobic003G337200 Sobic006G093550--Sobic002G322101 Sobic006G093550--Sobic004G234766 Sobic006G093550--Sobic002G397700 Sobic006G093550--Sobic010G107901 Sobic006G093550--Sobic001G249900 Sobic006G093550--Sobic007G149750 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic006G093550--Sobic006G147350 Sobic006G093550--Sobic010G133225 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic006G093550--Sobic010G173600 Sobic002G322101--Sobic006G093550 Sobic002G322101--Sobic007G149750 Sobic002G322101--Sobic004G234766 Sobic002G322101--Sobic010G173600 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic002G322101--Sobic003G255850 Sobic002G322101--Sobic006G147350 Sobic002G322101--Sobic001G249900 Sobic002G322101--Sobic002G397700 Sobic002G322101--Sobic010G107901 Sobic003G172450--Sobic010G107901 Sobic006G139200 Sobic006G139200 Sobic003G172450--Sobic006G139200 Sobic003G172450--Sobic002G397700 Sobic002G040550 Sobic002G040550 Sobic003G172450--Sobic002G040550 Sobic003G172450--Sobic004G234766 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic003G172450--Sobic002G390200 Sobic003G172450--Sobic006G093550 Sobic003G172450--Sobic008G024900 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic003G172450--Sobic010G225400 Sobic007G149750--Sobic002G322101 Sobic007G149750--Sobic010G173600 Sobic007G149750--Sobic006G147350 Sobic007G149750--Sobic006G093550 Sobic007G149750--Sobic003G255850 Sobic007G149750--Sobic001G249900 Sobic007G149750--Sobic004G234766 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic007G149750--Sobic005G093600 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic007G149750--Sobic003G128575 Sobic001G249900--Sobic006G147350 Sobic001G249900--Sobic006G093550 Sobic001G249900--Sobic002G322101 Sobic001G249900--Sobic007G149750 Sobic001G249900--Sobic010G173600 Sobic001G249900--Sobic004G234766 Sobic001G249900--Sobic003G255850 Sobic001G249900--Sobic002G397700 Sobic001G249900--Sobic010G107901 Sobic010G133225--Sobic004G234766 Sobic010G133225--Sobic006G093550 Sobic010G133225--Sobic010G107901 Sobic010G133225--Sobic002G397700 Sobic010G133225--Sobic002G322101 Sobic010G133225--Sobic001G249900 Sobic010G133225--Sobic003G255850 Sobic010G133225--Sobic006G147350 Sobic010G133225--Sobic003G172450 Sobic003G337200--Sobic004G234766 Sobic003G337200--Sobic010G107901 Sobic004G268600 Sobic004G268600 Sobic003G337200--Sobic004G268600 Sobic003G337200--Sobic002G397700 Sobic003G337200--Sobic006G093550 Sobic003G337200--Sobic002G322101 Sobic003G337200--Sobic003G172450 Sobic003G337200--Sobic003G255850 Sobic003G337200--Sobic007G149750
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.