Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G195550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S6T5
Pfam PF03101 PF10551
Panther DB PTHR31669 PTHR31669:SF61
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G38180 : FAR1-related sequence 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g20486.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G346700 expressed protein -
2 Sobic.002G174000 pleiotropic drug resistance protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G417100 - -
4 Sobic.001G365332 - -
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11 Sobic.001G071250 - -
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14 Sobic.007G135301 - -
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16 Sobic.005G134301 - -
17 Sobic.006G078450 - -
18 Sobic.006G005550 - -
19 Sobic.001G045500 RD26, putative, expressed -
20 Sobic.007G223150 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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