Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G149750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RA22
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G06650 : C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g53530.1 : ZOS2-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007430 , Zm00025a030753 , Zm00025a047195 , Zm00025a017316 , Zm00025a033046 , Zm00025a004392 , Zm00025a025172 , Zm00025a042483 , Zm00025a049619 , Zm00025a001503 , Zm00025a022299 , Zm00025a014022 , Zm00025a052932
Brachypodium KQJ98574 , KQK19094 , KQJ90446 , KQK01658
Barley HORVU6Hr1G080870.1 , HORVU6Hr1G080870.2 , HORVU4Hr1G064150.2 , HORVU4Hr1G064150.3 , HORVU4Hr1G064150.1 , HORVU4Hr1G013330.1 , HORVU7Hr1G034930.2
Wheat TraesCS4D02G230300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G322101 - -
2 Sobic.010G173600 cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed K00279: cytokinin dehydrogenase
3 Sobic.006G147350 - -
4 Sobic.006G093550 - -
5 Sobic.003G255850 - -
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8 Sobic.005G093600 protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
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10 Sobic.002G397700 - -
11 Sobic.002G025000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@receptor like protein kinase, putative, expressed -
12 Sobic.006G017266 - -
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14 Sobic.003G169400 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03046: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
15 Sobic.006G020350 - -
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17 Sobic.005G183450 - -
18 Sobic.010G133225 - -
19 Sobic.005G096500 - -
20 Sobic.001G293900 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8


Gene co-expression network
sample Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic007G149750--Sobic002G322101 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic007G149750--Sobic010G173600 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic007G149750--Sobic006G147350 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic007G149750--Sobic006G093550 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic007G149750--Sobic003G255850 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic007G149750--Sobic001G249900 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic007G149750--Sobic004G234766 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic007G149750--Sobic005G093600 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic007G149750--Sobic003G128575 Sobic002G322101--Sobic006G093550 Sobic002G322101--Sobic007G149750 Sobic002G322101--Sobic004G234766 Sobic002G322101--Sobic010G173600 Sobic002G322101--Sobic003G255850 Sobic002G322101--Sobic006G147350 Sobic002G322101--Sobic001G249900 Sobic002G397700 Sobic002G397700 Sobic002G322101--Sobic002G397700 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic002G322101--Sobic010G107901 Sobic010G173600--Sobic005G093600 Sobic010G173600--Sobic003G128575 Sobic010G173600--Sobic006G147350 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic010G173600--Sobic006G017266 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic010G173600--Sobic006G020350 Sobic010G173600--Sobic003G255850 Sobic010G173600--Sobic007G149750 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic010G173600--Sobic005G183450 Sobic010G173600--Sobic002G322101 Sobic006G147350--Sobic010G173600 Sobic006G147350--Sobic001G249900 Sobic006G147350--Sobic003G255850 Sobic006G147350--Sobic005G093600 Sobic006G147350--Sobic003G128575 Sobic006G147350--Sobic002G322101 Sobic006G147350--Sobic007G149750 Sobic006G147350--Sobic006G017266 Sobic006G147350--Sobic006G020350 Sobic006G093550--Sobic002G322101 Sobic006G093550--Sobic004G234766 Sobic006G093550--Sobic002G397700 Sobic006G093550--Sobic010G107901 Sobic006G093550--Sobic001G249900 Sobic006G093550--Sobic007G149750 Sobic006G093550--Sobic006G147350 Sobic010G133225 Sobic010G133225 Sobic006G093550--Sobic010G133225 Sobic006G093550--Sobic010G173600 Sobic003G255850--Sobic010G173600 Sobic003G255850--Sobic006G147350 Sobic003G255850--Sobic002G322101 Sobic003G255850--Sobic005G093600 Sobic003G255850--Sobic007G149750 Sobic003G255850--Sobic003G128575 Sobic003G255850--Sobic006G017266 Sobic003G255850--Sobic006G020350 Sobic003G255850--Sobic001G249900 Sobic001G249900--Sobic006G147350 Sobic001G249900--Sobic006G093550 Sobic001G249900--Sobic002G322101 Sobic001G249900--Sobic007G149750 Sobic001G249900--Sobic010G173600 Sobic001G249900--Sobic004G234766 Sobic001G249900--Sobic003G255850 Sobic001G249900--Sobic002G397700 Sobic001G249900--Sobic010G107901 Sobic004G234766--Sobic010G107901 Sobic004G234766--Sobic002G397700 Sobic004G234766--Sobic006G093550 Sobic004G234766--Sobic002G322101 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic004G234766--Sobic003G172450 Sobic004G234766--Sobic007G149750 Sobic004G234766--Sobic001G249900 Sobic004G234766--Sobic010G133225 Sobic003G337200 Sobic003G337200 Sobic004G234766--Sobic003G337200 Sobic005G093600--Sobic003G128575 Sobic005G093600--Sobic010G173600 Sobic005G093600--Sobic006G017266 Sobic005G093600--Sobic006G020350 Sobic005G093600--Sobic005G183450 Sobic005G093600--Sobic006G147350 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic005G093600--Sobic006G124850 Sobic005G093600--Sobic003G255850 Sobic005G093600--Sobic007G149750 Sobic003G128575--Sobic006G017266 Sobic003G128575--Sobic005G183450 Sobic003G128575--Sobic006G020350 Sobic003G128575--Sobic005G093600 Sobic003G128575--Sobic010G173600 Sobic003G128575--Sobic006G124850 Sobic003G128575--Sobic006G147350 Sobic003G128575--Sobic003G255850 Sobic003G128575--Sobic007G149750
Octagon: transcription factors


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