Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G157700.1
Synonym RD22, Sb08g020660, ATRD22
Functional annotation BURP domain containing protein, expressed
UniProt C5YRE9
Pfam PF03181
Panther DB PTHR31236 PTHR31236:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G25610 : BURP domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g38810.1 : BURP domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G157700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G124850 - K02948: RP-S11, MRPS11, small subunit ribosomal protein S11
2 Sobic.003G168350 - -
3 Sobic.003G128575 - -
4 Sobic.006G017266 - -
5 Sobic.002G014900 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G183450 - -
7 Sobic.006G020350 - -
8 Sobic.001G293900 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
9 Sobic.002G150032 - -
10 Sobic.005G093600 protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.009G069450 - -
12 Sobic.006G005550 - -
13 Sobic.002G149966 - -
14 Sobic.003G290050 - -
15 Sobic.001G365332 - -
16 Sobic.010G173600 cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed K00279: cytokinin dehydrogenase
17 Sobic.006G078450 - -
18 Sobic.003G169400 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03046: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
19 Sobic.002G044500 chloroplast 30S ribosomal protein S16, putative, expressed K02959: RP-S16, MRPS16, small subunit ribosomal protein S16
20 Sobic.003G119750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic008G157700--Sobic006G124850 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic008G157700--Sobic003G168350 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic008G157700--Sobic003G128575 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic008G157700--Sobic006G017266 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic008G157700--Sobic002G014900 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic008G157700--Sobic005G183450 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic008G157700--Sobic006G020350 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic008G157700--Sobic001G293900 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic008G157700--Sobic002G150032 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic006G124850--Sobic002G149966 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic006G124850--Sobic003G290050 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic006G124850--Sobic003G169400 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic006G124850--Sobic002G044500 Sobic006G124850--Sobic002G150032 Sobic006G124850--Sobic003G128575 Sobic006G124850--Sobic006G017266 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic006G124850--Sobic005G093600 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic006G124850--Sobic010G173600 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic003G168350--Sobic004G198701 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic003G168350--Sobic001G365332 Sobic006G005550 Sobic006G005550 Sobic003G168350--Sobic006G005550 Sobic003G200400 Sobic003G200400 Sobic003G168350--Sobic003G200400 Sobic005G008400 Sobic005G008400 Sobic003G168350--Sobic005G008400 Sobic002G174000 Sobic002G174000 Sobic003G168350--Sobic002G174000 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic003G168350--Sobic004G346700 Sobic003G168350--Sobic008G157700 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic003G168350--Sobic001G195550 Sobic003G128575--Sobic006G017266 Sobic003G128575--Sobic005G183450 Sobic003G128575--Sobic006G020350 Sobic003G128575--Sobic005G093600 Sobic003G128575--Sobic010G173600 Sobic003G128575--Sobic006G124850 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic003G128575--Sobic006G147350 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic003G128575--Sobic003G255850 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic003G128575--Sobic007G149750 Sobic006G017266--Sobic003G128575 Sobic006G017266--Sobic005G183450 Sobic006G017266--Sobic006G020350 Sobic006G017266--Sobic005G093600 Sobic006G017266--Sobic010G173600 Sobic006G017266--Sobic006G124850 Sobic006G017266--Sobic006G147350 Sobic006G017266--Sobic003G255850 Sobic006G017266--Sobic001G365332 Sobic002G014900--Sobic002G150032 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic002G014900--Sobic001G266000 Sobic002G014900--Sobic002G149966 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic002G014900--Sobic003G172900 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic002G014900--Sobic003G172850 Sobic002G014900--Sobic002G044500 Sobic002G014900--Sobic006G124850 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic002G014900--Sobic004G251400 Sobic002G014900--Sobic003G290050 Sobic005G183450--Sobic003G128575 Sobic005G183450--Sobic006G017266 Sobic005G183450--Sobic006G020350 Sobic005G183450--Sobic005G093600 Sobic005G183450--Sobic010G173600 Sobic005G183450--Sobic006G124850 Sobic005G183450--Sobic006G147350 Sobic005G183450--Sobic001G365332 Sobic005G183450--Sobic006G005550 Sobic006G020350--Sobic003G128575 Sobic006G020350--Sobic006G017266 Sobic006G020350--Sobic005G183450 Sobic006G020350--Sobic005G093600 Sobic006G020350--Sobic010G173600 Sobic006G020350--Sobic006G124850 Sobic006G020350--Sobic006G147350 Sobic006G020350--Sobic003G255850 Sobic006G020350--Sobic001G365332 Sobic003G119750 Sobic003G119750 Sobic001G293900--Sobic003G119750 Sobic010G132200 Sobic010G132200 Sobic001G293900--Sobic010G132200 Sobic001G293900--Sobic003G169400 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic001G293900--Sobic003G168800 Sobic001G293900--Sobic003G172850 Sobic003G423400 Sobic003G423400 Sobic001G293900--Sobic003G423400 Sobic001G293900--Sobic006G124850 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic001G293900--Sobic006G192600 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic001G293900--Sobic003G168500 Sobic002G150032--Sobic002G149966 Sobic002G150032--Sobic002G014900 Sobic002G150032--Sobic001G266000 Sobic002G150032--Sobic003G172900 Sobic002G150032--Sobic002G044500 Sobic002G150032--Sobic003G172850 Sobic002G150032--Sobic003G290050 Sobic002G150032--Sobic006G124850 Sobic002G150032--Sobic004G251400
Octagon: transcription factors


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