Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G093600.1
Synonym Sb05g008090
Functional annotation protein kinase domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5Y8C5
Pfam PF00069
Panther DB PTHR27003 PTHR27003:SF48
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G26150 : protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g12660.1 : protein kinase domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034564
Brachypodium KQJ94036
Barley -
Wheat TraesCS6B02G213600 , TraesCS6A02G182800 , TraesCS6D02G172000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G128575 - -
2 Sobic.010G173600 cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed K00279: cytokinin dehydrogenase
3 Sobic.006G017266 - -
4 Sobic.006G020350 - -
5 Sobic.005G183450 - -
6 Sobic.006G147350 - -
7 Sobic.006G124850 - K02948: RP-S11, MRPS11, small subunit ribosomal protein S11
8 Sobic.003G255850 - -
9 Sobic.007G149750 - -
10 Sobic.002G322101 - -
11 Sobic.003G290050 - -
12 Sobic.001G249900 - -
13 Sobic.003G169400 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03046: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
14 Sobic.008G157700 BURP domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G005550 - -
16 Sobic.009G069450 - -
17 Sobic.006G093550 - -
18 Sobic.002G149966 - -
19 Sobic.008G035633 - -
20 Sobic.001G365332 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic005G093600--Sobic003G128575 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic005G093600--Sobic010G173600 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic005G093600--Sobic006G017266 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic005G093600--Sobic006G020350 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic005G093600--Sobic005G183450 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic005G093600--Sobic006G147350 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic005G093600--Sobic006G124850 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic005G093600--Sobic003G255850 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic005G093600--Sobic007G149750 Sobic003G128575--Sobic006G017266 Sobic003G128575--Sobic005G183450 Sobic003G128575--Sobic006G020350 Sobic003G128575--Sobic005G093600 Sobic003G128575--Sobic010G173600 Sobic003G128575--Sobic006G124850 Sobic003G128575--Sobic006G147350 Sobic003G128575--Sobic003G255850 Sobic003G128575--Sobic007G149750 Sobic010G173600--Sobic005G093600 Sobic010G173600--Sobic003G128575 Sobic010G173600--Sobic006G147350 Sobic010G173600--Sobic006G017266 Sobic010G173600--Sobic006G020350 Sobic010G173600--Sobic003G255850 Sobic010G173600--Sobic007G149750 Sobic010G173600--Sobic005G183450 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic010G173600--Sobic002G322101 Sobic006G017266--Sobic003G128575 Sobic006G017266--Sobic005G183450 Sobic006G017266--Sobic006G020350 Sobic006G017266--Sobic005G093600 Sobic006G017266--Sobic010G173600 Sobic006G017266--Sobic006G124850 Sobic006G017266--Sobic006G147350 Sobic006G017266--Sobic003G255850 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic006G017266--Sobic001G365332 Sobic006G020350--Sobic003G128575 Sobic006G020350--Sobic006G017266 Sobic006G020350--Sobic005G183450 Sobic006G020350--Sobic005G093600 Sobic006G020350--Sobic010G173600 Sobic006G020350--Sobic006G124850 Sobic006G020350--Sobic006G147350 Sobic006G020350--Sobic003G255850 Sobic006G020350--Sobic001G365332 Sobic005G183450--Sobic003G128575 Sobic005G183450--Sobic006G017266 Sobic005G183450--Sobic006G020350 Sobic005G183450--Sobic005G093600 Sobic005G183450--Sobic010G173600 Sobic005G183450--Sobic006G124850 Sobic005G183450--Sobic006G147350 Sobic005G183450--Sobic001G365332 Sobic006G005550 Sobic006G005550 Sobic005G183450--Sobic006G005550 Sobic006G147350--Sobic010G173600 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic006G147350--Sobic001G249900 Sobic006G147350--Sobic003G255850 Sobic006G147350--Sobic005G093600 Sobic006G147350--Sobic003G128575 Sobic006G147350--Sobic002G322101 Sobic006G147350--Sobic007G149750 Sobic006G147350--Sobic006G017266 Sobic006G147350--Sobic006G020350 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic006G124850--Sobic002G149966 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic006G124850--Sobic003G290050 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic006G124850--Sobic003G169400 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic006G124850--Sobic002G044500 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic006G124850--Sobic002G150032 Sobic006G124850--Sobic003G128575 Sobic006G124850--Sobic006G017266 Sobic006G124850--Sobic005G093600 Sobic006G124850--Sobic010G173600 Sobic003G255850--Sobic010G173600 Sobic003G255850--Sobic006G147350 Sobic003G255850--Sobic002G322101 Sobic003G255850--Sobic005G093600 Sobic003G255850--Sobic007G149750 Sobic003G255850--Sobic003G128575 Sobic003G255850--Sobic006G017266 Sobic003G255850--Sobic006G020350 Sobic003G255850--Sobic001G249900 Sobic007G149750--Sobic002G322101 Sobic007G149750--Sobic010G173600 Sobic007G149750--Sobic006G147350 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic007G149750--Sobic006G093550 Sobic007G149750--Sobic003G255850 Sobic007G149750--Sobic001G249900 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic007G149750--Sobic004G234766 Sobic007G149750--Sobic005G093600 Sobic007G149750--Sobic003G128575
Octagon: transcription factors


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