Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G365332.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S9G7
Pfam PF14291
Panther DB PTHR11697 PTHR11697:SF106
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G19260 : TTF-type zinc finger protein with HAT dimerisation domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g08610.1 : hAT dimerisation domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G168350 - -
2 Sobic.006G078450 - -
3 Sobic.006G005550 - -
4 Sobic.004G346700 expressed protein -
5 Sobic.005G183450 - -
6 Sobic.006G017266 - -
7 Sobic.006G020350 - -
8 Sobic.003G128575 - -
9 Sobic.005G008400 pentatricopeptide, putative, expressed -
10 Sobic.001G195550 - -
11 Sobic.004G198701 - -
12 Sobic.002G174000 pleiotropic drug resistance protein, putative, expressed -
13 Sobic.008G157700 BURP domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G093600 protein kinase domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.003G079725 - -
16 Sobic.002G394433 - -
17 Sobic.006G124850 - K02948: RP-S11, MRPS11, small subunit ribosomal protein S11
18 Sobic.003G200400 histone deacetylase 19, putative, expressed K06067: histone deacetylase 1/2
19 Sobic.008G139100 MLA12, putative, expressed -
20 Sobic.002G288800 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic001G365332--Sobic003G168350 Sobic006G078450 Sobic006G078450 Sobic001G365332--Sobic006G078450 Sobic006G005550 Sobic006G005550 Sobic001G365332--Sobic006G005550 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic001G365332--Sobic004G346700 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic001G365332--Sobic005G183450 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic001G365332--Sobic006G017266 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic001G365332--Sobic006G020350 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic001G365332--Sobic003G128575 Sobic005G008400 Sobic005G008400 Sobic001G365332--Sobic005G008400 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic003G168350--Sobic004G198701 Sobic003G168350--Sobic001G365332 Sobic003G168350--Sobic006G005550 Sobic003G200400 Sobic003G200400 Sobic003G168350--Sobic003G200400 Sobic003G168350--Sobic005G008400 Sobic002G174000 Sobic002G174000 Sobic003G168350--Sobic002G174000 Sobic003G168350--Sobic004G346700 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic003G168350--Sobic008G157700 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic003G168350--Sobic001G195550 Sobic006G078450--Sobic001G365332 Sobic006G078450--Sobic006G017266 Sobic003G079725 Sobic003G079725 Sobic006G078450--Sobic003G079725 Sobic006G078450--Sobic005G183450 Sobic006G078450--Sobic004G346700 Sobic006G078450--Sobic006G020350 Sobic006G078450--Sobic003G128575 Sobic006G078450--Sobic006G005550 Sobic006G078450--Sobic003G168350 Sobic006G005550--Sobic003G168350 Sobic006G005550--Sobic001G365332 Sobic006G005550--Sobic005G183450 Sobic006G005550--Sobic006G020350 Sobic006G005550--Sobic003G128575 Sobic006G005550--Sobic006G017266 Sobic006G005550--Sobic008G157700 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic006G005550--Sobic005G093600 Sobic006G005550--Sobic004G198701 Sobic004G346700--Sobic001G195550 Sobic004G346700--Sobic002G174000 Sobic004G346700--Sobic001G365332 Sobic007G115050 Sobic007G115050 Sobic004G346700--Sobic007G115050 Sobic004G346700--Sobic005G008400 Sobic008G139100 Sobic008G139100 Sobic004G346700--Sobic008G139100 Sobic001G260900 Sobic001G260900 Sobic004G346700--Sobic001G260900 Sobic004G346700--Sobic003G168350 Sobic004G346700--Sobic004G198701 Sobic005G183450--Sobic003G128575 Sobic005G183450--Sobic006G017266 Sobic005G183450--Sobic006G020350 Sobic005G183450--Sobic005G093600 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic005G183450--Sobic010G173600 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic005G183450--Sobic006G124850 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic005G183450--Sobic006G147350 Sobic005G183450--Sobic001G365332 Sobic005G183450--Sobic006G005550 Sobic006G017266--Sobic003G128575 Sobic006G017266--Sobic005G183450 Sobic006G017266--Sobic006G020350 Sobic006G017266--Sobic005G093600 Sobic006G017266--Sobic010G173600 Sobic006G017266--Sobic006G124850 Sobic006G017266--Sobic006G147350 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic006G017266--Sobic003G255850 Sobic006G017266--Sobic001G365332 Sobic006G020350--Sobic003G128575 Sobic006G020350--Sobic006G017266 Sobic006G020350--Sobic005G183450 Sobic006G020350--Sobic005G093600 Sobic006G020350--Sobic010G173600 Sobic006G020350--Sobic006G124850 Sobic006G020350--Sobic006G147350 Sobic006G020350--Sobic003G255850 Sobic006G020350--Sobic001G365332 Sobic003G128575--Sobic006G017266 Sobic003G128575--Sobic005G183450 Sobic003G128575--Sobic006G020350 Sobic003G128575--Sobic005G093600 Sobic003G128575--Sobic010G173600 Sobic003G128575--Sobic006G124850 Sobic003G128575--Sobic006G147350 Sobic003G128575--Sobic003G255850 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic003G128575--Sobic007G149750 Sobic005G008400--Sobic004G346700 Sobic005G008400--Sobic003G168350 Sobic005G008400--Sobic001G365332 Sobic005G008400--Sobic008G139100 Sobic005G008400--Sobic004G198701 Sobic005G008400--Sobic002G174000 Sobic005G008400--Sobic001G195550 Sobic001G045500 Sobic001G045500 Sobic005G008400--Sobic001G045500 Sobic005G008400--Sobic006G005550
Octagon: transcription factors


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