Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G168350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A109NDB2 , A0A1W0VXL9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g21218.1 : conserved hypothetical protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010038 , Zm00025a057594 , Zm00025a057623 , Zm00025a057701 , Zm00025a058077 , Zm00025a057879 , Zm00025a057938
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G198701 - -
2 Sobic.001G365332 - -
3 Sobic.006G005550 - -
4 Sobic.003G200400 histone deacetylase 19, putative, expressed K06067: histone deacetylase 1/2
5 Sobic.005G008400 pentatricopeptide, putative, expressed -
6 Sobic.002G174000 pleiotropic drug resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G346700 expressed protein -
8 Sobic.008G157700 BURP domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G195550 - -
10 Sobic.006G078450 - -
11 Sobic.005G183450 - -
12 Sobic.001G515400 AMP-binding enzyme, putative, expressed -
13 Sobic.001G260900 - -
14 Sobic.006G020350 - -
15 Sobic.008G139100 MLA12, putative, expressed -
16 Sobic.002G288800 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
17 Sobic.006G017266 - -
18 Sobic.003G128575 - -
19 Sobic.002G014900 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G134301 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic003G168350--Sobic004G198701 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic003G168350--Sobic001G365332 Sobic006G005550 Sobic006G005550 Sobic003G168350--Sobic006G005550 Sobic003G200400 Sobic003G200400 Sobic003G168350--Sobic003G200400 Sobic005G008400 Sobic005G008400 Sobic003G168350--Sobic005G008400 Sobic002G174000 Sobic002G174000 Sobic003G168350--Sobic002G174000 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic003G168350--Sobic004G346700 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic003G168350--Sobic008G157700 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic003G168350--Sobic001G195550 Sobic004G198701--Sobic003G168350 Sobic004G198701--Sobic003G200400 Sobic004G198701--Sobic002G174000 Sobic001G260900 Sobic001G260900 Sobic004G198701--Sobic001G260900 Sobic005G134301 Sobic005G134301 Sobic004G198701--Sobic005G134301 Sobic004G198701--Sobic001G365332 Sobic004G198701--Sobic004G346700 Sobic004G198701--Sobic005G008400 Sobic007G115050 Sobic007G115050 Sobic004G198701--Sobic007G115050 Sobic001G365332--Sobic003G168350 Sobic006G078450 Sobic006G078450 Sobic001G365332--Sobic006G078450 Sobic001G365332--Sobic006G005550 Sobic001G365332--Sobic004G346700 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic001G365332--Sobic005G183450 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic001G365332--Sobic006G017266 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic001G365332--Sobic006G020350 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic001G365332--Sobic003G128575 Sobic001G365332--Sobic005G008400 Sobic006G005550--Sobic003G168350 Sobic006G005550--Sobic001G365332 Sobic006G005550--Sobic005G183450 Sobic006G005550--Sobic006G020350 Sobic006G005550--Sobic003G128575 Sobic006G005550--Sobic006G017266 Sobic006G005550--Sobic008G157700 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic006G005550--Sobic005G093600 Sobic006G005550--Sobic004G198701 Sobic003G200400--Sobic004G198701 Sobic003G200400--Sobic003G168350 Sobic003G200400--Sobic001G365332 Sobic003G200400--Sobic002G174000 Sobic003G200400--Sobic005G008400 Sobic003G200400--Sobic001G260900 Sobic003G200400--Sobic008G157700 Sobic003G200400--Sobic006G005550 Sobic003G200400--Sobic004G346700 Sobic005G008400--Sobic004G346700 Sobic005G008400--Sobic003G168350 Sobic005G008400--Sobic001G365332 Sobic008G139100 Sobic008G139100 Sobic005G008400--Sobic008G139100 Sobic005G008400--Sobic004G198701 Sobic005G008400--Sobic002G174000 Sobic005G008400--Sobic001G195550 Sobic001G045500 Sobic001G045500 Sobic005G008400--Sobic001G045500 Sobic005G008400--Sobic006G005550 Sobic002G174000--Sobic001G260900 Sobic002G174000--Sobic004G346700 Sobic002G174000--Sobic007G115050 Sobic002G174000--Sobic001G195550 Sobic002G288800 Sobic002G288800 Sobic002G174000--Sobic002G288800 Sobic002G174000--Sobic008G139100 Sobic002G174000--Sobic005G134301 Sobic002G174000--Sobic004G198701 Sobic002G174000--Sobic003G168350 Sobic004G346700--Sobic001G195550 Sobic004G346700--Sobic002G174000 Sobic004G346700--Sobic001G365332 Sobic004G346700--Sobic007G115050 Sobic004G346700--Sobic005G008400 Sobic004G346700--Sobic008G139100 Sobic004G346700--Sobic001G260900 Sobic004G346700--Sobic003G168350 Sobic004G346700--Sobic004G198701 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic008G157700--Sobic006G124850 Sobic008G157700--Sobic003G168350 Sobic008G157700--Sobic003G128575 Sobic008G157700--Sobic006G017266 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic008G157700--Sobic002G014900 Sobic008G157700--Sobic005G183450 Sobic008G157700--Sobic006G020350 Sobic001G293900 Sobic001G293900 Sobic008G157700--Sobic001G293900 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic008G157700--Sobic002G150032 Sobic001G195550--Sobic004G346700 Sobic001G195550--Sobic002G174000 Sobic001G417100 Sobic001G417100 Sobic001G195550--Sobic001G417100 Sobic001G195550--Sobic001G365332 Sobic001G195550--Sobic007G115050 Sobic001G195550--Sobic008G139100 Sobic001G195550--Sobic001G260900 Sobic001G195550--Sobic003G168350 Sobic004G346800 Sobic004G346800 Sobic001G195550--Sobic004G346800
Octagon: transcription factors


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