Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G290050.2,Sobic.003G290050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VZF8 , A0A1W0VZC4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G124850 - K02948: RP-S11, MRPS11, small subunit ribosomal protein S11
2 Sobic.002G149966 - -
3 Sobic.002G150032 - -
4 Sobic.002G044500 chloroplast 30S ribosomal protein S16, putative, expressed K02959: RP-S16, MRPS16, small subunit ribosomal protein S16
5 Sobic.001G266000 OsClp10 - Putative Clp protease homologue, expressed -
6 Sobic.003G169400 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03046: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
7 Sobic.002G014900 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G168500 chloroplast 50S ribosomal protein L20, putative, expressed K02887: RP-L20, MRPL20, large subunit ribosomal protein L20
9 Sobic.003G172850 - K03043: DNA-directed RNA polymerase subunit beta
10 Sobic.003G172900 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed K05581: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J
11 Sobic.003G128575 - -
12 Sobic.006G017266 - -
13 Sobic.005G183450 - -
14 Sobic.007G201200 thaumatin, putative, expressed -
15 Sobic.005G093600 protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G020350 - -
17 Sobic.010G254000 cycloartenol synthase, putative, expressed K19011: achilleol B synthase
18 Sobic.010G173600 cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed K00279: cytokinin dehydrogenase
19 Sobic.006G147350 - -
20 Sobic.004G337600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic003G290050--Sobic006G124850 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic003G290050--Sobic002G149966 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic003G290050--Sobic002G150032 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic003G290050--Sobic002G044500 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic003G290050--Sobic001G266000 Sobic003G169400 Sobic003G169400 Sobic003G290050--Sobic003G169400 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic003G290050--Sobic002G014900 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic003G290050--Sobic003G168500 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic003G290050--Sobic003G172850 Sobic006G124850--Sobic002G149966 Sobic006G124850--Sobic003G290050 Sobic006G124850--Sobic003G169400 Sobic006G124850--Sobic002G044500 Sobic006G124850--Sobic002G150032 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic006G124850--Sobic003G128575 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic006G124850--Sobic006G017266 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic006G124850--Sobic005G093600 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic006G124850--Sobic010G173600 Sobic002G149966--Sobic002G150032 Sobic002G149966--Sobic002G044500 Sobic002G149966--Sobic006G124850 Sobic002G149966--Sobic001G266000 Sobic002G149966--Sobic003G290050 Sobic002G149966--Sobic002G014900 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic002G149966--Sobic003G172900 Sobic002G149966--Sobic003G168500 Sobic002G149966--Sobic003G172850 Sobic002G150032--Sobic002G149966 Sobic002G150032--Sobic002G014900 Sobic002G150032--Sobic001G266000 Sobic002G150032--Sobic003G172900 Sobic002G150032--Sobic002G044500 Sobic002G150032--Sobic003G172850 Sobic002G150032--Sobic003G290050 Sobic002G150032--Sobic006G124850 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic002G150032--Sobic004G251400 Sobic002G044500--Sobic003G168500 Sobic002G044500--Sobic002G149966 Sobic002G044500--Sobic003G169400 Sobic002G044500--Sobic002G150032 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic002G044500--Sobic004G337600 Sobic002G044500--Sobic003G172850 Sobic002G044500--Sobic003G172900 Sobic002G044500--Sobic006G124850 Sobic002G044500--Sobic001G266000 Sobic001G266000--Sobic002G150032 Sobic001G266000--Sobic003G172900 Sobic001G266000--Sobic002G149966 Sobic001G266000--Sobic003G172850 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic001G266000--Sobic003G173266 Sobic001G266000--Sobic002G014900 Sobic001G266000--Sobic002G044500 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic001G266000--Sobic002G222000 Sobic006G123800 Sobic006G123800 Sobic001G266000--Sobic006G123800 Sobic003G169400--Sobic003G168500 Sobic003G169400--Sobic002G044500 Sobic010G107601 Sobic010G107601 Sobic003G169400--Sobic010G107601 Sobic003G169400--Sobic006G124850 Sobic007G201200 Sobic007G201200 Sobic003G169400--Sobic007G201200 Sobic005G096500 Sobic005G096500 Sobic003G169400--Sobic005G096500 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic003G169400--Sobic003G172400 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic003G169400--Sobic005G167100 Sobic003G169400--Sobic002G149966 Sobic002G014900--Sobic002G150032 Sobic002G014900--Sobic001G266000 Sobic002G014900--Sobic002G149966 Sobic002G014900--Sobic003G172900 Sobic002G014900--Sobic003G172850 Sobic002G014900--Sobic002G044500 Sobic002G014900--Sobic006G124850 Sobic002G014900--Sobic004G251400 Sobic002G014900--Sobic003G290050 Sobic003G168500--Sobic002G044500 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic003G168500--Sobic003G171900 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic003G168500--Sobic008G160300 Sobic003G168500--Sobic003G172850 Sobic003G168500--Sobic003G169400 Sobic003G168500--Sobic004G337600 Sobic003G168500--Sobic003G172400 Sobic003G168500--Sobic010G107601 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic003G168500--Sobic003G169300 Sobic003G172850--Sobic003G168500 Sobic003G172850--Sobic001G266000 Sobic003G172850--Sobic003G173266 Sobic003G172850--Sobic002G044500 Sobic003G172850--Sobic003G172900 Sobic003G172850--Sobic002G150032 Sobic003G172850--Sobic003G169300 Sobic003G168800 Sobic003G168800 Sobic003G172850--Sobic003G168800 Sobic003G172850--Sobic004G251400
Octagon: transcription factors


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