Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G008400.2
Synonym Sb05g000785
Functional annotation pentatricopeptide, putative, expressed
UniProt C5Y326
Pfam PF13041 PF01535 PF14432
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF891
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G08820 : Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g01836.1 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042168
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G047250.3 , HORVU5Hr1G047250.2 , HORVU5Hr1G047250.4
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G008400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic005G008400 Sobic005G008400 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic005G008400--Sobic004G346700 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic005G008400--Sobic003G168350 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic005G008400--Sobic001G365332 Sobic008G139100 Sobic008G139100 Sobic005G008400--Sobic008G139100 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic005G008400--Sobic004G198701 Sobic002G174000 Sobic002G174000 Sobic005G008400--Sobic002G174000 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic005G008400--Sobic001G195550 Sobic001G045500 Sobic001G045500 Sobic005G008400--Sobic001G045500 Sobic006G005550 Sobic006G005550 Sobic005G008400--Sobic006G005550 Sobic004G346700--Sobic001G195550 Sobic004G346700--Sobic002G174000 Sobic004G346700--Sobic001G365332 Sobic007G115050 Sobic007G115050 Sobic004G346700--Sobic007G115050 Sobic004G346700--Sobic005G008400 Sobic004G346700--Sobic008G139100 Sobic001G260900 Sobic001G260900 Sobic004G346700--Sobic001G260900 Sobic004G346700--Sobic003G168350 Sobic004G346700--Sobic004G198701 Sobic003G168350--Sobic004G198701 Sobic003G168350--Sobic001G365332 Sobic003G168350--Sobic006G005550 Sobic003G200400 Sobic003G200400 Sobic003G168350--Sobic003G200400 Sobic003G168350--Sobic005G008400 Sobic003G168350--Sobic002G174000 Sobic003G168350--Sobic004G346700 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic003G168350--Sobic008G157700 Sobic003G168350--Sobic001G195550 Sobic001G365332--Sobic003G168350 Sobic006G078450 Sobic006G078450 Sobic001G365332--Sobic006G078450 Sobic001G365332--Sobic006G005550 Sobic001G365332--Sobic004G346700 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic001G365332--Sobic005G183450 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic001G365332--Sobic006G017266 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic001G365332--Sobic006G020350 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic001G365332--Sobic003G128575 Sobic001G365332--Sobic005G008400 Sobic008G139100--Sobic002G174000 Sobic008G139100--Sobic004G346700 Sobic008G139100--Sobic001G260900 Sobic002G288800 Sobic002G288800 Sobic008G139100--Sobic002G288800 Sobic008G139100--Sobic007G115050 Sobic008G139100--Sobic005G008400 Sobic008G139100--Sobic001G195550 Sobic008G139100--Sobic001G045500 Sobic008G139100--Sobic004G198701 Sobic004G198701--Sobic003G168350 Sobic004G198701--Sobic003G200400 Sobic004G198701--Sobic002G174000 Sobic004G198701--Sobic001G260900 Sobic005G134301 Sobic005G134301 Sobic004G198701--Sobic005G134301 Sobic004G198701--Sobic001G365332 Sobic004G198701--Sobic004G346700 Sobic004G198701--Sobic005G008400 Sobic004G198701--Sobic007G115050 Sobic002G174000--Sobic001G260900 Sobic002G174000--Sobic004G346700 Sobic002G174000--Sobic007G115050 Sobic002G174000--Sobic001G195550 Sobic002G174000--Sobic002G288800 Sobic002G174000--Sobic008G139100 Sobic002G174000--Sobic005G134301 Sobic002G174000--Sobic004G198701 Sobic002G174000--Sobic003G168350 Sobic001G195550--Sobic004G346700 Sobic001G195550--Sobic002G174000 Sobic001G417100 Sobic001G417100 Sobic001G195550--Sobic001G417100 Sobic001G195550--Sobic001G365332 Sobic001G195550--Sobic007G115050 Sobic001G195550--Sobic008G139100 Sobic001G195550--Sobic001G260900 Sobic001G195550--Sobic003G168350 Sobic004G346800 Sobic004G346800 Sobic001G195550--Sobic004G346800 Sobic001G045500--Sobic008G139100 Sobic001G045500--Sobic005G008400 Sobic001G045500--Sobic004G346800 Sobic001G045500--Sobic004G346700 Sobic001G045500--Sobic001G195550 Sobic001G045500--Sobic002G174000 Sobic001G045500--Sobic003G168350 Sobic001G071250 Sobic001G071250 Sobic001G045500--Sobic001G071250 Sobic001G045500--Sobic004G198701 Sobic006G005550--Sobic003G168350 Sobic006G005550--Sobic001G365332 Sobic006G005550--Sobic005G183450 Sobic006G005550--Sobic006G020350 Sobic006G005550--Sobic003G128575 Sobic006G005550--Sobic006G017266 Sobic006G005550--Sobic008G157700 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic006G005550--Sobic005G093600 Sobic006G005550--Sobic004G198701
Octagon: transcription factors


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